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一種疾病遺傳風險評估的基因檢測方法與流程

文檔(dang)序號:39427090發布日期:2024-09-20 22:24閱讀:來源:國知局

技術特征:

1.一種(zhong)疾病遺傳風險評估的基因檢測方(fang)法(fa),其特征(zheng)在(zai)于,該方(fang)法(fa)包括以下步驟:

2.根(gen)據(ju)權(quan)利要求1所(suo)述(shu)的一(yi)種疾病遺傳風(feng)險評估的基(ji)因檢測方法,其特(te)征(zheng)在于,所(suo)述(shu)步驟一(yi)中(zhong),初始基(ji)因序(xu)列(lie)數(shu)據(ju)包括基(ji)因的編碼序(xu)列(lie)信息、表達量指標、時間(jian)點樣本標記。

3.根據(ju)權利(li)要求1所述(shu)的一(yi)種疾病遺傳風險(xian)評估(gu)的基(ji)因檢(jian)測方法,其特征在于,步(bu)驟二(er)中,基(ji)于所述(shu)初始基(ji)因序列數(shu)據(ju),進行數(shu)據(ju)完整性審核,剔除含缺(que)失值或超閾(yu)值的記錄(lu),并檢(jian)測異常值,對數(shu)據(ju)轉換處(chu)理,均(jun)勻化數(shu)據(ju)分布,并調(diao)整每(mei)個數(shu)據(ju)點到標(biao)準正態分布,得到均(jun)衡基(ji)因表達集。

4.根據權利要求1所(suo)述(shu)的一種疾病遺傳風險評估(gu)的基因檢測方法(fa),其(qi)特征在于,所(suo)述(shu)步驟三(san)中(zhong),基于所(suo)述(shu)均衡(heng)基因表(biao)達集,提(ti)取dna,并進行徹底洗脫(tuo)去除殘留雜(za)質,分析(xi)基因表(biao)達數據,計(ji)算(suan)并篩選出偏(pian)差(cha)超標的基因,采用隱馬爾可夫模型,分析(xi)周期性波動,生成基因表(biao)達狀態序列(lie)。

5.根(gen)據(ju)(ju)權利要求4所(suo)述的一種疾病(bing)遺傳風險評估的基(ji)(ji)(ji)因檢測方法,其特征在于,所(suo)述基(ji)(ji)(ji)因表(biao)達狀態序列(lie)基(ji)(ji)(ji)于所(suo)述均(jun)衡(heng)基(ji)(ji)(ji)因表(biao)達集,提取dna,并(bing)進行徹底洗脫,同(tong)時檢測dna的質量(liang)和完整度,分析基(ji)(ji)(ji)因表(biao)達數據(ju)(ju),并(bing)量(liang)化基(ji)(ji)(ji)因表(biao)達水平(ping),計(ji)算基(ji)(ji)(ji)因表(biao)達的標準偏差,篩(shai)選出偏差超標的基(ji)(ji)(ji)因,評估基(ji)(ji)(ji)因表(biao)達的周期(qi)性(xing)波動,并(bing)采用隱(yin)馬(ma)爾可夫模型識別周期(qi)性(xing)模式,生成基(ji)(ji)(ji)因表(biao)達狀態序列(lie);

6.根據(ju)權利(li)要(yao)求1所述的(de)(de)一種疾(ji)病遺傳(chuan)風(feng)險評估的(de)(de)基(ji)(ji)因(yin)(yin)檢測(ce)方法(fa)(fa),其特征在于(yu),步(bu)驟四(si)中,基(ji)(ji)于(yu)所述基(ji)(ji)因(yin)(yin)表達(da)狀態(tai)序列(lie),對(dui)各(ge)基(ji)(ji)因(yin)(yin)表達(da)值進行(xing)歸一化處理,將數(shu)(shu)據(ju)轉換為標準正態(tai)分布,計算(suan)基(ji)(ji)因(yin)(yin)間的(de)(de)表達(da)關(guan)聯性,并根據(ju)得(de)到的(de)(de)相關(guan)系數(shu)(shu)建立(li)基(ji)(ji)因(yin)(yin)之間的(de)(de)連接,使用力導向(xiang)布局算(suan)法(fa)(fa)對(dui)網絡(luo)圖進行(xing)空間優化,調整節點位置,生成基(ji)(ji)因(yin)(yin)數(shu)(shu)據(ju)拓撲結(jie)構(gou)圖;

7.根據(ju)權利要求1所述(shu)的一(yi)種疾(ji)(ji)病(bing)遺傳風險評估(gu)的基(ji)因檢測方(fang)法(fa),其特征在于,步驟五(wu)中(zhong),基(ji)于所述(shu)基(ji)因數據(ju)拓撲結構(gou)圖,分析(xi)圖中(zhong)節點(dian)(dian)的連接性和表(biao)(biao)達強度,識別(bie)與疾(ji)(ji)病(bing)有關聯性的節點(dian)(dian),對標記(ji)的表(biao)(biao)達模(mo)式進行分析(xi),比較每個標記(ji)與疾(ji)(ji)病(bing)案例的匹配度,篩選關鍵標記(ji),生(sheng)成(cheng)風險生(sheng)物標記(ji)集(ji)。

8.根(gen)據(ju)權利要求1所述的一種(zhong)疾病(bing)遺傳風(feng)險評(ping)估的基因(yin)檢測(ce)方法,其特征在于,步(bu)驟六中,基于所述風(feng)險生物標記集,進(jin)行(xing)數(shu)據(ju)分(fen)類,根(gen)據(ju)病(bing)種(zhong)相關性(xing)對每(mei)個(ge)標記進(jin)行(xing)排序,并建立索引,整理成結構化表格(ge)形(xing)式(shi),并進(jin)行(xing)統計(ji)(ji)分(fen)析,比較每(mei)個(ge)標記與已知疾病(bing)案例的匹配度,評(ping)估每(mei)個(ge)標記與疾病(bing)的關聯(lian)性(xing),并進(jin)行(xing)整合(he),為參與者計(ji)(ji)算風(feng)險評(ping)分(fen),生成個(ge)體(ti)疾病(bing)風(feng)險評(ping)估模型。

9.根據權利要求1所述(shu)的一種疾病遺(yi)傳(chuan)風(feng)險評(ping)估(gu)的基因檢測方法,其特征在于,步(bu)驟(zou)七中,基于所述(shu)個(ge)體疾病風(feng)險評(ping)估(gu)模型,收集并(bing)整理參(can)(can)與(yu)者(zhe)的健(jian)康(kang)記錄,匹配模型的輸入格式,并(bing)進行分(fen)(fen)析,計算每(mei)位參(can)(can)與(yu)者(zhe)的疾病風(feng)險得分(fen)(fen),匯總得分(fen)(fen)和健(jian)康(kang)狀況信(xin)息,生成遺(yi)傳(chuan)風(feng)險分(fen)(fen)析信(xin)息。


技術總結
本發明涉及疾病預測技術領域,涉及到一種疾病遺傳風險評估的基因檢測方法,通過基于參與者定期健康檢查周期,采集研究參與者的血液樣本,對血液中的DNA分子進行分析,并對基因進行識別,生成初始基因序列數據。本發明中,通過采用隱馬爾可夫模型識別并記錄基因活動的變化模式,有效地捕捉基因表達的動態變化,提高了對復雜遺傳信息的理解,使疾病預測更加準確和敏感,力導向布局算法對數據進行結構化分析,通過生成基因數據的拓撲結構圖,增強了數據的可解釋性和可視化水平,為科研人員提供了直觀的工具,識別與疾病風險高度相關的關鍵生物標記,促進了個體化醫療和早期診斷的效率,為疾病管理和預防提供了有力支持。

技術研發人員:呂桂珍,劉永紅
受保護的技術使用者:東莞蘭衛醫學檢驗實驗室有限公司
技術研發日:
技術公布日:2024/9/19
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