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一種用于快速檢測人類vkorc1和cyp2c9基因多態性的試劑盒及其使用方法

文檔(dang)序號:487471閱讀:795來源(yuan):國知(zhi)局
一種用于快速檢測人類vkorc1和cyp2c9基因多態性的試劑盒及其使用方法
【專利摘要】本發明屬于生物醫學領域臨床檢測技術中的基因檢測技術,具體涉及一種用于快速檢測人類VKORC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒及其使用方法。本發明所述試劑盒包括3對引物、3條探針、6條PNA序列,1對β-Actin內標引物及1條內標探針,還包括Mg2+的PCR反應緩沖液、dNTP混合物、Taq酶和ddH2O。利用本發明試劑盒能夠對VKORC1和CYP2C9基因多態性位點進行定性檢測,根據SNP位點進行兩管PNA-PCR熒光擴增反應,只需根據兩管熒光曲線是否起線就能進行結果判斷,不會產生人為誤差,假陽性和假陰性率低;本發明試劑盒更容易實現高通量檢測,更能滿足臨床使用。
【專利說明】-種用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試 劑盒及其使用方法

【技術領域】
[0001] 本發明屬于生物醫學領域臨床檢測技術中的基因檢測技術,具體涉及一種用于快 速檢測人類VKORCl和CYP2C9基因多態性的試劑盒及其使用方法。

【背景技術】
[0002] 華法林是目前廣泛應用的香豆素類口服抗凝藥,用于預防和治療血栓栓塞性疾病 的口服抗凝治療。但是華法林的劑量窗口較窄,不同病人的所需用量可以相差十倍以上。目 前研究發現,CYP2C9和維生素 K環氧化物還原酶(VKOR)基因多態性對華法林治療劑量的 影響逐漸被認識,其中他01?(:1(-16396/^),0¥?209*2(430(:/1')和0¥?209*3(10754/〇多態 性位點與華法林治療劑量關系最為密切,這些位點多態性都與華法林代謝酶的損傷有關, 從而導致個體間和民族間華法林用量的差異。目前,國際華法林實施協會根據VKORCl和 CYP2C9基因多態性制定了詳細的華法林劑量計算公式,從而可以實現患者個體化給藥。
[0003] 目前,用于基因分型的檢測方法分為四類:測序法,聚合酶鏈反應-限制性片段長 度多態性技術(PCR-RFLP)、芯片法、熒光定量PCR法(qPCR)四種方法。
[0004] 測序法:先進行PCR擴增,得到含有目的SNP位點的PCR產物,然后純化PCR產物, 再對其進行測序,根據測序峰圖判讀基因型。優點:結果準確,測序法是基因多態性位點檢 測的金標準。但是其成本較高,操作繁瑣,試驗周期長,限制了其在臨床使用。
[0005] PCR-RFLP技術:先進行PCR擴增,得到含有目的SNP位點的PCR產物,然后對PCR 產物進行酶切,電泳檢測酶切條帶,根據酶切條帶進行判讀。優點:成本低,結果比較直觀; 缺點:有的多態性位點所在位置沒有合適的限制性酶切位點,需要人工引入突變,另外容易 造成產物污染,導致假陽性結果,同時操作繁瑣,試驗周期長。
[0006] 芯片法:先進行PCR擴增,得到含有目的SNP位點的PCR產物,然后將PCR產物與 突變探針、野生探針雜交,通過比較兩個探針雜交的信號強度判斷樣品基因型。缺點=PCR 產物需要進行后續分析,操作繁瑣;另外結果不好判讀,容易出現假陽性。
[0007] qPCR法:又分為ARMS-PCR法、HRM法和Taqman探針法。qPCR的優點是操作簡單, 試驗周期短,PCR產物無需進行后續分析即可判斷結果,因全過程在封閉的管內進行,減少 產物交叉污染。同時該方法操作簡單,檢測周期短。目前該方法已成為臨床常用的檢測方 法。
[0008] ARMS-PCR法又叫等位基因特異PCR,TaqDNA聚合酶缺少:V - 5'外切酶活性,在 一定條件下PCR引物3'末端的錯配導致產物的急劇減少,針對不同的已知突變,分別設計 突變引物、野生引物,2個引物主要是3'末端堿基不同。由于3'末端不配對的引物產物量 減少或不擴增,突變引物和野生引物的Ct值會有顯著差異,通過設定區分野生型和突變型 的閾值,當突變引物與野生引物Ct值差值(ACt)大于閾值時即為突變型。缺點:引物設計 困難,對于多態性位點還有大量GC或AT序列時,往往束手無策,同時結果判斷較為困難。
[0009] HRM法:高分辨率熔解曲線分析技術(High Resolution Melting,HRM),有染料法 和熒光共振能量轉移(FRET)雙探針法等。染料法對熒光染料、PCR儀器要求較高,臨床檢 測比較少用。FRET (fluorescence resonance energy transfer, FRET)探針比較常用,羅氏 專利的FRET探針又稱為雙雜交探針。在SNP位點設計兩條FRET探針,當兩條探針和模版 互補、且相鄰的特異探針組成,上游探針的3'端標記供體熒光基團,相鄰下游探針的5' 端標記Red640受體熒光基團。當復性時,兩探針同時結合在模板上,供體基團和Red640受 體基團緊密相鄰,激發供體產生的熒光能量被Red640基團吸收,使得檢測探頭可以檢測到 Red640發出波長為640的熒光。當變性時,兩探針游離,兩基團距離遠,不能檢測到640波 長的熒光。FRET探針檢測的信號是退火時的實時信號,每次檢測信號始終嚴格對應模版的 數量,非累積信號,可以用于做Tm曲線進行SNP檢測。優點:一個SNP位點基因型,只需要 一管PCR完成檢測;缺點:根據HRM溶解曲線Tm值差異不容易判讀,不同基因型溶解曲線峰 圖差異不明顯。
[0010] MGB-Taqman探針法:Taqman探針是一種經典的定量PCR技術,現階段得到廣泛應 用,在PCR反應體系中加入一對引物的和一個特異性熒光探針,探針只與兩條引物之間特 異性模板結合,利用熒光信號積累實時監測整個PCR過程。探針的5'端連接報告熒光,3' 端連接淬滅熒光,隨后進行實時定量PCR。如果探針能夠與DNA雜交,則在PCR用引物延伸 時,TaqDNA聚合酶5'到3'端的外切酶活性會將探針序列上5'端的報告熒光切下,淬滅 熒光不再能對報告熒光進行抑制,使得報告熒光發光。針對SNP位點分別設計兩個不同熒 光標記突變探針、野生探針,根據突變探針、野生探針熒光信號強度進行SNP位點基因型判 讀。缺點=Taqman探針需要采用MGB-Taqman探針,當SNP位點的上游和下游含有大量GC或 AT堿基時,MGB-Taqman探針的設計和合成非常困難,且價格非常昂貴。


【發明內容】

[0011] 本發明針對現有技術的不足,目的在于提供一種用于快速檢測人類VKORCl和 CYP2C9基因多態性的試劑盒及其使用方法,本發明提供的是一種基于PNA-PCR方法的基因 多態性檢測試劑盒,該試劑盒成本低廉、操作簡單、特異性和敏感性好,能夠快速靈敏地檢 測待測位點基因類型,從而準確對人類VKORCl和CYP2C9基因多態性進行基因分型。
[0012] 為解決上述技術問題,本發明通過如下技術方案實現:
[0013] 一種用于快速檢測人類VKORCl和CYP2C9基因多態性的試劑盒,包括3對引物、3 條探針、6條PNA序列,1對β-Actin內標引物及1條內標探針序列,具體的包括:
[0014] 用于檢測VKORCl基因 -1639G位點的引物序列如SEQ NO. 1、SEQ NO. 2所示,探針 序列如SEQ NO. 7所示,PNA序列如SEQ NO. 10所示;
[0015] 用于檢測VK0RC1基因 -1639A位點的引物序列如SEQ NO. 1、SEQ NO. 2所示,探針 序列如SEQ NO. 7所示,PNA序列如SEQ NO. 11所示;
[0016] 用于檢測CYP2C9基因 430C位點的引物序列如SEQ NO. 3、SEQ NO. 4所示,探針序 列如SEQ NO. 8所示,PNA序列如SEQ NO. 12所示;
[0017] 用于檢測CYP2C9基因 430T位點的引物序列如SEQ NO. 3、SEQ NO. 4所示,探針序 列如SEQ NO. 8所示,PNA序列如SEQ NO. 13所示;
[0018] 用于檢測CYP2C9基因 1075A位點的引物序列如SEQ NO. 5、SEQ NO. 6所示,探針序 列如SEQ NO. 9所示,PNA序列如SEQ NO. 14所示;
[0019] 用于檢測CYP2C9基因 1075C位點的引物序列如SEQ NO. 5、SEQ NO. 6所示,探針序 列如SEQ NO. 9所示,PNA序列如SEQ NO. 15所示;
[0020] 用于β -Actin內標擴增的引物序列如SEQ NO. 16、SEQ NO. 17所示,內標探針序列 如SEQ NO. 18所示。
[0021] 按上述方案,所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒還 包括Mg2+的PCR反應緩沖液、dNTP混合物、Taq酶和ddH 20。
[0022] 按上述方案,所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒 還包括6個不同的陽性對照品和1個陰性對照品,所述陽性對照品為包含有VK0RC1基 因 -1639G、VK0RC1 基因 1639A、CYP2C9 基因 430C、CYP2C9 基因 430T、CYP2C9 基因 1075A 或 CYP2C9基因 1075C的重組質粒和包含有內標基因的重組質粒的混合物,所述陰性對照品為 不包含內標基因和目的基因位點的重組質粒。
[0023] 按上述方案,所述3條探針為Taqman探針,探針5'端的熒光基團為FAM,3'端的 淬滅基團為BHQl。
[0024] 按上述方案,所述1條內標探針為Taqman探針,探針5'端的突光基團為R0X,3' 端的淬滅基團為BHQl。
[0025] -種用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒的使用方法,包括 如下步驟:(1)提取待測人的基因組DNA作為檢測樣品;
[0026] (2)取1個PCR8聯管,在其中A?F 6個管中分別加入檢測樣品,另取一個PCR8 聯管,在A?F 6個管中分別加入6個不同的陽性對照品,再取一個PCR8聯管,在A?F 6 個管中分別加入陰性對照品;
[0027] (3)將PCR8聯管置于熒光PCR儀器中進行熒光PCR擴增反應,采集FAM和ROX熒 光信號;
[0028] (4)結果判斷:a.當陽性對照均有FAM和ROX熒光信號起線,陰性對照均無 FAM和 ROX熒光信號起線,檢測樣品均有ROX熒光信號起線時,判斷試驗成功;b.根據檢測樣品A 管和B管的FAM熒光信號是否起線判斷VK0RC1基因 -1639的分型,根據檢測樣品C管和D 管的FAM熒光信號是否起線判斷CYP2C9基因 430的分型,根據檢測樣品E管和F管的FAM 熒光信號是否起線判斷CYP2C9基因 1075的分型。
[0029] 按上述方案,所述PCR 8聯管中A和B管內含有與檢測人類VK0RC1基因 -1639分 型相關的PCR反應液,所述C管和D管內含有與檢測人類CYP2C9基因 430分型相關的PCR 反應液,所述E管和F管中含有與檢測人類CYP2C9基因 1075分型相關的PCR反應液,所述 PCR反應液包含與檢測基因位點相對應的引物、探針、PNA序列、內標引物及內部探針、Taq 酶、dNTP混合液、Mg2+的PCR反應緩沖液和CldH2O。
[0030] 按上述方案,所述陽性對照品為包含有VK0RC1基因 -1639G、VK0RC1基因 1639A、 CYP2C9 基因 430C、CYP2C9 基因 430T、CYP2C9 基因 1075A 或 CYP2C9 基因 1075C 的重組質粒 和包含有內標基因的重組質粒的混合物,所述陰性對照品為不包含內標基因和目的基因位 點的重組質粒。
[0031] 本發明試劑盒是基于PNA-PCR方法的基因多態性檢測試劑盒,其技術原理是:肽 核酸是(peptide nucleic acids,PNA) -類以多肽骨架取代糖磷酸主鏈的DNA類似物。它 是在第一代、第二代反義試劑的基礎上,通過計算機設計構建并最終人工合成的第三代反 義試劑,是一種全新的DNA類似物,即以中性的肽鏈酰胺2-氨基乙基甘氨酸鍵取代了 DNA 中的戊糖磷酸二酯鍵骨架,其余的與DNA相同,PNA可以通過Watson-Crick堿基配對的形 式識別并結合DNA或RNA序列,形成穩定的雙螺旋結構。由于PNA不帶負電荷,與DNA和 RNA之間不存在靜電斥力,因而結合的穩定性和特異性都大為提高;不同于DNA或DNA、RNA 間的雜交,PNA與DNA或RNA的雜交幾乎不受雜交體系鹽濃度影響,與DNA或RNA分子的雜 交能力遠優于DNA/DNA或DNA/RNA,表現在很高的雜交穩定性、優良的特異序列識別能力、 不被核酸酶和蛋白酶水解。并且PNA與互補DNA具有1個堿基不匹配時,其溶解溫度會下 降8°C?20°C,2個堿基不匹配時則完全不能雜交,當PNA與互補DNA完全匹配時,因其PNA 為肽鏈酰胺2-氨基乙基甘氨酸鍵,所以能夠阻止DNA擴增。本試劑盒利用PNA的這些特性 進行人類VKORCl和CYP2C9基因多態性位點分型,此處以VKORCl基因 -1639分型為例說明 本發明試劑盒的工作原理:首先根據VKORCl基因 -1639G設計PNA序列1 (序列如SEQ ID NO. 10所示),根據VKORCl基因 -1639A設計PNA序列2 (序列如SEQ ID NO. 11所示),然 后對待測基因同時進行兩管PNA-PCR熒光PCR反應(即在進行熒光PCR反應時加入PNA序 列),其中一管PNA-PCR熒光PCR反應中加入PNA序列1,另一管PNA-PCR熒光PCR反應中 加入PNA序列2,當PNA與待測基因的DNA序列相匹配時,熒光PCR反應被阻斷,熒光PCR反 應無起線;當PNA與待測基因的DNA序列不相匹配時,熒光PCR反應順利進行,熒光PCR反 應有起線,因此可以根據兩管熒光PCR反應是否起線來判斷VKORCl基因 -1639的分型,所 述分型為純合野生型(僅一管PCR反應起線)、雜合型(二管PCR反應同時起線)或純合突 變型(僅一管PCR反應起線)。
[0032] 本發明的有益效果:
[0033] (1)利用本發明試劑盒能夠對人類VKORCl和CYP2C9基因多態性位點進行定性檢 測,根據SNP位點進行兩孔PNA-PCR熒光擴增反應,只需根據兩孔熒光曲線是否起線就能進 行結果判斷,不會產生人為誤差,假陽性和假陰性率低,客服了傳統ARMS-PCR方法需要根 據Λ ct值進行結果判斷,結果判定困難的缺點;
[0034] (2)本發明試劑盒所使用的熒光檢測探針為Taqman探針,該探針費用低廉;同時 本發明所有的反應全程閉管操作,PCR反應后不需要進行PCR產物純化、電泳、酶切、雜交 等,在節省了檢測成本的同時,大大縮短了檢測周期,提高了檢測的效率,另外降低了 PCR 產物污染引起假陽性的風險。
[0035] (3)本發明試劑盒中包括內標引物和探針,通過檢測內標基因,減少了因樣本提取 問題導致的假陰性。
[0036] (4)本發明中使用的PNA設計簡單,不需要進行特殊的修飾就可以滿足人類 VKORCl和CYP2C9基因多態性檢測分析。
[0037] (5)本發明試劑盒是采用PNA鉗夾熒光定量PCR技術平臺,相對于測序法、 PCR-RFLP、芯片法更容易實現高通量檢測,更能滿足臨床使用。

【專利附圖】

【附圖說明】
[0038] 附圖1是VKORCl基因 -1639純合野生型擴增曲線。
[0039] 附圖2是VKORCl基因 -1639雜合型擴增曲線。
[0040] 附圖3是VKORCl基因 -1639純合突變型擴增曲線。
[0041] 附圖4是CYP2C9基因 430純合野生型擴增曲線。
[0042] 附圖5是CYP2C9基因 430雜合型擴增曲線。
[0043] 附圖6是CYP2C9基因 430純合突變型擴增曲線。
[0044] 附圖7是CYP2C9基因 1075純合野生型擴增曲線。
[0045] 附圖8是CYP2C9基因 1075雜合型擴增曲線。
[0046] 附圖9是CYP2C9基因 1075純合突變型擴增曲線。
[0047] 附圖10是內標β -Actin基因擴增曲線。 具體實施方案
[0048] 下面對本發明的實施例作詳細說明,本實施例在以本發明技術方案為前提下進行 實施,給出了詳細的實施方式和具體的操作過程,但本發明的保護范圍不限于下述的實施 例。
[0049] 一種用于快速檢測人類VKORCl和CYP2C9基因多態性的試劑盒,試劑盒中包括以 下多態性檢測的3對引物,3條探針、6條PNA序列、1對β-Actin內標引物和1條內標探 針。
[0050] 用于VKORCl基因 -1639G位點檢測的引物、探針和PNA序列:
[0051] 上游引物:AGCAAGAGAAGACCTGAAAAACAAC(SEQ ID NO. 1)
[0052] 下游引物:TGGATCACTTGAGGTCAGGAGTT(SEQ ID NO. 2)
[0053] PNA 序列:ATTGGCCAGGTGC(SEQ ID NO. 10)
[0054] 探針:FAM-CCTCGGCCTCCCAAAATGCTAGGA-BHQ1 (SEQ ID NO. 7)
[0055] 用于VKORCl基因 -1639A位點檢測的引物、探針和PNA序列:
[0056] 上游引物:AGCAAGAGAAGACCTGAAAAACAAC(SEQ ID NO. 1)
[0057] 下游引物:TGGATCACTTGAGGTCAGGAGTT(SEQ ID NO. 2)
[0058] PNA 序列:ATTGGCCGGGTGC(SEQ ID NO. 11)
[0059] 探針:FAM-CCTCGGCCTCCCAAAATGCTAGGA-BHQ1 (SEQ ID NO. 7)
[0060] 用于CYP2C9基因 430C位點檢測的引物、探針和PNA序列:
[0061] 上游引物:GACGCTGCGGAATTTTGG(SEQ ID NO. 3)
[0062] 下游引物:CTACTCCATATCACTGACCTTAC(SEQ ID NO. 4)
[0063] PNA 序列:AGCATTGAGGACTGTG(SEQ ID NO. 12)
[0064] 探針:FAM-TCCACAAGGCAGCGGGCTTCC-BHQ1 (SEQ ID NO. 8)
[0065] 用于CYP2C9基因 430T位點檢測的引物、探針和PNA序列:
[0066] 上游引物:GACGCTGCGGAATTTTGG(SEQ ID NO. 3)
[0067] 下游引物:CTACTCCATATCACTGACCTTAC(SEQ ID NO. 4)
[0068] PNA 序列:AGCATTGAGGACCGTG(SEQ ID NO. 13)
[0069] 探針:FAM-TCCACAAGGCAGCGGGCTTCC-BHQ1 (SEQ ID NO. 8)
[0070] 用于CYP2C9基因 1075A位點檢測的引物、探針和PNA序列:
[0071] 上游引物:TGCAAGACAGGAGCCACATG(SEQ ID NO. 5)
[0072] 下游引物:CATGGAGTTGCAGTGTAGGAGAA(SEQ ID NO. 6)
[0073] PNA 序列:TCCAGAGATACCTTGAC(SEQ ID NO. 14)
[0074] 探針:FAM-CTGCCCCATGCAGTGACCTGTGAC-BHQ1 (SEQ ID NO. 9)
[0075] 用于CYP2C9基因 1075C檢測的引物和PNA序列:
[0076] 上游引物:TGCAAGACAGGAGCCACATG(SEQ ID NO. 5)
[0077] 下游引物:CATGGAGTTGCAGTGTAGGAGAA(SEQ ID NO. 6)
[0078] PNA 序列:TCCAGAGATACATTGAC(SEQ ID NO. 15)
[0079] 探針:FAM-CTGCCCCATGCAGTGACCTGTGAC-BHQ1 (SEQ ID NO. 9)
[0080] 用于β-Actin內標擴增的引物和探針序列:
[0081] 上游引物:TTTTCGGGCCAGCTTTCAG(SEQ NO. ID 16)
[0082] 下游引物:TTTCACACGTGCAATCAAAGG(SEQ ID NO. 17)
[0083] 探針序列:AACCTGACTGAGTTAGATATGCGCTTT(SEQ ID NO. 18)
[0084] 所述人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性檢測劑盒還包括含Mg2+的PCR反應緩沖 液、dNTP混合物、Taq酶和CldH 2O。
[0085] 所述人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性檢測劑盒還包括6個陽性對照品和1個陰 性對照品,所述陽性對照品為包含有VK0RC1基因 -1639G、VK0RC1基因 1639A、CYP2C9基因 430C、CYP2C9基因 430T、CYP2C9基因 1075A或CYP2C9基因 1075C的重組質粒和包含有內 標基因的重組質粒的混合物,所述陰性對照品為不包含內標基因和目的基因位點的重組質 粒。
[0086] 所述的3條探針為Taqman探針,該探針5'端的熒光基團為FAM,3'端的淬滅基團 為 BHQl。
[0087] 所述的內標探針為Taqman探針,該探針5'端的突光基團為R0X,3'端的洋滅基團 為 BHQl。
[0088] 實施例1探針,引物和PNA合成
[0089] 本發明所述探針、引物和PNA均在上海生工工程股份有限公司合成。
[0090] 實施例2試劑盒組成
[0091] 試劑盒的配置采用PCR8聯管形式配置,使用時僅需加入樣本/對照品和CldH2O即 可完成實驗配置,此種配置更為方便快捷,為優選配置。
[0092] 本實施例中試劑盒采用PCR8聯管形式配置,試劑盒配置及PCR8聯管的組成如下 表1、表2所不。
[0093] 表1試劑盒組成
[0094]

【權利要求】
1. 一種用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒,其特征在于,包括 3對引物、3條探針、6條PNA序列,1對β -Actin內標引物及1條內標探針,所述3對引物 的序列如SEQ ID NO. 1?SEQ ID NO. 6所示,所述3條探針的序列如SEQ ID NO. 7?SEQ ID NO. 9所示,所述6條PNA序列如SEQ ID NO. 1(Γ?5所示,所述1對β-Actin內標引物的序 列如SEQ ID NO. 16?SEQ ID NO. 17所示,所述1條內標探針的序列如SEQ ID NO. 18所示。
2. 根據權利要求1所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒, 其特征在于,還包括Mg2+的PCR反應緩沖液、dNTP混合物、Taq酶和ddH20。
3. 根據權利要求1所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒, 其特征在于,還包括6個不同的陽性對照品和1個陰性對照品,所述陽性對照品為包含有 VK0RC1 基因-1639G、VK0RC1 基因 1639A、CYP2C9 基因 430C、CYP2C9 基因 430T、CYP2C9 基因 1075A或CYP2C9基因1075C的重組質粒和包含有內標基因的重組質粒的混合物,所述陰性 對照品為不包含內標基因、VK0RC1和CYP2C9基因多態性位點的重組質粒。
4. 根據權利要求1所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒, 其特征在于,所述3條探針為Taqman探針,探針5'端的突光基團為FAM,3'端的洋滅基團 為 BHQ1。
5. 根據權利要求1所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒, 其特征在于,所述1條內標探針為Taqman探針,探針5'端的熒光基團為R0X,3'端的淬滅 基團為BHQ1。
6. 權利要求1所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒的使用 方法,其特征在于,包括如下步驟: (1) 提取待測人的基因組DNA作為檢測樣品; (2) 取1個PCR8聯管,在其中A~F 6個管中分別加入檢測樣品,另取一個PCR8聯管, 在A~F 6個管中分別加入6個不同的陽性對照品,再取一個PCR8聯管,在A~F 6個管中分 別加入陰性對照品; (3) 將PCR8聯管置于熒光PCR儀器中進行熒光PCR擴增反應,采集FAM和R0X熒光信 號; (4) 結果判斷:a.當陽性對照品均有FAM和R0X熒光信號起線,陰性對照品均無 FAM和 R0X熒光信號起線,檢測樣品均有R0X熒光信號起線時,判斷試驗成功;b.根據檢測樣品A 管和B管的FAM熒光信號是否起線判斷VK0RC1基因-1639的分型,根據檢測樣品C管和D 管的FAM熒光信號是否起線判斷CYP2C9基因430的分型,根據檢測樣品E管和F管的FAM 熒光信號是否起線判斷CYP2C9基因1075的分型。
7. 根據權利要求6所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒的 使用方法,其特征在于,所述PCR 8聯管中A管和B管內含有與檢測人類VK0RC1基因-1639 分型相關的PCR反應液,所述C管和D管內含有與檢測人類CYP2C9基因430分型相關的 PCR反應液,所述E管和F管中含有與檢測人類CYP2C9基因1075分型相關的PCR反應液, 所述PCR反應液包含與檢測基因位點相對應的引物、探針、PNA序列、內標引物及內部探針、 Taq酶、dNTP混合液、Mg2+的PCR反應緩沖液和ddH20。
8. 根據權利要求6所述的用于快速檢測人類VK0RC1和CYP2C9基因多態性的試劑盒的 使用方法,其特征在于,所述陽性對照品為包含有VK0RC1基因-1639G、VK0RC1基因1639A、 CYP2C9 基因 430C、CYP2C9 基因 430T、CYP2C9 基因 1075A 或 CYP2C9 基因 1075C 的重組質 粒和包含有內標基因的重組質粒的混合物,所述陰性對照品為不包含內標基因、VK0RC1和 CYP2C9基因多態性位點的重組質粒。
【文檔編號】C12Q1/68GK104293920SQ201410474967
【公開日】2015年1月21日 申請日期:2014年9月17日 優先權日:2014年9月17日
【發明者】葉倫, 王寧, 劉金水, 李雪梅, 李倩, 陳剛 申請人:武漢康錄生物技術有限公司
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