規方法。所用試劑的來源、 商品名,均在首次出現時標明,其后所用相同試劑如無特殊說明,均與首次標明的相同。本 發明實施例中涉及的由發明人保存的生物材料,均可向公眾提供20年。
[0023] 實施例1:營養多肽/7/基因的克隆、測序及鑒定 通過PCR的方法從公司購買的合成DNA片段(上海生工)中擴增獲得營養多肽NP的基 因。
[0024] 營養多肽/7/基因片段的PCR擴增引物為: Np-F:GGGGTACCCCGACGATGACGATAAGCTGAAGGTGACCATCAAGAC Np-R:CGGAATTCCGTCACTTGTCGTCATCGTCTTTGTAGr(XTTGGTCACCAGCAGGATCAC PCR反應體系按7???L4hi/使用說明書嚴格進行,20yL反應體系中含7???L4 7^ 0· 2μL,10XLAPCRBufferII(Mg2+Plus) 2μL,dNTPMixture(各 2. 5mM) 3. 2μL, 模板DNA100ng,上下游引物(20μM)各0.4μL,最后加滅菌超純水補齊到20μL。PCR條件 為:94°C變性 5min,94°Clmin,56°C40s,72°C40s,30 個循環。PCR產物大小為 180bp,包 括營養多肽λ/?基因的編碼序列。擴增片段按TaKaRapMD18_TSimpleVector(TaKaRa,寶 生物工程(大連)有限公司)說明書的方法,克隆于PMD18-T載體中,轉化大腸桿菌DH5α,篩 選克隆菌株,提取質粒,通過PCR及及wl和及雙酶切,瓊脂糖凝膠電泳鑒定陽性克隆, 并對重組質粒進行測序,克隆片段的測序由百奧邁科(Biomics)生物技術有限公司完成。 克隆的重組質粒命名為PMD18-T-NP,重組子菌株命名為DH5a/PMD18-T-NP。陽性重組菌株 保存在含有15%甘油的LB培養基中,凍存于-80 °C。
[0025] 實施例2 :以CotC為載體表面展示NP的枯草芽孢桿菌重組芽孢的制備與應用 1.重組整合型質粒PJS700-NP的構建 質粒pJS700(李倩.以CotX為分子載體表面展示WSSV囊膜蛋白Vpl9和Vp28的枯草 芽孢桿菌重組芽孢的研究[D].江蘇鎮江:江蘇大學,2010:36-38)由江蘇大學環境學院寧 德剛副教授惠贈,該質粒大小約為5. 5kb。在pJS700質粒中,awjf5'_end和awjf3'_end 分別表示淀粉酶基因(GeneBank序列號:NP_388186)編碼序列的5'端和3'端,通過 同源重組整合在168 (?τρ)染色體的淀粉酶基因中。辦別表 示氨節青霉素抗性基因和紅霉素抗性基因,在大腸桿菌和SaciWiAs· 168 (?τρ) 中作為篩選標記。Enterokinase表示腸激酶消化的標簽位點Asp-Asp-Asp-Asp-Lys。coiC為枯草芽孢桿菌芽孢衣殼蛋白CotC基因,該基因片段含有coii基因(GeneBank序列號: NP_389653)的啟動子序列、不含有coii終止密碼子的CotC編碼序列;oriC為大腸桿菌復 制子片段。
[0026] 分別用及wl和及酶切質粒PMD18-T-NP和pJS-700,用瓊脂糖凝膠回收試劑盒 回收耶片段和pJS-700,用T4DNAligase連接兩雙酶切后純化好的片段,連接產物轉化大 腸桿菌DH5α感受態細胞,轉化物涂布于含有50μg/mL氨芐青霉素的LB平板中37°C培養 過夜,次日挑選陽性單克隆菌株于含有50μg/mL氨芐青霉素的LB液體培養基中,37°C培養 12至16h,提取質粒,通過PCR及及wl和及^I雙酶切,瓊脂糖凝膠電泳鑒定陽性克隆,鑒 定正確后將重組整合型質粒命名為PJS700-NP,陽性重組菌株命名為DH5a/PJS700-NP。該 重組整合型質粒PJS700-NP中含有腸激酶標簽的重組基因該質粒的構建過程及 其圖譜見圖2。
[0027] 2.融合表達重組芽孢的枯草芽孢桿菌菌株的篩選與鑒定 將整合型重組質粒PJS700-NP轉化ifeciUiA? 168 (?τρ)(Bacillus GeneticStockCenter,DepartmentofBiochemistry,TheOhioStateUniversity,West12thAvenue,Columbus,Ohio, 43210,USA),用含有 0.4μg/mL紅霉素(購自SIGMA 公司)的LB平板篩選重組子,從平板上挑選單菌落接種于含1%淀粉的LB平板中,37°C過夜 培養,次日用碘-碘化鉀溶液對淀粉平板染色來鑒定重組菌株。
[0028] 1%淀粉平板的制備方法:100mL LB固體培養基中加可溶性淀粉0.lg,高壓蒸汽滅 菌后倒制平板。
[0029] 碘-碘化鉀溶液的配制:碘化鉀2g,碘lg,蒸餾水300mL,先將碘化鉀溶于少量去 離子水中,待全部溶解后再加入碘,振蕩溶解后稀釋至300mL,避光保存在棕色玻璃瓶中,用 時可稀釋2~10倍。
[0030] 取適量碘-碘化鉀溶液滴于淀粉平板上,菌落周圍產生透明圈表明重組基因沒有 插入淀粉酶基因中,菌落及其周圍顏色變藍表明重組基因成功的插入到了你ciWM 168(?τρ)染色體上的淀粉酶基因中,因而導致淀粉酶基因必沒有活 性,見圖3。
[0031] 為了進一步證明重組菌株中淀粉酶基因的失活是由于及的插入所致, 分別以amyE-F/amyE-R、np_F/np-R、amyE_F/np-R、np-F/amyE_R為引物對,以枯草芽孢桿 菌的染色體為模板,PCR擴增鑒定重組菌株中是否含有Ai-co忙基因片段。Ai-co忙-耶 片段在168 (?τρ)染色體中的整合示意圖見圖4。PCR反應體系按 7???L4 使用說明書嚴格進行,20yL反應體系中含7???L4 7^ 0. 2yL,10XLA PCRBufferII(Mg2+Plus) 2yL,dNTPMixture(各 2.5mM)3.2yL,模板DNA100ng,上下 游引物(20μM)各0. 4μL,最后加滅菌超純水補齊到20μL。PCR反應條件根據各個引物對 的特征分別設置。在重組菌株中分別檢測到約180bp、730bp、3000bp,而野生型菌株中只檢 測到約1. 1kp的淀粉酶基因,鑒定結果見圖5。這表明重組菌株染色體上含有 重組基因,并且運:組片段成功的插入到了淀粉酶基因中。將鑒定后的重組菌 株命名為 168 (irp)/pJS700-NP〇
[0032] 枯草芽孢桿菌染色體的提取方法為:挑單菌落接于LB加相應抗生素的培養基中, 在37 °C搖床中培養至0D6。。為1. 0~2· 0。取1. 5mL菌液于Eppendorf管中,8000rpm離心 10min,棄上清,加 100μLpH8. 0 的TE緩沖液(10mMTris-HCl,1mMEDTA)洗沉淀,離心 去上清,再加100μLTE懸浮沉淀;向懸浮液中加30μL100mg/ml溶菌酶溶液,不要搖晃, 在37°C培養箱中放lh,加50μL10%SDS和20μL20mg/mL蛋白酶K,37°C繼續培養lh;補 TE至300μL,分別加150μL苯酚和氯仿抽提,12000rpm離心10min,取上清;再加300μ1 氯仿,12000rpm離心5min,取上清,加1/4體積5Μ的NaCl,2倍體積的無水乙醇,室溫下沉 淀DNA2h,12000rpm離心10min,收集沉淀,用500μL70%的乙醇洗沉淀,待揮發干后,加 10μLΤΕ緩沖液溶解沉淀,取1μL用瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA濃度,剩余的可放于-20°C 中保存備用。
[0033] 3.表面展示營養多肽重組芽孢的誘導及鑒定 用DSM培養基誘導重組菌株你ciWM仰168 (?ιρ)/ρΡ700-ΝΡ形成芽孢。DSM培養基的配方為:〇· 8%nutrientbroth(營養肉湯Difo),0. 1%KC1,0. 025%MgS04 · 7Η20, l.OmMCa(N03)2.4H20,l(^MΜη(:12,1·〇μΜFeS04。將野生型菌株你168 (?ιρ)和重組菌株分別接種于DSM培養基中,重組菌株分別取8h和48h培養物進行處理, 野生型菌株取48h的培養物進行處理。
[0034] 芽孢蛋白的處理方法:12000rpmX10min離心收集菌體,重懸于相同體