本(ben)發明涉及(ji)(ji)威(wei)尼斯鐮(lian)刀菌(jun)(jun)基因工程(cheng)領域,涉及(ji)(ji)產(chan)甜菜(cai)紅素(su)威(wei)尼斯鐮(lian)刀菌(jun)(jun)表達載體的構建及(ji)(ji)產(chan)甜菜(cai)紅素(su)威(wei)尼斯鐮(lian)刀菌(jun)(jun)株的創建,具(ju)體涉及(ji)(ji)同時(shi)提高鐮(lian)刀菌(jun)(jun)菌(jun)(jun)絲體蛋白和甜菜(cai)紅素(su)產(chan)量(liang)的方法。
背景技術:
1、由威尼斯鐮刀菌發酵生產的(de)(de)菌絲(si)體(ti)蛋(dan)白(bai)安全性好且能夠(gou)提(ti)(ti)供均衡的(de)(de)營養,具有(you)替(ti)代動植物來源(yuan)膳(shan)食蛋(dan)白(bai)的(de)(de)潛質。然而(er),天(tian)然菌株(zhu)生產菌絲(si)體(ti)蛋(dan)白(bai)的(de)(de)高(gao)成(cheng)本(ben)(ben)成(cheng)為限(xian)制其發展的(de)(de)關(guan)鍵因素(su)。而(er)打破當前這種(zhong)限(xian)制因素(su)的(de)(de)方式主要有(you)兩種(zhong),一(yi)種(zhong)是通過對(dui)菌株(zhu)進行改造以提(ti)(ti)高(gao)菌絲(si)體(ti)蛋(dan)白(bai)的(de)(de)合(he)(he)成(cheng)效(xiao)率直接(jie)降低成(cheng)本(ben)(ben);另一(yi)種(zhong)則是在菌株(zhu)中合(he)(he)成(cheng)具有(you)附(fu)加(jia)價值的(de)(de)產品以提(ti)(ti)高(gao)總體(ti)的(de)(de)經(jing)濟效(xiao)益。
2、甜菜(cai)(cai)紅(hong)素(su)是一(yi)種從紅(hong)甜菜(cai)(cai)根中(zhong)提(ti)取的(de)(de)天(tian)然紅(hong)色(se)食(shi)用(yong)(yong)色(se)素(su),對人體(ti)具有(you)抗(kang)氧化、抗(kang)炎(yan)、降血脂和抗(kang)腫瘤等功效。然而,考慮(lv)到甜菜(cai)(cai)根中(zhong)甜菜(cai)(cai)紅(hong)素(su)的(de)(de)含量較(jiao)低,提(ti)取過程中(zhong)產品的(de)(de)回收率相對較(jiao)低,以及(ji)(ji)全球市場需求的(de)(de)不斷增(zeng)長,迫切(qie)需要一(yi)種新(xin)的(de)(de)甜菜(cai)(cai)紅(hong)素(su)供應(ying)模(mo)式。當前,從土(tu)地利用(yong)(yong)、生(sheng)產周期(qi)和可持續大規(gui)模(mo)生(sheng)產的(de)(de)角度來看,微生(sheng)物發酵(jiao)生(sheng)產甜菜(cai)(cai)紅(hong)素(su)的(de)(de)優(you)勢(shi)最為明顯。因此,創建高(gao)產甜菜(cai)(cai)紅(hong)素(su)的(de)(de)威(wei)(wei)尼(ni)斯鐮(lian)(lian)刀(dao)菌菌株不僅(jin)可以提(ti)高(gao)菌株生(sheng)產菌絲體(ti)蛋(dan)白(bai)時(shi)的(de)(de)總(zong)體(ti)經濟(ji)效益以及(ji)(ji)緩(huan)解甜菜(cai)(cai)紅(hong)素(su)供應(ying)不足(zu)的(de)(de)現狀,還可以擴大威(wei)(wei)尼(ni)斯鐮(lian)(lian)刀(dao)菌在未來食(shi)品領(ling)域(yu)的(de)(de)應(ying)用(yong)(yong)范圍(wei)。
技術實現思路
1、本發明的一個目的是解(jie)決至少(shao)上述問題(ti)和/或缺(que)陷,并提(ti)供至少(shao)后面將說明的優點。
2、針對現有技術的(de)需(xu)求,本(ben)發明的(de)目的(de)在于提供產甜菜紅素的(de)威尼斯鐮刀菌(jun)表達(da)載體和(he)菌(jun)株。
3、本發(fa)明還有一(yi)個目的(de)是(shi)提(ti)供同時提(ti)高鐮(lian)刀菌菌絲體蛋(dan)白和甜菜(cai)紅素(su)產量(liang)的(de)方法。
4、為此(ci),本(ben)發明提供如下的(de)技術方(fang)案(an):
5、同時提高鐮刀(dao)菌(jun)菌(jun)絲(si)體蛋白和甜菜紅素產(chan)量的方(fang)法,包括如下(xia)步(bu)驟:
6、將負載有細胞色素(su)(su)p450酶(mei)(mei)基(ji)因(yin)片(pian)段(duan)(duan)、多(duo)(duo)巴(ba)4,5-雙加氧酶(mei)(mei)基(ji)因(yin)片(pian)段(duan)(duan)和(he)葡糖基(ji)轉移酶(mei)(mei)基(ji)因(yin)片(pian)段(duan)(duan)的超量表達(da)載體轉化入鐮刀(dao)(dao)菌(jun)體內,得(de)到新的鐮刀(dao)(dao)菌(jun),其(qi)中,細胞色素(su)(su)p450酶(mei)(mei)基(ji)因(yin)片(pian)段(duan)(duan)、多(duo)(duo)巴(ba)4,5-雙加氧酶(mei)(mei)基(ji)因(yin)片(pian)段(duan)(duan)和(he)葡糖基(ji)轉移酶(mei)(mei)基(ji)因(yin)片(pian)段(duan)(duan)被構建為連鎖基(ji)因(yin);
7、將所述新的鐮(lian)刀(dao)菌(jun)接種(zhong)于液體培養(yang)基中進行培養(yang),分別獲(huo)取(qu)發酵液和菌(jun)體,并從(cong)(cong)所述發酵液中收獲(huo)甜(tian)菜紅素,從(cong)(cong)所述菌(jun)體中收獲(huo)菌(jun)絲體蛋白。
8、優選的(de)是,所述的(de)同(tong)時提高鐮刀菌菌絲(si)體蛋白和(he)甜(tian)菜紅素(su)產量的(de)方法中,將細胞(bao)色素(su)p450酶基(ji)因片(pian)(pian)段、多巴4,5-雙加氧酶基(ji)因片(pian)(pian)段和(he)葡(pu)糖基(ji)轉(zhuan)移酶基(ji)因片(pian)(pian)段通過2a肽(tai)串聯在一起的(de)開放閱讀框命名為(wei)ruby基(ji)因。
9、優(you)選的是,所述(shu)的同(tong)時提高鐮(lian)刀菌菌絲體蛋白(bai)和甜菜紅素(su)產量的方法中(zhong),得到所述(shu)新的鐮(lian)刀菌的方法包括如下步驟:
10、以(yi)包含ruby基因的表(biao)達載(zai)體(ti)addgene?id:160908為模板,以(yi)seq?id?no:1和2所(suo)示(shi)的一組引物(wu)對為引物(wu),擴增出ruby片段,隨后通過同源重組將上述片段與線性化(hua)pk2-pgpda-ttef1載(zai)體(ti)連接(jie),獲得表(biao)達載(zai)體(ti)pk2-pgpda-ruby-ttef1,
11、以表達載(zai)體pk2-pgpda-ruby-ttef1為模板,以seq?id?no:3和4所示的一(yi)組引(yin)物(wu)對為引(yin)物(wu),擴增得到用于(yu)crispr/cas9介導的基(ji)因同(tong)源定向重組插入的供體dna片段pgpda-ruby-ttef1;
12、將(jiang)seq?id?no:13所(suo)示的(de)5srrna啟(qi)動子(zi)序列(lie)片段(duan)和如seq?id?no:15所(suo)示的(de)sgrnagfp片段(duan)通(tong)過融合pcr進行(xing)兩輪擴增,融合獲得(de)(de)5srrna-sgrnagfp,并通(tong)過同源重組酶(mei)將(jiang)融合后的(de)片段(duan)插入到骨架載(zai)體pfc322-cas9上(shang),獲得(de)(de)介導ruby定點整(zheng)合威尼斯(si)鐮刀菌基(ji)因(yin)組的(de)crispr/cas9表達載(zai)體;
13、通過原(yuan)生質體(ti)(ti)轉(zhuan)化(hua)方法,將所(suo)述介(jie)導ruby定點整合威尼(ni)斯鐮(lian)刀(dao)(dao)菌基因(yin)組的(de)crispr/cas9表達載體(ti)(ti)和供(gong)體(ti)(ti)dna片段pgpda-ruby-ttef1依次加(jia)入威尼(ni)斯鐮(lian)刀(dao)(dao)菌原(yuan)生質體(ti)(ti)懸浮(fu)液中,培養,篩選得到超量表達甜菜紅素合成基因(yin)ruby的(de)陽性(xing)轉(zhuan)化(hua)子,得到所(suo)述新的(de)鐮(lian)刀(dao)(dao)菌。
14、優選(xuan)的(de)(de)(de)是,所述(shu)的(de)(de)(de)同時(shi)提高鐮刀菌(jun)菌(jun)絲體(ti)蛋白(bai)和甜菜紅素產量(liang)的(de)(de)(de)方(fang)法中(zhong),進行原(yuan)生質(zhi)體(ti)轉化時(shi),所述(shu)介(jie)導ruby定點整(zheng)合(he)威尼(ni)斯鐮刀菌(jun)基因組的(de)(de)(de)crispr/cas9表達載體(ti)和供體(ti)dna片(pian)段pgpda-ruby-ttef1的(de)(de)(de)加入量(liang)均為(wei)800ng/μl。
15、優選(xuan)的(de)(de)是(shi),所(suo)(suo)述(shu)的(de)(de)同時(shi)提(ti)高鐮刀菌菌絲體蛋白和甜菜紅素產量的(de)(de)方法中(zhong),以(yi)如(ru)seqid?no:5和6所(suo)(suo)示(shi)(shi)的(de)(de)一組引物(wu)對(dui)從威(wei)尼斯鐮刀菌的(de)(de)dna基(ji)因組中(zhong)通過pcr擴(kuo)(kuo)(kuo)出(chu)內源所(suo)(suo)述(shu)5srrna啟(qi)動子片(pian)段(duan),以(yi)如(ru)seq?id?no:7和8所(suo)(suo)示(shi)(shi)的(de)(de)一組引物(wu)對(dui)在如(ru)seq?id?no:14所(suo)(suo)示(shi)(shi)的(de)(de)grnascaffold片(pian)段(duan)為模板擴(kuo)(kuo)(kuo)出(chu)sgrnagfp序列,隨后(hou)通過融合(he)pcr進行(xing)兩(liang)輪擴(kuo)(kuo)(kuo)增,將5srrna啟(qi)動子片(pian)段(duan)與sgrnagfp片(pian)段(duan)進行(xing)融合(he)。
16、優選的是,所(suo)述的同時提高(gao)鐮刀菌菌絲體蛋白和甜菜紅素產量的方法中,所(suo)述液體培養基包含如下(xia)組(zu)分:葡萄糖(tang)40g/l,酵母(mu)粉(fen)0.5g/l,硫(liu)酸(suan)(suan)銨12g/l,硫(liu)酸(suan)(suan)鎂1.5g/l,氯化鉀0.7g/l,硫(liu)酸(suan)(suan)鈉(na)0.5g/l,磷(lin)酸(suan)(suan)二氫鉀2g/l和碳酸(suan)(suan)鈣0.5/l?g。
17、優選的(de)是,所(suo)述的(de)同時提高(gao)鐮刀菌菌絲(si)體蛋白和甜菜紅素(su)產量(liang)的(de)方法(fa)中,將所(suo)述新的(de)鐮刀菌接種于液體培養基中進行培養的(de)方法(fa)包括:
18、將所(suo)述新的(de)鐮刀菌(jun)接種在cmc-na固體培養(yang)基(ji)上培養(yang)進行產孢,隨后(hou)制(zhi)備(bei)孢懸液(ye),取(qu)所(suo)述孢懸液(ye)接種于cmc-na液(ye)體培養(yang)基(ji)中進行搖床培養(yang)若干(gan)天(tian),再(zai)收集得到發酵液(ye)。
19、本(ben)發明至少包括以下有益效果:
20、本發明通過在威尼斯鐮(lian)刀菌(jun)(jun)中定向過表達(da)甜菜(cai)(cai)紅(hong)素(su)合成基(ji)因ruby,獲得高效合成甜菜(cai)(cai)紅(hong)素(su)的(de)威尼斯鐮(lian)刀菌(jun)(jun)菌(jun)(jun)株(zhu),達(da)到菌(jun)(jun)株(zhu)菌(jun)(jun)絲(si)體蛋白生產(chan)時(shi)提高綜合經(jing)濟效益的(de)目的(de)。
21、本(ben)發明(ming)(ming)的(de)其它(ta)優點、目(mu)標和特征將部(bu)(bu)分通過下面的(de)說明(ming)(ming)體現(xian),部(bu)(bu)分還將通過對本(ben)發明(ming)(ming)的(de)研(yan)究和實踐而為(wei)本(ben)領域的(de)技術人員所理解(jie)。
1.同時提(ti)高鐮刀(dao)菌菌絲體(ti)蛋白和甜(tian)菜紅(hong)素產量(liang)的方法,其(qi)特(te)征在于,包括(kuo)如(ru)下步(bu)驟:
2.如權利要求1所述的(de)同時提高(gao)鐮刀菌菌絲體蛋(dan)白(bai)和(he)甜菜(cai)紅素產(chan)量的(de)方法,其(qi)特征(zheng)在(zai)于(yu),將細胞(bao)色素p450酶基(ji)因片段、多巴4,5-雙加氧酶基(ji)因片段和(he)葡糖基(ji)轉移酶基(ji)因片段通過(guo)2a肽(tai)串聯(lian)在(zai)一(yi)起的(de)開放(fang)閱讀框(kuang)命(ming)名為ruby基(ji)因。
3.如權(quan)利要求2所述的(de)同時提(ti)高鐮(lian)刀菌(jun)菌(jun)絲體蛋白和(he)甜菜紅素產量的(de)方法(fa),其特征在(zai)于,得到(dao)所述新的(de)鐮(lian)刀菌(jun)的(de)方法(fa)包括如下步驟:
4.如權利(li)要(yao)求3所(suo)述的同時提高鐮刀(dao)菌(jun)菌(jun)絲體(ti)(ti)蛋白和(he)(he)甜菜(cai)紅素產量(liang)的方法(fa),其(qi)特征在(zai)于(yu),進行原(yuan)生(sheng)質體(ti)(ti)轉(zhuan)化時,所(suo)述介導ruby定點(dian)整合威尼斯鐮刀(dao)菌(jun)基(ji)因組(zu)的crispr/cas9表達載體(ti)(ti)和(he)(he)供體(ti)(ti)dna片段(duan)pgpda-ruby-ttef1的加入量(liang)均為800ng/μl。
5.如權利要求3所述的(de)(de)(de)同時提高鐮刀菌(jun)菌(jun)絲體蛋白和(he)甜菜紅素產(chan)量的(de)(de)(de)方法,其特征在于,以如seq?id?no:5和(he)6所示(shi)的(de)(de)(de)一組(zu)引(yin)物對從威尼(ni)斯鐮刀菌(jun)的(de)(de)(de)dna基因(yin)組(zu)中通(tong)過pcr擴出內(nei)源所述5srrna啟動子片段,以如seq?id?no:7和(he)8所示(shi)的(de)(de)(de)一組(zu)引(yin)物對在如seq?id?no:14所示(shi)的(de)(de)(de)grna?scaffold片段為模板(ban)擴出sgrnagfp序列,隨后通(tong)過融合(he)pcr進(jin)行兩(liang)輪擴增,將5srrna啟動子片段與sgrnagfp片段進(jin)行融合(he)。
6.如權利(li)要求1所(suo)述的同時提高鐮刀菌(jun)菌(jun)絲體蛋(dan)白和甜菜(cai)紅素(su)產(chan)量的方法,其特征在于,所(suo)述液體培(pei)養基(ji)包(bao)含如下組分:葡(pu)萄糖40g/l,酵母粉0.5g/l,硫(liu)(liu)酸(suan)銨12g/l,硫(liu)(liu)酸(suan)鎂1.5g/l,氯化(hua)鉀0.7g/l,硫(liu)(liu)酸(suan)鈉0.5g/l,磷酸(suan)二(er)氫(qing)鉀2g/l和碳酸(suan)鈣(gai)0.5/l?g。
7.如(ru)權利要求1所(suo)述(shu)的同時提高鐮刀菌菌絲(si)體蛋白和甜菜紅素(su)產量的方法,其特征在于(yu),將所(suo)述(shu)新的鐮刀菌接種于(yu)液體培養基(ji)中(zhong)進行培養的方法包括: