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靈芝漆酶畢赤酵母基因工程菌株的構建與應用

文檔序號:9592814閱讀:782來源(yuan):國(guo)知局
靈芝漆酶畢赤酵母基因工程菌株的構建與應用
【技術領域】
[0001] 本發明涉及的是一種分子生物學、基因工程領域的技術,具體是一種靈芝漆酶畢 赤酵母基因工程菌株的構建與應用。
【背景技術】
[0002] 自然界參與降解木質素的微生物種類有真菌、放線菌和細菌等,但最有效、最主 要的是真菌(BuswellJ,OdierE,KirkT.Ligninbiodegradation.CriticalReview inBiotechnology,1987,6:l_60)。主要是這些微生物能夠產生木質素修飾酶(lignin modifyingenzymes,LMEs),主要包括木質素過氧化物酶(ligninperoxidase,LiP)(EC 1· 11. 1· 14)、猛過氧化物酶(manganeseperoxida,MnP) (EC1. 11. 1· 13)、漆酶(laccase, Lac)(EC1. 10. 3. 2)以及產生過氧化氫的氧化酶,比如乙二醛氧化酶(glyoxaloxidase, GL0X)、芳基乙醇氧化酶(Aryl-alcoholoxidase,ΑΑ0)等。
[0003] 漆酶(EC 1. 10. 3. 2)是一種含銅的多酚氧化酶,屬于藍色多銅氧化酶家族,廣泛 分布在植物、真菌、少數細菌和昆蟲中。漆酶的活性中心一般包含4個銅離子,漆酶的催 化氧化反應即通過銅離子間的協同傳遞電子,奪取反應底物的電子,將底物氧化為自由基 形式,同時將從底物捕獲的電子傳遞給〇2,將〇2還原為水(Hakulinen N,Kiiskinen LL, Kruus K,Saloheimo Μ,Paananen A, Koivula A, Rouvinen J. Crystal structure of a laccase from Melanocarpus albomyces with an intact trinuclear copper site. Nat Struct Mol Biol. 2002,9 (8): 601-605.)。漆酶作用的底物相當寬泛,典型的底物是各種 酚類化合物及其衍生物,包括簡單的二酚、多酚、甲氧基取代酚(如愈創木酚)、氨基酚、氯 酚等。在小分子的介體物質存在下,漆酶可氧化的底物范圍還將進一步擴大。由于漆酶 作用底物的廣泛性及以水作為唯一副產物,使得漆酶在綠色生物技術應用中有較好的應 用前景,主要體現在芳香族化合物合成、食品和果汁加工、土壤和水體的生物除污、紙漿漂 白等方面(Zhou Xff, Cong WR, Su KQ,Zhang YM. Ligninolytic enzymes from Ganoderma spp:current status and potential applications. Critical Review in Microbiology, 2013, 39 (4) :416-26)。在上世紀對漆酶的研究中,70年代確定了白腐菌在實驗室條件下降 解木質素的營養需求;80年代發現了白腐菌降解木質素的酶系,Lac、Lip和Μηρ ;90年代展 開了催化特征、分子生物學的研究,同時在生物制漿、生物漂白、染料廢水、制漿廢水等工業 領域的應用研究也蓬勃開展起來。
[0004] 雖然從自然界中的植物中能分離到漆酶,但是其工藝煩瑣,成本高;多種微生 物具有產生漆酶的功能,如現有文件"一種生產漆酶的方法"(201310742301. 7)中, 利用杈戴氏霉GZUIFR-H104. 1真菌菌株培養生產漆酶;"靈芝漆酶的高效清潔生產方 法"(200610096638.5)利用樹舌靈芝菌絲發酵生產漆酶等,但由于天然的產漆酶菌株的生 長緩慢,營養要求較高,或是產物在胞內形成包涵體(細菌菌株)不利于目標蛋白的純化, 漆酶產量低、生產成本高。另外,利用絲狀真菌生產漆酶還存在一些問題,如發酵周期長,培 養基要求高,酶活力低,菌絲在發酵罐中易受高剪切力的損傷等。隨著分子生物學技術的發 展,利用DNA體外重組技術構建各類工程菌株,通過工程菌株的發酵生產各種蛋白已經成 為可能,并產生了巨大的經濟效益。因此,在漆酶的生產中,克隆漆酶基因、構建漆酶基因工 程菌株,實現漆酶基因的異源表達,是今后實現重組漆酶的工業化生產及實際應用的重要 基礎。
[0005] 目前已經從多種白腐真菌中克隆了漆酶基因,如GenBank:AAR21094,AAR21096, ABP81837,AAG09229,BAA22153,AAM18407,CAA7701等。通過靈芝基因組測序發現,在靈芝 全基因組中,真菌木質素氧化酶家族中有16個漆酶基因,與其他擔子菌比較,靈芝漆酶基 因拷貝數僅次于灰蓋鬼傘菌(Coprinopsiscinerea),提示靈芝具有很強的木質素降解能 力(陳岳文等,靈芝漆酶注釋基因Laccl的生物信息學分析及其Cu2+誘導表達,湖南農業大 學學報(自然科學版).2013, 39 (3) : 265-269),因此,一些研究者希望從靈芝中克隆漆酶基 因(如Genbank:AY485825 ;張銀波等,靈芝(Ganodermalucidum)漆酶基因的克隆及其序 列分析。中國生物化學與分子生物學報,2005, 21 (5) :700-704。張桂敏,王亞平,蔡立濤,馬 立新。外顯子拼接法合成真菌靈芝漆酶基因cDNA,武漢大學學報(理學版)。2007, 53(6): 701-705.)利用基因工程的方法生產漆酶,為我們的生產和生活服務。而在眾多的表達宿主 中,原核表達產量低,且有可能形成包涵體,不利于漆酶的分離純化,或有增加分離純化成 本的缺點。畢赤酵母是最近迅速發展的一種真核表達宿主,營養要求不高,適合于高密度發 酵的大規模生產方式,其分泌自身的蛋白很少,有利于表達產物的分離和純化。
[0006] 中國專利文獻號CN1657611,公開(公告)日2005. 08. 24,公開了一種具有漆酶、 木聚糖酶、過氧化物酶活性的制劑及其核苷酸序列,克隆了新的漆酶、木聚糖酶和過氧化物 酶基因,構建了漆酶、木聚糖酶和過氧化物酶基因的表達載體,將表達載體導入酵母或絲狀 真菌中表達,并檢測出重組酶的活性。將重組表達的漆酶、木聚糖酶、過氧化物酶混合酶配 制成制劑,可在造紙、環保、食品和飼料等工業中應用。但該技術并未給出用畢赤酵母作為 生產重組漆酶或木聚糖酶或過氧化物酶蛋白的宿主的具體實現方案;構建的pBARPE-Lac 表達載體僅在黑曲霉(Aspergillusniger)中得到表達,并未涉及畢赤酵母的表達。現有 研究表明:大部分絲狀真菌均有分泌漆酶的能力,該技術所測的漆酶(酶活)是菌絲體本身 分泌的漆酶還是基因工程菌產生的漆酶還很難預料,因為黑曲霉本身就是能夠分泌產生漆 酶;再之,絲狀真菌中產生漆酶的同時會分泌許多種酶類,發酵產生的混合液中的多種酶會 給后續的漆酶的分離和純化帶來眾多不便。

【發明內容】

[0007] 本發明針對現有技術存在的上述不足,提出一種靈芝漆酶畢赤酵母基因工程菌 株的構建與應用,重組畢赤酵母陽性菌株經過甲醇誘導培養,可用于制備重組靈芝漆酶 (rGILac)〇
[0008] 本發明是通過以下技術方案實現的:
[0009] 本發明涉及一種靈芝漆酶畢赤酵母基因工程菌株的構建,通過從靈芝中克隆出漆 酶基因GILac,經EcoRI和Xbal雙酶切后克隆入畢赤酵母表達質粒并構建出表達載體,最后 將其電轉化入畢赤酵母表達宿主菌中,經培養擴增和篩選后得到畢赤酵母工程菌。
[0010] 所述的靈芝,采用但不限于靈芝(G.lucidum51562)、靈芝(G.lucidum 50044)、赤芝(G.lucidum00679)、紫芝(G.sinensi50817),優選米用靈芝(Ganoderma lucidum) 50817,均購自中國普通微生物菌種保藏管理中心(ChinaGeneral MicrobiologicalCultureCollectionCenter,CGMCC)〇
[0011] 所述的漆酶基因GILac的核苷酸序列如SeqID.No. 1所示。
[0012] 所述的雙酶切是指:將擬表達的靈芝漆酶基因GILac的cDNA序列經EcoRI和Xbal 雙酶切。
[0013] 所述的畢赤酵母表達質粒優選為經過相同的所述EcoRI和Xbal雙酶切的質粒,進 一步優選為pPICZaA。
[0014] 所述的構建是指:將擬表達的靈芝Lac的cDNA序列經EcoRI和Xbal雙酶切后,克 隆入同樣經過Xbal和EcoRI雙酶切的pPICZαA-載體,再將酶切回收產物連接、轉化大腸 桿菌DH5a感受態細胞中。
[0015] 所述的畢赤酵母表達宿主菌優選為畢赤酵母X33。
[0016] 所述的電轉化是指:取5-10μL線性化的單拷貝質粒分別加入80μL畢赤酵母 父33感受態細胞并輕輕混勻,轉入2mm預冷電轉杯,冰上放置5min,放入電轉儀,電擊,電壓: 1500V,電擊時間5. 4ms,電擊完成后,立即加入lmL、lM預冷的山梨醇,混勻后轉移到1. 5mL 離心管中,28°C,靜止1~2h,每200yL涂一塊YPD平板。28°C,培養3d,形成分散,飽滿的 單克隆,挑斑接種3mLYH)液體培養基中。
[0017] 所述的培養擴增是指:將經過電轉化的畢赤酵母X33細胞涂布于含Zeocin濃度為 1. 0mg/mL的YH)瓊脂平板30°C培養3天,然后挑取轉化子進行PCR擴增檢測。
[0018] 所述的篩選是指:篩選高拷貝重組了漆酶基因表達框架的畢赤酵母重組子作為含 漆酶基因表達框架的畢赤酵母工程菌,即重組畢赤酵母陽性菌株。
[0019] 本發明涉及上述方式得到的基因工程菌株的應用,將其用于制備靈芝漆酶 rGlLac〇
[0020] 所述的制備是指:將所述重組畢赤酵母陽性菌株活化后接種于BMGY誘導前培養 基中,后轉接入1. 5LBMMY誘導培養基中,誘導表達96h;誘導后上清經透析濃縮后重溶于 tris-HCl緩沖液中,利用鎳離子親和層析(Ni-IDA)純化重組蛋白。
[0021] 所述的接種具體是指:將挑選的重組畢赤酵母X33陽性菌株接種于含有BMGY培養 液的搖瓶中,28°C下250rpm培養16-18h后,離心并收集細胞。
[0022] 所述的誘導是指:用BMMY培養液重懸接種后的細胞進行誘導,每24h補加甲醇至 終濃度為1%。
[0023] 所述的透析濃縮是指:將誘導后的產物在4000rpm、室溫環境下離心5
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