腸道病毒71型3c嵌合病毒及其拯救方法和應用
【技術領域】
[0001] 本發明屬于生物工程領域，具體涉及一種腸道病毒71型3C嵌合病毒及其拯救方 法和應用。
【背景技術】
[0002] 手足口病是全球性傳染病，世界大部分地區均有此病流行的報道。1957年在新西 蘭首次報道，1958年首次分離出柯薩奇病毒，并于1959年首次提出HFMD命名。早期發現 的手足口病的病原體主要為CoxA16型，手足口病與EV71感染有關的報道開始于20世紀 70年代初，1972年EV71首次在美國確認。此后EV71感染與CoxA16感染交替出現，成為 手足口病的主要病原體。其多發生于5歲以下兒童，可引起手、足、口腔等部位的皰疹，少數 患兒可引起肺水腫、無菌性腦膜腦炎等并發癥。個別重癥患兒病情進展較快，導致死亡。重 癥和死亡病例主要由EV71病毒感染引起。
[0003] 腸道病毒71型?V71)屬于小RNA病毒科（Picornaradae)腸道病毒屬 (Enterovirus)的成員，歸屬于人類腸道病毒A。EV71抗體在成人血清中的陽性率達到65% 以上，說明了這種病毒的廣泛傳播，每年春夏季溫度升高時都會進入感染高峰期，流行趨勢 從散發逐漸趨于有小型聚集性爆發。
[0004] 手足口病的相關科研工作起步較晚，發達國家擁有較好的科研平臺，亞太地區為 主要流行區域，但對EV71的基礎研究投入不夠，至今在臨床上還沒有有效的疫苗和藥物， 對EV71進行有效的預防和控制。由于腸道病毒71型屬于小RNA病毒科，所以其基因組的 人工操作較難，這給疫苗的制備增加了難度。
[0005] 因此目前對EV71的疫苗研究仍主要聚焦在傳統的滅活疫苗上，而此類疫苗的免 疫效果一般較低；雖然能夠誘導產生包括中和抗體在內的免疫反應，但不能誘導細胞毒T 淋巴細胞反應；誘導產生的免疫反應持續時間較短，需要多次接種；需要使用佐劑，制劑中 存在滅活劑，滅活劑對病毒抗原有影響；由于誘導的免疫反應水平較低，以及各個抗原成分 之間的疫苗應答不平衡，可能誘發疾病；一般不能通過自然途徑接種，不易產生局部免疫反 應。由于以上問題的存在，亟需研發新型疫苗，既能保留完整的免疫原性，有效刺激免疫應 答，又能避免感染性。此類疫苗的研制，需要對病毒基因組中各基因編碼區域的功能進行深 入研究和了解，這種深入了解還有助于篩選抗病毒藥物的靶點研究。
[0006] 反向遺傳學方法研究RNA病毒，是在質粒水平上來操作、研究RNA病毒，獲得的拯 救病毒表型穩定，操作方便，為EV71的深入研究提供了一個很好的基礎平臺。但迄今還沒 有合適的病毒作為疫苗研究的工具。
[0007] 現有技術中沒有研究者做EV71拯救病毒的，主要是存在技術偏見EV71的反向遺 傳學研究是無法實現的，此外由于EV71拯救病毒是一種新的病毒，所以在研究拯救方法時 就存在很大的不可預期性，如何克服這種不可預期性是現有技術中無法做到的。

【發明內容】

[0008] 本發明的目的就是為了提供一種腸道病毒71型3C嵌合病毒及其拯救方法和應 用。
[0009] 為了實現上述目的，本發明采用如下技術方案：
[0010] 一種腸道病毒71型3C嵌合病毒，拉丁文學名：(Humanenterovirus71 3C chimericvirus)，保藏單位名稱：中國典型培養物保藏中心，保藏單位地址：湖北省武漢市 武漢大學校內，保藏日期：2015年6月24日，保藏編號：CCTCCNO.V201521。
[0011] 本發明病毒的形態特征描述：
[0012] 該病毒的顆粒為二十面體立體對稱的球形結構，無包膜和突出，直徑約24~ 30nm，核酸為單股正鏈RNA。EV71型病毒基因組編碼的四種結構蛋白VPl~VP4構成原聚 體，后者再拼裝成具有五聚體樣結構的亞單位，60個亞單位通過各自的結構域相互連接，最 終形成病毒的外殼。該病毒感染敏感細胞RD細胞后，形成的CPE特征為細胞變圓、固縮、折 光性增強，然后脫落。
[0013] 一種腸道病毒71型3C嵌合病毒的構建方法，步驟如下：
[0014] (1)以SDLYl(GenBank，HM188481. 1)全長cDNA為PCR模板，引物 1 (序列見表 2， SEQIDNo. 1)為上游引物，引物2 (序列見表2,SEQIDNo. 2)為下游引物擴增SDLYl株的 3C；
[0015] (2)以SDLY107(GenBank，JX244186. 1)全長cDNA為PCR模板，引物 3(序列見表 2,SEQIDNo. 3)為上游引物，引物4(序列見表2,SEQIDNo. 4)為下游引物擴增SDLY107 株的3D-3'UTR片段；
[0016] (3)采用融合PCR方法，以引物1(SEQIDNo. 1)為上游引物，引物4(SEQIDNo.4) 為下游引物將兩個片段連接起來得到融合片段3C(l)-3D-3'UTR(107);
[0017] (4)將（3)中融合PCR產物3C⑴-3D-3'UTR(107)克隆連接入pMD19-T載體，形 成pMD19-T-3C(l)-3D-3'UTR(107);
[0018] (5)將pMD19-T-SDLY107質粒以及步驟⑷得到的pMD19-T-3C(l)-3D-3'UTR(107) 質粒分別進行HindIII和XbaI雙酶切，回收酶切片段后，利用T4連接酶進行連接獲得重組 病毒質粒pMD19-T-107(l-3C);
[0019] (6)將步驟（5)得到的pMD19-T-107(l-3C)進行質粒擴增，并使用HindIII和XbaI 雙酶切，回收107 (1-3C)，體外轉錄后轉染入RD細胞，37°C、5%CO2細胞培養箱中培養，傳代 3次以上直至細胞病變穩定即為腸道病毒71型3C嵌合病毒。
[0020] 所述步驟（5、6)中酶切的具體步驟如下：HindIII與XbaIFastDigestenzyme各 2. 5yL，質粒（5 中為pMD19-T-SDLY107質粒和pMD19-T-3C(l)-3D-3'UTR(107)質粒；6 中為 pMD19-T-107(l-3C)質粒）〈2.5yg，10XFastDigestGreenBuffer5yL，水補齊至50yl， 37°C酶切 3-4h。
[0021] 所述步驟（5)中具體為：將pMD19-T-107(l_3C)進行質粒擴增后雙酶切得到 107 (1-3C)、體外轉錄后進行RNA轉染，RD細胞轉染RNA后，37°C二氧化碳培養箱中培養以期 病毒的拯救，通過每日觀察細胞病變發現拯救病毒顆粒的出現，當CPE達到90%病變時，凍 融一次（避免多次凍融）收獲上清即為第一代拯救病毒；取第一代拯救病毒接種細胞培養 板中（優選取500y1接種24孔細胞培養板中），放入37°C二氧化碳培養箱中繼續培養，培 養5天后未出現明顯的CPE，凍融一次（避免多次凍融），10,OOOg離心IOmin收獲上清，命 名為二代拯救病毒；繼續上述步驟接種二代病毒，約36h后出現病變，72h后病變達到90 %，凍融三次收獲病毒。反復操作傳代3次以上直至細胞病變穩定即為拯救成功的病毒。
[0022] 上述腸道病毒71型3C嵌合病毒在制備疫苗中的應用。
[0023] 本發明的有益效果：
[0024] 腸道病毒71型3C嵌合病毒的拯救提供了一個研究平臺。EV71的3C嵌合病毒株 為研究3C編碼區在病毒致病機制中的作用、抗病毒藥物研究和疫苗研制均提供了研究平 臺。并為其他同類病毒的拯救提供了技術方法。
【附圖說明】
[0025] 一種腸道病毒71型3C嵌合病毒，拉丁文學名：(Humanenterovirus71 3C chimericvirus)，保藏單位名稱：中國典型培養物保藏中心，保藏單位地址：武漢市武昌珞 珈山武漢大學，保藏日期：2015年6月24,保藏編號：CCTCCNO.V201521。
[0026] 圖1為pMD19-T-107全長質粒圖；
[0027] 圖2擴增EV71全長基因組的示意圖。
【具體實施方式】
[0028] 下面結合實施例對本發明作進一步說明。
[0029] 1材料與方法
[0030] I. 1實驗材料
[0031] I.I. 1細胞與病毒
[0032] 所用細胞為人橫紋肌肉瘤細胞（rhabdomyosarcomacells，RD)。RD細胞生長 至對數生長期時接種病毒，待細胞病變至80%左右時，-40°C和室溫之間反復凍融三次后 4°C10,OOOg離心10分鐘收獲，儲存于_80°C冰箱中。
[0033] I. 1. 2實驗試劑
[0034] 所用主要試劑為病毒RNA提取試劑盒（OMEGA,中國）、DNA膠回收試劑盒和質粒提 取試劑盒（0MEGA，中國）；逆轉錄試劑盒（T0Y0B0，日本）；體外轉錄試劑盒（Promega，美 國）；高效保真酶PrimeSTARGXLDNAPolymerase、pMD19_T(TaKaRa,中國）；限制性內切 酶、轉染試劑（Thermo,美國）；細胞培養基、血清（HyClone，美國）；引物由上海生工生物工 程股份有限公司合成；測序由上海博尚生物技術公司完成。
[0035] 1.2實驗方法
[0036]L2. 1 擴增EV71SDLY107 與SDLYl株病毒的cDNA
[0037] 使用OMEGA公司的ViralRNAkit試劑盒提取SDLY107與SDLYl株病毒的RNA，使 用T0Y0B0 公司的ReverTraAceqPCRKi