專利名稱：用于檢測和鑒定分枝桿菌的寡聚核苷酸的制作方法
技術領域：
本發明所涉及的是用于檢測和鑒定分枝桿菌的寡聚核苷酸。更具體地說，本發明用來鑒定非結核分枝桿菌的ITS(Internal Transcribed SpacerRegion，內轉錄間隔區)的核苷酸序列，這些非結核分枝桿菌包括偶發分枝桿菌(Mycobacterium fortuitum)，龜分枝桿菌(Mycobacteriumchelonae)，膿腫分枝桿菌(Mycobacterium abscessus)，牝牛分枝桿菌(Mycobacterium vaccae)，變黃分枝桿菌(Mycobacterium flavescens)，亞洲分枝桿菌(Mycobacterium asiaticum)，豬分枝桿菌(Mycobacteriumporcinum)，阿加普爾分枝桿菌(Mycobacterium acapulcensis)和迪氏分枝桿菌(Mycobacterium diernhoferi)。通過這些分枝桿菌的寡聚核苷酸引物或探針。
背景技術：
盡管結核病人數近年來穩步地減少，但每年仍有約8,000,000人患結核病，且有3,000,000患者死亡。在不發達國家，由于不適當的治療和缺少用于治療結核病的藥物，使患耐藥菌的慢性病人數增加。在20世紀80年代，甚至在發達國家，由于愛滋病的傳播，也使患結核病的人數增加。因此在這種情況下，可以預測，在2001年將會有約12,000,000新結核病患者出現(《結核與肺病》J.P.Natain，M.C.Raviglione，和A.Kochi，73311-321，1992；《全球疾病負擔》《全球疾病與損傷的負擔系列從書》第一卷，Murray CJL.和Lopez AD著，劍橋，馬薩諸塞，哈佛大學出版社，1996，P349-350；《世界結核病計劃抗結核病藥物的耐藥性》世界衛生組織1997年報告)。
在20世紀50年代曾報道非結核病分枝桿菌(NTM)能使人致病。在1980年又有報道，鳥分枝桿菌(MAC)能引起愛滋病患者全身性疾病，從此，非結核分枝桿菌引起了人們的關注。非結核分枝桿菌所引起的疾病在臨床癥狀和體癥以及一般病理方面與結核病相似。非結核分枝桿菌廣泛地分布于有生命的環境中，而且在臨床實驗樣本中很難判斷它們是否能致病。由于它們對于很多抗結核的藥物具有耐藥性，它們所引起的感染病很難治愈，復發率也高。非結核分枝桿菌所引起傳染病應該用不同于結核病的方法治療。因此需要建立準確而快速的檢測和鑒定非結核分枝桿菌的方法。同時也需要建立準確而快速的檢測和鑒別結核菌(TBcomplex)和NTM的方法以便于結核病的有效治療。
到目前為止，已有很多用于診斷分枝桿菌感染和用于檢測、鑒定分枝桿菌菌株的方法。其中，下面的方法目前仍在應用第一為微生物學方法，也就是，涂片、染色和培養試驗。然而，這種方法不適于分枝桿菌，因為它們的繁殖周期長又需要很長的培養時間。象分枝桿菌這樣的致病菌也能傳染給培養室內的工作人員。
第二為PCR(聚合酶鏈式反應)方法。這種方法不僅對分枝桿菌有高敏感性和特異性，而且非常適用于需要長時間培養的分枝桿菌。特別是，這種方法不需要培養過程，但需要能用于放大的小量DNA，因此，只需要實驗樣品中的小量病原體DNA就足以檢測和鑒定分枝桿菌。很多PCR實驗需要彼此不同的靶DNA引導。IS6110和16S rRNA經常用作靶DNA(《spoligotyping(字典未收錄)的用途，用于鑒別IS6110低拷貝量的結核分枝桿菌(丹麥培養)》Bauer J，Andersen AB，Kremer K和Miorner H，1999，《臨床微生物學雜志》372602-2606；《以高密度DNA探針系列鑒定分枝桿菌和實驗利福平抗藥性》Troesch，A.，H.Nguyen，C.G.Miyada，S.Desvarenne，T.R.Gingeras，P.M.Kaplan，P.Cros and C.Mabilat，1999《臨床微生物學雜志》3749-55)；第三為物理化學方法。在實驗中用HPLC(高效液相色譜)，GC(氣相色譜)或質譜來檢測分枝桿菌的脂類成分。這種方法特異性好，但需要昂貴的設備。
第四為用血清學方法檢測分枝桿菌成份。這種方法是基于帶有抗體的膠乳顆粒或血細胞與分枝桿菌抗原的凝固反應或酶與抗體相連的酶聯免疫反映。但這種方法只是在有限的位置上高度敏感，且很難區別是以前感染還是現在感染。
下一個檢測分枝桿菌的方法是用插入了熒光素酶基因的分枝桿菌噬菌體L5感染分枝桿菌，然后檢查介質中的熒光素所引起的發光現象(W.R.Jacobs，R.G.Barletta，R.Udani，J.Chan，G·Kalkut，G.Sosne，T.Kieser，G.J.Sarkis，G.F.Hatful，and B.R.Bloom.1993，《科學260》819-822)最后一個方法為通過寡聚核苷酸雜交來檢測和鑒定分枝桿菌(A.Troesch，H.Nguyen，C.G.Miyada，S.Desvarenne，T.R.Gingeras，P.M.Kaplan，P·Cros和C.Mabilat.1999《臨床微生物學雜志》3749-55除了上面提到的鳥分枝桿菌(MAC)外，偶發分枝桿菌，龜分枝桿菌，地分枝桿菌和牝牛分枝桿菌也稱作非結核分枝桿菌。其中，龜分枝桿菌又分成龜分枝桿菌和膿腫分枝桿菌，目前還沒有區分它們的方法。

發明內容
本發明的目的是為了解決上述分枝桿菌檢測和鑒定方法中存在的問題，本發明意在提供作為PCR引物或探針的特異寡聚核苷酸。這些寡聚核苷酸用于檢測分枝桿菌，鑒別結核菌(TB complex)和NTM以及準確而有效地鑒定分枝桿菌的種類。
為此本發明提供了一些分枝桿菌基因ITS(內轉錄間隔區)的DNA，列于SEQ ID NOs(序列辨認號碼)1至9中。這些分枝桿菌包括，偶發分枝桿菌，龜分枝桿菌，膿腫分枝桿菌，牝牛分枝桿菌，變黃分枝桿菌，亞洲分枝桿菌，豬分枝桿菌，阿加普爾分枝桿菌和迪氏分枝桿菌。
本發明還提供了作為PCR引物或雜交探針的寡聚核苷酸，用來檢測分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs10至14中；用來鑒別結核菌和分枝桿菌中的NTB的，列于SEQ ID NOs15至23中；用于檢測和鑒定MAC(鳥分枝桿菌)和胞內分枝桿菌的列于SEQ IDNOs24至27中；
用于檢測和鑒定偶發分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs28至38中；用于檢測和鑒定龜分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs39至46中；用于檢測和鑒定膿腫分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs47至52中；用于檢測和鑒定牝牛分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs53至64中；用于檢測和鑒定變黃分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs65至72中；用于檢測和鑒定戈氏分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs73至77中；用于檢測和鑒定地分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs78至100中；用于檢測和鑒定瘰疬分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs101至108中；用于檢測和鑒定堪薩斯分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs109至112中；用于檢測和鑒定斯氏分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs113至116中；用于檢測和鑒定海分枝桿菌和潰瘍分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs117至119中用于檢測和鑒定胃分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs120至123中；用于檢測和鑒定蟾分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs124至133中；用于檢測和鑒定日內瓦分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs134至141中；用于檢測和鑒定瑪爾摩分枝桿菌的，列于SEO ID NOs142至146中用于檢測和鑒定猿分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs147至153中；用于檢測和鑒定恥垢分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs154至165中；用于檢測和鑒定石氏分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs166至172中；用于檢測和鑒定哈瓦那分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs173至180中；用于檢測和鑒定鼻疽分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs181至189中；用于檢測和鑒定亞洲分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs190至193中；用于檢測和鑒定豬分枝桿菌的，列于SEO ID NOs194至205中；用于檢測和鑒定阿加普爾分枝桿菌的，列于SEO ID NOs206至215中；用于檢測和鑒定迪氏分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs216至227中；
用于檢測和鑒定副結核分枝桿菌的，列于SEQ ID NOs228至240種；最后，用于檢測酒精分枝桿菌的，列于SEQ ID NO241以往用PCR檢測和鑒定分枝桿菌的方法，只能檢測一或二個菌種。而本發明能檢測和鑒定幾乎所有的分枝桿菌，這是由于本發明的引物和探針是根據分枝桿菌的ITS的DNA序列設計的。ITS比16S rRNA有更多的多態區而且ITS也有保守區，因此作為一種靶DNA，它(ITS)能非常有效地鑒別基因型(Gurtler，V.，和V.A.Stanisich，1996，《一種用16S-23SrDNA間隔區分類和鑒定細菌的新方法》《微生物》1423-16)發明者對一些還沒有對DNA測序的非結核分枝桿菌的ITS DNA序列進行測定，這些非結核分枝桿菌包括象偶發分枝桿菌，龜分枝桿菌，膿腫分枝桿菌，牝牛分枝桿菌，變黃分枝桿菌，亞洲分枝桿菌，豬分枝桿菌，阿家譜爾分枝桿菌和迪氏分枝桿菌。通過這些DNA序列設計引物或探針的寡聚核苷酸以檢測和鑒定分枝桿菌。并且進一步參考基因庫中的另一些分枝桿菌的DNA序列，并通過多序列對比和未成熟細胞檢查(Multialignment and Blast)分析這些DNA序列，從而選擇有特色的多態區，來設計用于檢測和鑒定分枝桿菌的引物和探針的寡聚核苷酸。最后通過種特異性和屬特異性PCR引物放大和特異雜交實驗確證這些寡聚核苷酸對分枝桿菌的檢測和鑒定效果。
也就是說，本發明的寡聚核苷酸探針(結合到固相基質中)，它們只能與特異的分枝桿菌中的ITS核苷酸序列進行雜交，因此它們能敏感地檢測和鑒定特異的分枝桿菌。通過PCR放大，與上述探針有相同核苷酸序列的寡聚核苷酸引物也能檢測和鑒定特異的分枝桿菌。應用這些依據分枝桿菌ITS制備的寡聚核苷酸引物或探針，便能夠準確而有效地檢測分枝桿菌，鑒別結核菌與NTM，和鑒定分枝桿菌的種類。


關于本發明的上述和其他方面的目的、其特點和優勢是明顯的，這可從下列的較實例和附圖中得到詳細闡述，其中，圖1為圖解，圖中為分枝桿菌ITS和通過PCR放大ITS的引物；
圖2為PCR后的電泳結果照片，PCR用了幾個分枝桿菌種株和一對用于ITS放大的引物，包括分枝桿菌中16SrRNA和23SrRNA的一部分；圖3為PCR后的電泳結果照片，PCR用了幾個分枝桿菌種株和用于檢測分枝桿菌的一對引物(ITSF和MYC2)；圖4為多重PCR圖解，多重PCR用于檢測分枝桿菌，同時鑒別結核菌與NTM；圖5為多重PCR后的電泳結果照片，多重PCR采用了一對檢測分枝桿菌的引物(ITS和MYC2)以及一對鑒別結合菌和NTM的引物(MTB2和MYC2)；圖6為PCR后的電泳結果照片，PCR用了每一種分枝桿菌和每一對種特異性引物，這些引物是依據每一種NTM的多態區核苷酸序列設計的。
圖7為PCR后的電泳結果照片，PCR用了幾種分枝桿菌和一對種特異性引物，這些引物是根據每種NTM的多態區核苷酸序列設計的。
具體實施例方式
下面將通過實施例介紹本發明的一些較好的例子和其參考附圖。
例1.分枝桿菌培養和基因組DNA分離分枝桿菌標準菌種來源于KCTC(韓國模式菌種收藏)和ATCC(美國模式菌種收藏)，臨床菌種來源于韓國國家結核協會，國家Masan結核病醫院以及Pusan國立大學醫院的臨床微生物學專家管理菌種的儲藏和培養。例中所用的分枝桿菌和病原體列于表8中。
分枝桿菌DNA的提取過程如下以Ogawa培養基培養分枝桿菌。然后將一鉑環培養后的菌種置于微量離心管中，并與200μl的InstaGene基質(Bio-Rad Co.)混合，56℃孵育30分。再經過10分鐘的渦流混合，混合物放于100℃，8分鐘。再經過10分鐘渦流混合后，將混合物于12,000rPM離心3分鐘。取其上清放于另一試管中，并放于-20℃保存。在下面的PCR中，將用每個菌種的DNA溶液2μl。
例2.放大分枝桿菌ITS制造引物分枝桿菌ITS及通過PCR放大ITS所用的引物列于圖1中。依據分枝桿菌16SrRNA和23SrRNA保守區的幾個片斷來構建用于放大分枝桿菌ITS地引物。并通過多序列對比和未成熟細胞檢查分析基因庫分枝桿菌16SrRNA和23SrRNA的DNA序列。然后，通過16SrRNA和23SrRNA的一部分DNA設計引物，從而能選擇性地放大約500bp的ITS區，這些引物的DNA序列列于SEQ ID NOs242(IT SF)和243(ITSR)中。本例中所用的所有引物是通過Derkin-Elmer DNA合成儀(BioBasic，加拿大)制備，濃度達50nmol。
例3.PCR和產品鑒定在PCR中使用例1中的2μl DNA溶液。反應液包括500mM KCl，100mM Tris HCl(pH9.0)，1％Triton X-100，0.2mM dNTP(dATP，dGTP，dTTP和dCTP)，1.5mM MgCl2，1pmol引物，1μTag DNA聚合酶(Bio BasicInc.)。94℃變性5分鐘后，溶液在94℃變性1分鐘，60℃退火1分鐘和72℃延長1分鐘條件下循環30次。再進一步72℃延長10分鐘，確保延長結束。反應完畢后，通過1.5％瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR產物。象從GenBank(基因庫)資料所預測的那樣，通過16S rRNA和23S rRNA的保守區所制備的引物所放大的ITS為約500bP。
圖2是PCR后的電泳結果照片。PCR采用了幾個分枝桿菌種株和一對ITS放大引物，包括分枝桿菌16S rRNA和23S rRNA的一部分。圖中，M是分子量標準，間隔100bP，C為對照組，泳道1至9分別是偶發分枝桿菌、龜分枝桿菌、胞內分枝桿菌、鳥分枝桿菌、結核分枝桿菌、田野分枝桿菌、堪薩斯分枝桿菌、戈氏分枝桿菌和結核分枝桿菌H37Rv。可以看到除對照C外，泳道1至9的所有分枝桿菌皆有ITS基因放大現象。
例4.分枝桿菌ITS DNA序列測定PCR產品鑒定后，分枝桿菌(其ITS的DNA沒有測序)反應物將通過PCR放大，這些分枝桿菌包括偶發分枝桿菌、龜分枝桿菌、膿性分枝桿菌、牝牛分枝桿菌、變黃分枝桿菌、亞洲分枝桿菌、豬分枝桿菌、阿加普爾分枝桿菌和迪氏分枝桿菌。PCR產品則直接用于測定ITS的DNA序列。
DNA的測定濃度為200μmol。DNA序列測定采用染料終止法，同時應用通用引物M13和DNA自動測序儀(Perkin-Elmer，ABI prim 377sequencer)。
序列鑒別號碼(SEQ ID Nos)1至9分別指下列分枝桿菌ITS的DNA序列偶發分枝桿菌、龜分枝桿菌、膿腫分枝桿菌、牝牛分枝桿菌、變黃分枝桿菌、亞洲分枝桿菌、豬分枝桿菌、阿加普爾分枝桿菌和迪氏分枝桿菌。
例5.寡聚核苷酸引物的設計及合成每一個引物，大約20bp，依據例4中分枝桿菌的ITS的DNA序列設計，這些分枝桿菌包括偶發分枝桿菌、龜分枝桿菌、膿腫分枝桿菌、牝牛分枝桿菌、變黃分枝桿菌、亞洲分枝桿菌、豬分枝桿菌、阿加普爾分枝桿菌和迪氏分枝桿菌。并且通過多序列對比和未成熟細胞檢查，比GenBank(基因庫)的其它分枝桿菌ITS的DNA序列比較。
根據需要，分枝桿菌ITS保守區DNA序列設計成檢測分枝桿菌的引物或探針，而高多態區的DNA序列則設計成種特異性的引物或探針。表1至7描述了所設計的引物或探針以及它們的位置和序列鑒別號碼。
表1

表2

表3

表4

表5

表6

表7

例6.用于檢測分枝桿菌的引物的PCR結果通過分枝桿菌保守區DNA序列所設計的屬特異性引物，可用于檢測分枝桿菌。依據270-350bp所組成的ITS序列所制備的引物當中，一對引物，ITSF(序列鑒別號242)和MYC2(序列鑒別號11)被用于PCR。結果得到時了分枝桿菌的約350bp的放大了的核苷酸，同時在金黃色葡萄球菌、尿腸球菌和粘質沙雷氏菌中沒有放大現象。因此說明這種引物可用于檢測分枝桿菌。
表3是PCR后電泳結果的照片，PCR采用了幾個分枝桿菌種株和一對用于檢測分枝桿菌的引物(ITSF和MYC2)。圖中M為100bp梯度分子量標準；C為陰性對照；泳道1為膿腫分枝桿菌ATCC19977；泳道2為田野分枝桿菌ATCC27406；泳道3為亞洲分枝桿菌ATCC25276；泳道4為南非分枝桿菌ATCC33464；泳道5為鳥分枝桿菌ATCC25291；泳道6為牛分枝桿菌ATCC19210；泳道7為龜分枝桿菌ATCC35752；泳道8為變黃分枝桿菌ATCC14474；泳道9為偶發分枝桿菌ATCC6841；泳道10為戈氏分枝桿菌ATCC14470；泳道11為胞內分枝桿菌ATCC13950；泳道12為堪薩斯分枝桿菌ATCC12478；泳道13為草分枝桿菌ATCC354；泳道14為瘰疬分枝桿菌ATCC19981；泳道15為恥垢分枝桿菌ATCC21701；泳道16為斯氏分枝桿菌ATCC35799；泳道17為地分枝桿菌ATCC15755；泳道18為次要分枝桿菌ATCC23292；泳道19為結核分枝桿菌H37Rv；以及泳道20為牝牛分枝桿菌ATCC15483。從圖中可見，除陰性對照外，從泳道1至20的所有分枝桿菌皆呈ITS放大現象。
表8為通過一對檢測分枝桿菌的引物(ITSF和MYC2)的PCR結果。表中，+表示放大出現；-表示沒有放大現象。可見，除分枝桿菌外的其它菌種皆無放大現象出現。
表8

例7.用于結核菌的引物的PCR結果前面例子中制備的寡聚核苷酸引物，被用來鑒定每一個菌種，并且通過PCR放大實驗證實了這些實驗的可靠性。為了鑒定結核菌(TBCOMPLEX)，采用了多重PCR，應用一對檢測分枝桿菌的引物(ITSF和MYC2)和一對鑒別結核菌(TB COMPLEX)和NTM的引物(MTB2和MYC2，序列鑒別號16和11)圖4為多重PCR圖解，多重PCR用于檢測分枝桿菌，同時也用于鑒別結核菌(TB COMPLEX)和NTM。
圖5為多重PCR后的電泳結果照片。多重PCR用一對引物(ITSF和MYC2)檢測分枝桿菌，另一對引物(MTB2和MYC2)鑒別結核菌(TBCOMPLEX)和NTM。圖中，M為100bp梯度的分子量標準；C為陰性對照；泳道1和2分別為結核菌(TB COMPLEX)，結核分枝桿菌H37Rv和牛分枝桿菌；泳道3至10分別為鳥分枝桿菌、胞內分枝桿菌、偶發分枝桿菌、龜分枝桿菌、戈氏分枝桿菌、斯氏分枝桿菌、地分枝桿菌和瘰疬分枝桿菌ATCC19981。泳道1和2的結核菌，由于2次放大而形成2條帶，這2次放大分別是由檢測分枝桿菌的引物和鑒別結核菌引物引發。而在其它泳道的NTM菌株只形成一條帶，這說明只有一次放大。
例8.用于鑒定NTM種株的引物的PCR結果應用鑒定NTM種株的種特異性的引物進行PCR，這種引物依據每一菌株的多態區DNA序列制備。
每一個分枝桿菌應用一對引物進行PCR，其中第一個為有義鏈，第二個為反義鏈。具體如下選用序列鑒別號16和21鑒定結核分枝桿菌H37Rv和牛分枝桿菌；序列鑒別號24和27鑒別鳥分枝桿菌和胞內分枝桿菌；序列鑒別號29和39鑒別偶發分枝桿菌；序列鑒別號41和44鑒別龜分枝桿菌；序列鑒別號48和49鑒別膿腫分枝桿菌；序列鑒別號55和63鑒別牝牛分枝桿菌；序列鑒別號66和72鑒別變黃分枝桿菌；序列鑒別號73和75鑒別戈氏分枝桿菌；序列鑒別號88和96鑒別地分枝桿菌；序列鑒別號102和103鑒別瘰疬分枝桿菌；序列鑒別號109和110鑒別堪薩斯分枝桿菌；序列鑒別號113和114鑒別斯氏分枝桿菌；序列鑒別號117和119鑒別海分枝桿菌和潰瘍分枝桿菌；序列鑒別號120和123鑒別胃分枝桿菌；序列鑒別號128和132鑒別蟾分枝桿菌；序列鑒別號135和141鑒別日內瓦分枝桿菌；序列鑒別號143和145鑒別瑪爾摩分枝桿菌；序列鑒別號147和149鑒別猿分枝桿菌以及序列鑒別號154和159鑒別恥垢分枝桿菌。PCR完成后，指每一個反應產物進行電泳分析。
圖6為PCR后的電泳結果照片。PCR采用每一種分枝桿菌和每一對種特異的引物，這種引物依照每一個NTM的多態區核苷酸序列設計的。圖中，M為100bp梯度分子量標準；C為陰性對照，泳道1和2分別為結核菌，結核分枝桿菌H37Rv和牛分枝桿菌ATCC19210；泳道3和4分別為鳥分枝桿菌ATCC25291和胞內分枝桿菌ATCC13950；泳道5為偶發性分枝桿菌ATCC6841；泳道6為龜分枝桿菌ATCC35752；泳道7為膿腫分枝桿菌ATCC19977；泳道8為牝牛分枝桿菌ATCC15483；泳道9為變黃分枝桿菌ATCC14474；泳道10為戈氏分枝桿菌ATCC14470；泳道11為地分枝桿菌ATCC15755；泳道12為瘰疬分枝桿菌ATCC19981；泳道13為堪薩斯分枝桿菌ATCC12478；泳道14為斯氏分枝桿菌ATCC35799；泳道15為海分枝桿菌ATCC927；泳道16為潰瘍分枝桿菌ATCC19423；泳道17為胃分枝桿菌ATCC15754；泳道18為蟾分枝桿菌ATCC19250；泳道19為日內瓦分枝桿菌ATCC1233；泳道20為瑪爾摩分枝桿菌ATCC29571；泳道21為猿分枝桿菌ATCC25275；以及泳道22為恥垢分枝桿菌ATCC21701。種特異放大現象可見于泳道1至22。
圖7為PCR后的電泳結果照片。PCR采用幾種分枝桿菌和一對依每一種NTM多態區核苷酸序列所設計的種特異性引物。圖中，第一張照片采用一對對結核菌特異的引物(ITSF和MYC2)，泳道1和2的結核分枝桿菌H37Rv和牛分枝桿菌呈放大現象；第二張照片采用一對對鳥分枝桿菌和胞內分枝桿菌特異的引物(MAC1和MAC4)，泳道3和4的鳥分枝桿菌和胞內分枝桿菌呈放大現象；第三張照片采用一對對偶發分枝桿菌特異的引物(FOR2和FOR10)，泳道5的偶發分枝桿菌呈放大現四張采用一對對龜分枝桿菌特異的引物(CHE3和CHE6)，泳道6的龜分枝桿菌呈放大現象；第五張采用一對對戈氏分枝桿菌特異的引物(GOR1和GOR2)，泳道7的戈氏分枝桿菌呈放大現象；第六張采用一對對斯氏分枝桿菌特異的引物(SZU1和SZU2)，泳道8的斯氏分枝桿菌呈放大現象；第七張采用一對對瘰疬分枝桿菌特異的引物(SC01和SC02)，泳道10的瘰疬分枝桿菌呈放大現象。泳道9為地分枝桿菌，與上述的種特異引物比較，無放大現象出現。
因此，采用每一對種特異性引物時，PCR可以檢測和特異性地鑒定每一種株的分枝桿菌。
如上所述，首先測定非結核分枝桿菌的ITS(內轉錄間隔區)的DNA序列，然后在通過這些DNA序列，設計寡聚核苷酸引物或探針，來檢測和鑒定分枝桿菌，這些非結核分枝桿菌包括偶發分枝桿菌、龜分枝桿菌、膿腫分枝桿菌、牝牛分枝桿菌、變黃分桿枝菌、亞洲分枝桿菌、豬分枝桿菌、阿加普爾分枝桿菌和迪氏分枝桿菌。所以應用PCR引物或雜交探針，可以檢測分枝桿菌，鑒別結核菌和NTM以及快速而有效地鑒定分枝桿菌種株。這種檢測和鑒別方法能有效地診斷復雜的感染，因此能夠準確地治療分枝桿菌感染，包括結核病。
通過這些目前被認為是最實用和有效的例子來闡述本發明時，應該注意到本發明的權力要求不限于這些例子。恰恰相反，本發明不僅覆蓋附加權力要求的范圍和宗旨，還覆蓋對它們的各種修改和相同的構思。
序列表<110>KIM，Jeong Joon；SJ HIGHTECH Co.，Ltd.
KIM，Cheol MinPARK，Hee Kyung<120>(Oligonucleotide for detection and identification of Mycobacteria)用于檢測和檢定分枝桿菌的寡聚核苷酸<130>PP05020/PCT<150>KR 10-<151>1999-05-29<150>KR 10-<151>1999-05-29<150>KR 10-<151>1999-05-29<150>KR 10-<151>1999-05-29<150>KR 10-<151>1999-05-29<150>KR 10-<151>2000-04-07<160>243<170>KopatentIn 1.71<210>1<211>386<212>DNA<213>(Mycobacterium fortuitum)偶發分枝桿菌<400>1aggagcacca cgaaaagggt tgagacactg ggtcttaccc gagccgtgag gaaccggttg 60cctgtagtgg gcacggtttg gtgcacaaca aacttttttg actgccagac acactattgg120gctttgagac aacaggcccg tgcccctttt ggggggtggc atccggttgc gggtgtcggc180gtgttgttgc ctcactttgg tggtggggtg tggtgtttga tttgtggata gtggttgcga240gcatctagca cgcagaatcg tgtggtctca ctccttgtgg gtggggctgg ttttgtgtgt300tgatgtgcaa tttcttttga aactcatttt tggtttttgt gttgtaagtg tttaagggcg360catggtggat gccttggcag gatcca 386<210>2
<211>338<212>DNA<213>(Mycobacterium chelonae)龜分枝桿菌<400>2aggagcacca tttcccagcc gaatgagctt gggaacataa agcgagtttc tgtagtggtt 60actcgcttgg tgaatatgtt ttataaatcc tgtccacccc gtggataggt agtcggcaaa120acgtcggact gtcaatagaa ttgaaacgct ggcacactgt tgggtcctga ggcaacacat180tgtgttgtca ccctgcttgg tggtggggtg tggtctttga cttatggata gtggttgcga240gcatctaaca aacctcgctc gtttacgagt gaggttagtt tttgcaattt attagctaag300ttcttaaggg cacatggtgg atgccttggc aggatcca338<210>3<211>317<212>DNA<213>(Mycobacterium abscesslus)膿腫分枝桿菌<400>3aaggagcacc atttcccagt cgaatgaact agggaacata aagtaggcat ctgtagtgga 60tatctacttg gtgaatatgt tttgtaaatc ctgtccaccc cgtggatggg tagtcggcaa120aacgtcggac tgtcataaga attgaaacgc tggcacactg ttgggtcccg aggcaacacg180ttgtgttgtc accctgcttg gtggtggggt gtggactttg acttctgaat agtggttgcg240agcatctaaa catagcctcg ctcgttttcg agtggggctg gtttttgcaa ttttattagc300taagttctta agggcgc 317<210>4<211>429<212>DNA<213>(Mycobacterium vaccae)牝牛分枝桿菌<400>4aaggagcacc acgagaatca ggcccgccca catcgtgtgg gggttcggtg atctgatcga 60ttcgttggat ggcctttcat ctgtagtgga tgggggtctg gtgcacatga caaacttggc120cgagccggta gggaatgccg gcgagggaaa tcatcagaca cactattggg ctttgagaca180acaagcccgt gccccttttt ttgggggtgg ctctgcgttg gcagggtcgg cgtgttgttg240ccccgctttg gtggtggggt gtggtgtttg attogtggat agtggttgcg agcatctgaa300tgcacagcgc ttgtggtgtt gtgtgttcgg tgtaatgcaa atttttctga tactcgcatg360cagtcccttt ttgggggtgt gtgtgggtga ctcatttttt ggttttgtgt tgtaagtgtt420taagggcgc429<210>5<211>379<212>DNA<213>(Mycobacterium flavescens)變黃分枝桿菌<400>5aaggagcacc atttattgtt cccccgtccc cacgtgtgtg ggatcagtgc ggttgggaga 60tcagtgccgg gcctgtagtg ggtttccggt gggtgcacaa caaacgtgag aagtggtgtg120ggaacactgc tttgaggaat catcagacac actattgggc tttgaggcaa caggcccgtt180gtttccctgg ccactgtgtg tggtgggggg tctggtgtcg ccctgtcttt ggtggtgggg240tgtggtgttt gattcggtgga tagtggttgc gagcatctga acaggtggct cccttttggg 300
ggttgcttgt tttgataatg caatttttta ttcttccgag aatatttttc tgttttgtgt360tgtaagtgtt taagggcgc 379<210>6<211>364<212>DNA<213>(Mycobacterium asiaticum)亞洲分枝桿菌<400>6tggatccgac gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg atcacctcct 60ttctaaggag caocacgaga gcatcccaat tggtgggatg caggccgtgt ggagttctcg120tctgtagtgg acgagggctg ggtgcacaac aacaagcaag ccagacacac tattgggtcc180tgagacaaca ctcgggcgct agcacgaagt gttgtccctc catcttggtg gtggggtgtg240gtgtttgaga actggatagt ggttgcgagc atcaactgat cgcgtcgccg ttcgcggtgg300cgtgttcttt tgtgcaattt taaattcttt ggtttttgta gtgtttgtaa gtgtctaagg360gcgc 364<210>7<211>402<212>DNA<213>(Mycobacterium porcinum)豬分枝桿菌<400>7aaggagcacc gattcgattc ccccgccgtc cgcgtagtcg tgggcagtag tgcggttggg 60atatttcagc caggacctgt agtgggtgtc tggtgggtgc aaatgacaaa cgttgagccg120gcgcgggaaa gcgttggtga tggaaotgct gaacacacta ttgggctttg agacaacagg180cccgtgcccc tttcgggggg tggcattccg ttgggagtgt cggcgtgttg ttgctccgct240ttggtggtgg ggtgtggtgt ttgatttgtg gatagtggtt gcgagcatct agcacgcagt300gtggctgggg gccttcgggt ttccggtctt gttgtgtgtt gatgtgcaat ttcttttgaa360actcattttt ggtttttgtg ttgtaagtgt ttaagggcgc at 402<210>8<211>459<212>DNA<213>(Hycobacterium acapulcensis)阿加普爾分枝桿菌<400>8aaggagcacc agttattttc ccccgccccc acgcctgtgg gatcagttgc ggttgggata 60tttagtgcca gcacctgtag tgggtgtttc ggccggtgca cagcaaacgt tgatcgtctg120gtggggaaag ccgggcgtga aagattgcca gacacactat tgggctttga gacaacaagc180ccgtcgcctc tttgtcccga gtgtgggata tcggagaagg agcaccacga gacctgttgc240ccgcccacat cgtgtgggag ttcggtgact caggcgattc gggggttggt tgtggttgtc300gccctgcttt ggtggtgggg tgtggtgttt gatttgtgga tagtggttgc gagcatctga360acgcagagac ctgtgtgggt ttttgtgttc tgataatgca atttttattc ttccgagaat420attttttgat ctgttttgtg tgtaagtgtt taagggcgc 459<210>9<211>418<212>DNA<213>(Mycobacterium diernhoferi)迪氏分枝桿菌
<400>9aaggagcacc acgagacctg ttgcccgccc acatcgtgtg ggagttcggt gactcaggcg 60attcgttgga tggcctcaca cetgtagtgg gtgggggtct ggtgcacaac aaactttgag120aaactgccag acacactatt gggctttgag acaacaggcc ctgcggtgcc ggactcgttg180gagtcctggt tgccggccgc gagtcccgga agcgattctg gttcggaegg tgtctgttgt240tgctccatct ttggtggtgg ggtgtggtgt ttgatttgtg gatagtggtt gcgagcatct300agcacgcaag aggagtctgg gtttccttcg ggagcccggg tttttgttgt gtgtgtttga360tgtgcaattt ttttcttcta tttggtttta tctgtgttgt aagtgtttaa gggcgcat 418<210>10<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacteria<400>10tggtggggtg tggtgtttga20<210>11<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacter)用于檢測分枝桿菌的探針或引物序列<400>11tggatagtgg ttgcgagcat20<210>12<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteria)用于檢測分枝桿菌的探針或引物序列<400>12ccatcttggt ggtggggtgt20<210>13<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteria)用于檢測分枝桿菌的探針或引物序列<400>13cacactattg ggccctgagg20<210>14<211>10<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteria)用于檢測分枝桿菌的探針或引物序列<400>14aaggagcacc 10<210>15<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于檢測結核菌的探針或引物序列<400>15cactcggact tgttccaggt20<210>16<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于檢測結核菌的探針或引物序列<400>16tggtggggcg taggccgtga20<210>17<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于檢測結核菌的探針或引物序列
<400>17ccccaactgg tggggcgtag20<210>18<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于檢測結核菌的探針或引物序列<400>19gtagtgggcg agagccgggt20<210>20<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于檢測結核菌的探針或引物序列<400>20catgacaaca aagttggcca20<210>21<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于檢測結核菌的探針或引物序列<400>21caacactcgg acttgttcca20
<210>22<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于檢測結核菌的探針或引物序列<400>22gttccaggtg ttgtcccacc20<210>23<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于檢測結核菌的探針或引物序列<400>23cgagcatcaa tggatacgct20<210>24<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium avium complex(MAC))用于檢測鳥分枝桿菌的探針或引物序列<400>24gttcatcgaa atgtgtaatt20<210>25<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium avium complex(MAC))用于檢測鳥分枝桿菌的探針或引物序列<400>25gtgtggagtc cctccatctt20<210>26
<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium avium complex(MAC))用于檢測鳥分枝桿菌的探針或引物序列<400>26aaatgattgc cagacacact20<210>27<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Hycobacterium avium complex(MAC))用于檢測鳥分枝桿菌的探針或引物序列<400>27ccctgagaca acactcggtc20<210>28<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Hycobacteritm fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>28cgagccgtga ggaaccggtt20<210>29<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>29ccgtgaggaa ccggttgcct20<210>30<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>30gtagtgggca cggtttggtg20<210>31<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>31ttggtgcaca acaaactttt20<210>32<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>32caaacttttt tgactgccag20<210>33<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>33acacactatt gggctttgag20<210>34<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>34ctattgggct ttgagacaac20<210>35<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>35aggcccgtgc cccttttggg20<210>36<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>36tggcatccgg ttgcgggtgt20<210>37<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>37tagcacgcag aatcgtgtgg20<210>38<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)
用于檢測偶發分枝桿菌的探針或引物序列<400>38ggttttgtgt gttgatgtgc20<210>39<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于檢測龜分枝桿菌的探針或引物序列<400>40ttgggaacat aaagcgagtt20<210>41<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于檢測龜分枝桿菌的探針或引物序列<400>41gttactcgct tggtgaatat20<210>42<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于檢測龜分枝桿菌的探針或引物序列
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于檢測龜分枝桿菌的探針或引物序列<400>43gtagtcggca aaacgtcgga20<210>44<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于檢測龜分枝桿菌的探針或引物序列<400>44tcaatagaat tgaaacgctg20<210>45<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于檢測龜分枝桿菌的探針或引物序列<400>45ggcaacacat tgtgttgtca20<210>46<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于檢測龜分枝桿菌的探針或引物序列<400>46
taacaaacct cgctcgttta20<210>47<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>47cataaagtag gcatctgtag20<210>48<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>48agtggatatc tacttggtga20<210>49<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>49taaacatagc ctcgctcgtt20<210>50<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>50cgttttcgag tggggctggt20
<210>51<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>51gagtggggct ggtttttgca20<210>52<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>52ctcgttttcg agtggggctg20<210>53<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測牝牛分枝桿菌的探針或引物序列<400>53tcaggcccgc ccacatcgtg20<210>54<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>54tgggggttcg gtgatetgat20<210>55<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>55cgattcgttg gatggccttt20<210>56<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>56ggccgagccg gtagggaatg20<210>57<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>57ccggcgaggg aaatcatcag20<210>58<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>58acacactatt gggctttgag20<210>59<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>59acaacaagcc cgtgcccctt20<210>60<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>60ttttgggggt ggctctgcgt20<210>61<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>61tggcagggtc ggcgtgttgt20<210>62<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>62tgtttgattc gtggatagtg20<210>63<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>63gaatgcacag cgcttgtggt20<210>54<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于檢測膿腫分枝桿菌的探針或引物序列<400>64gtgtgttcgg tgtaatgcaa20<210>65<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens(用于檢測變黃分枝桿菌的探針或引物序列)<400>65tttattgttc ccccgtcccc20<210>66<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flaveseens(用于檢測變黃分枝桿菌的探針或引物序列)<400>66acgtgtgtgg gatcagtgcg20<210>67<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens(用于檢測變黃分枝桿菌的探針或引物序列)
<400>67gttgggagat cagtgccggg20<210>68<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens(用于檢測變黃分枝桿菌的探針或引物序列)<400>68cctgtagtgg gtttccggtg20<210>69<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens(用于檢測變黃分枝桿菌的探針或引物序列)<400>69cgtgagaagt ggtgtgggaa20<210>70<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens)用于檢測變黃分枝桿菌的探針或引物序列<400>70cactgctttg aggaatcatc20<210>71<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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ggcccgttgt ttccctggcc20<210>72<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens(用于檢測變黃分枝桿菌的探針或引物序列)<400>72tgaacaggtg gctccctttt20<210>73<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae(用于檢測戈氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>73cgacaacaag ctaagccaga20<210>74<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae)用于檢測戈氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>74tgttcttttt gtgcaatttt20<210>75<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae)用于檢測戈氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>75gcatcaaaat gtatgcgttg20<210>76
<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae)用于檢測戈氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>76aaaatgtatg cgttgtcgtt20<210>77<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae)用于檢測戈氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>77cggcaacgtg ttctttttgt20<210>78<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>78ttgagttgtg gatagtggtt20<210>79<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>79gtcgagtgtt tagagagtaa20<210>80<211>20<212>DNA
<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>80cgcactgggc gcattccgag20<210>81<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>81gtgggggctg ggtgcacaac20<210>82<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>82caacgttgaa aacaagatcg20<210>83<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>83aattacgaac aacaacaagc20<210>84<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>84ttgcgagatc atcaactgcc20<210>85<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>85aggagtcctt gggggtttct20<210>86<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>86ggtggccggc ttttgtgctg20<210>87<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>87ggcacactgt tgggtcctga20<210>88<211>20<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列
<400>88ggcaacaggc ccgtttgtgc20<210>89<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>89ccccgggtgg gggtgggtgt20<210>90<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>90gtgttgttgt cgcctcacac20<210>91<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>91taacaagcag atttttggtc20<210>92<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>92
tggtctgttt gttttgcaat20<210>93<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>93ttttgtttct tggtttttgt20<210>94<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>94gtttgtaagt gtttaagggc20<210>95<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>95gcatggtgga tgccttggca20<210>96<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>96ctttttcccc cgtgcctcac20
<210>97<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>97atgggtgagg gtttttgcgg20<210>98<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>98ttgggacagt gtttgccggt20<210>99<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>99gcctgtagtg ggtggccggt20<210>100<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于檢測地分枝桿菌的探針或引物序列<400>100ggtggccggt ggtgcagagg20<210>101<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于檢測瘰疬分枝桿菌的探針或引物序列)<400>101cctgaggcaa cactcggctc20<210>102<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于檢測瘰疬分枝桿菌的探針或引物序列)<400>102tcggctcgtt ctgagtggtg20<210>103<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于檢測瘰疬分枝桿菌的探針或引物序列)<400>103taaacggatg cgtggccgaa20<210>104<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于檢測瘰疬分枝桿菌的探針或引物序列)<400>104caacagcaaa tgattgccag20<210>105<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于檢測瘰疬分枝桿菌的探針或引物序列)<400>105ccctccatct tggtggtggg20<210>106<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于檢測瘰疬分枝桿菌的探針或引物序列)<400>106tgcgagcatc taaacggatg20<210>107<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于檢測瘰疬分枝桿菌的探針或引物序列)<400>107gtggccgaac ggtggcgtgt20<210>108<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium kansasii)用于檢測堪薩斯分枝桿菌的探針或引物序列<400>108tcgttgaaat gtgtaatttc20<210>109<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium kansasii)用于檢測堪薩斯分枝桿菌的探針或引物序列<400>109gtggggtgca agccgtgagg20<210>110<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium kansasii)用于檢測堪薩斯分枝桿菌的探針或引物序列<400>110gcgtgttctt ttgtgcaatt20<210>111<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium kansasii)用于檢測堪薩斯分枝桿菌的探針或引物序列<400>111gcaactgtaa atgaatcacc20<210>112<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于檢測斯氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>112ctggatgcgc tgccgttcgt20<210>113<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于檢測斯氏分枝桿菌的探針或引物序列
<400>113aacactcagg cttggccaga20<210>114<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于檢測斯氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>114caattggatg cgctgccctc20<210>115<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于檢測斯氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>115tcgtggtggc gtgttctttt20<210>116<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于檢測斯氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>116gtgcaatttt aattctttgg20<210>117<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium marinum andMycobacterium ulcerans(用于檢測海分枝桿菌和潰瘍分枝桿菌的探針或引物序列)
<400>117aacaacaagc aagccagaca20<210>118<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium marinum andMycobacterium ulcerans(用于檢測海分枝桿菌和潰瘍分枝桿菌的探針或引物序列)<400>118atctctgttg gtttcgggat20<210>119<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium marinum andMycobacterium ulcerans(用于檢測海分枝桿菌和潰瘍分枝桿菌的探針或引物序列)<400>119ccttttggtg gcgtgttctg20<210>120<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gastri)用于檢測胃分枝桿菌的探針或引物序列<400>120aacagcaagc aagccagaca20<210>121<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gastri)用于檢測胃分枝桿菌的探針或引物序列
<400>121ctcgtccaag agtgttgtcc20<210>122<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gastri)用于檢測胃分枝桿菌的探針或引物序列<400>122gcttgtcttg gactcgtcca20<210>123<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gastri)用于檢測胃分枝桿菌的探針或引物序列<400>123cagggtagcg tgttcttttg20<210>124<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>124catctggcaa agactgtggt20<210>125<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>125agggagcacc gtaaacgcat20
<210>126<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>126cccgcgtggg gtggggtgtg20<210>127<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>127ggttcggcgt gttgtggcgt20<210>128<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>128cgggccgagg tgttgggcag20<210>129<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序<400>129caggcagtaa ccgccggcac20<210>130
<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>130caggcagtaa ccgccggcac20<210>131<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>131tccgcgtggt ggcggggtgt20<210>132<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>132agactgtggt aagcggtttt20<210>133<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于檢測蟾分枝桿菌的探針或引物序列<400>133tgttgagtgt tttctggtgt20<211>134<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于檢測日內瓦分枝桿菌的探針或引物序列<400>134cattgaatag tggttgcgag20<211>135<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritn genavense)用于檢測日內瓦分枝桿菌的探針或引物序列<400>135aacaacaggc aatcgccgga20<211>136<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于檢測日內瓦分枝桿菌的探針或引物序列<400>136tcggccgact gaggtcgacg20<211>137<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于檢測日內瓦分枝桿菌的探針或引物序列<400>137gacgtggtgt ccctccatct20<211>138<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于檢測日內瓦分枝桿菌的探針或引物序列<400>138
ttgagcattg aatagtggtt20<211>139<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于檢測日內瓦分枝桿菌的探針或引物序列<400>139gcgagcatct agacggatgc20<211>140<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于檢測日內瓦分枝桿菌的探針或引物序列<400>140gttccccagt ggtgcgcgtt20<211>141<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于檢測日內瓦分枝桿菌的探針或引物序列<400>141cgtcaaaaat gtgtaatttt20<211>142<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于檢測瑪爾摩分枝桿菌的探針或引物序列<400>142agcatctaaa cggatgcgct20<210>143<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于檢測瑪爾摩分枝桿菌的探針或引物序列<400>143tggtggggtg caagccgtga20<210>144<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于檢測瑪爾摩分枝桿菌的探針或引物序列<400>144ccagtccgcg tggtgtcccc20<210>145<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于檢測瑪爾摩分枝桿菌的探針或引物序列<400>145tgcccgtaga cgcgtattcg20<210>146<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于檢測瑪爾摩分枝桿菌的探針或引物序列<400>146tttgtgtaat ttcttctttg20<210>147<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于檢測猿分枝桿菌的探針或引物序列<400>147acaacaacag gcaatcgcca20<210>148<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于檢測猿分枝桿菌的探針或引物序列<400>148actcggccga cttcggttga20<210>149<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于檢測猿分枝桿菌的探針或引物序列<400>149gagcatctaa atgaacgcgt20<210>150<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于檢測猿分枝桿菌的探針或引物序列<400>150tccaattggt ggggtgtgag20<210>151<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于檢測猿分枝桿菌的探針或引物序列
<400>151tgcacaacaa caggcaatcg20<210>152<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于檢測猿分枝桿菌的探針或引物序列<400>152cgacttcggt tgaagtggtg20<210>153<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于檢測猿分枝桿菌的探針或引物序列<400>153tacgtgttcg ttttgtgtaa20<210>154<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>154gacactctcc gttggggagg20<210>155<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>155
gtgtgagccg tgaggagctg20<210>156<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>156gagcgctgta gtggcgccgg20<210>157<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>157cttggtgcac agcaaacgtt20<210>158<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>158gagatgcggt gtgggaaacg20<210>159<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>159ctgtttcgat ggactgccag20<210>160<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>160acacactatt gggccctgag20<210>161<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>161acaacaggcc cgcgttcccg20<210>162<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>162tcccgttggg ggcggggggt20<210>163<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>163gggtgtgttg ttgccctgct20<210>164<211>20<212>DNA<213>(Anificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>164gctgtagtgg cgccggcttg20<210>165<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于檢測恥垢分枝桿菌的探針或引物序列<400>165aaacgctgtt tcgatggact20<210>166<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于檢測石氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>166aacaacaagc gagaagccga20<210>167<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于檢測石氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>167ggcttccgca gtgggcggaa20<210>168<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)
用于檢測石氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>168gggcgcgggc tgggtgcaca20<210>169<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于檢測石氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>169gcgagaagcc gagcacactg20<210>170<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于檢測石氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>170cccgggccct ttggggttgg20<210>171<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于檢測石氏分枝桿菌的探針或引物序列<400>171aagcaaaact tggttgtttt20<210>172<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于檢測石氏分枝桿菌的探針或引物序列
<400>172gtttgtcgag ttgttttctt20<210>173<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于檢測哈瓦那分枝桿菌的探針或引物序列<400>173aacaacaggc aatcgccaga20<210>174<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于檢測哈瓦那分枝桿菌的探針或引物序列<400>174aacactccaa ttgggtgggg20<210>175<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于檢測哈瓦那分枝桿菌的探針或引物序列<400>175ggttctcgtc tgtagtggac20<210>176<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于檢測哈瓦那分枝桿菌的探針或引物序列<400>176tgcacaacaa caggcaatcg20
<210>177<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于檢測哈瓦那分枝桿菌的探針或引物序列<400>177ggccgacttc ggttgaagtg20<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<210>178<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于檢測哈瓦那分枝桿菌的探針或引物序列<400>178ggggtgtggt gtttgagtat20<210>179<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于檢測哈瓦那分枝桿菌的探針或引物序列<400>179gagcatctaa atgaacgcgt20<210>180<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于檢測哈瓦那分枝桿菌的探針或引物序列<400>180
tacgtgttcg ttttgtgtaa20<210>181<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>181gttggtgatg gactgccaga20<210>182<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>182cgcgggaaag cgttggtgat20<210>183<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>183cgatgtcgtg ggcagtagtg20<210>184<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>184ggatatttca gccagcatct20
<210>185<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>185tgtctggtgg gtgcaaatga20<210>186<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>186cggcgcggga aagcgttggt20<210>187<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>187gggaaagcgt tggtgatgga20<210>188<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>188tctagcacgc agagtgtggc20<210>189<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于檢測產鼻疽分枝桿菌的探針或引物序列)<400>189tgggggcctt cgggtttctt20<210>190<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium asiaticum)用于檢測亞洲分枝桿菌的探針或引物序列<400>190catcccaatt ggtgggatgc20<210>191<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium asiaticum)用于檢測亞洲分枝桿菌的探針或引物序列<400>191cacaacaaca agcaagccag20<210>192<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium asiaticum)用于檢測亞洲分枝桿菌的探針或引物序列<400>192cactcgggcg ctagcacgaa20<210>193<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium asiaticum)用于檢測亞洲分枝桿菌的探針或引物序列<400>193aactgatcgc gtcgccgttc20<210>194<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>194cagtagtgcg gttgggatat20<210>195<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>195ttcgattccc ccgccgtccg20<210>196<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>196cagccaggac ctgtagtggg20<210>197<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>197tggtgggtgc aaatgacaaa20<210>198<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>198gagccggcgc gggaaagcgt20<210>199<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>199gtgatggaac tgctgaacac20<210>200<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>200ggctttgaga caacaggccc20<210>201<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列
<400>201cggggggtgg cattccgttg20<210>194<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>202cggcgtgttg ttgctccgct20<210>203<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>203tagtggttge gagcatctag20<210>204<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>204agtgtggctg ggggccttcg20<210>205<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于檢測豬分枝桿菌的探針或引物序列<400>205
ggtcttgttg tgtgttgatg20<210>206<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>206tgccagcacc tgtagtgggt20<210>207<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>207gatcgtctgg tggggaaagc20<210>206<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>208cgggcgtgaa agattgccag20<210>209<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>209agcccgtcgc ctctttgtcc20
<210>210<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>210cgagtgtggg atatcggaga20<210>211<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>211ggagcaccac gagacctgtt20<210>212<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>212cgcccacatc gtgtgggagt20<210>213<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>213tcggtgactc aggcgattcg20<210>214<211>20<212>DNA
<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>214gggtgtggtg tttgatttgt20<210>215<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于檢測阿加普爾分枝桿菌的探針或引物序列)<400>215cgagcatctg aacgcagaga20<210>216<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>216acctgttgcc cgcccacatc20<210>217<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>217gtgtgggagt tcggtgactc20<210>218<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>218ttcgttggat ggcctcacac20<210>219<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>219tgcacaacaa actttgagaa20<210>220<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>220acaggccctg cggtgccgga20<210>221<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>221tcgttggagt cctggttgcc20<210>222<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi
(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>222ggccgcgagt cccggaagcg20<210>223<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>223gtctgttgtt gctccatctt20<210>224<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>224ggtgtggtgt ttgatttgtg20<210>225<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>225atagtggttg cgagcatcta20<210>226<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)
<400>226acgcaagagg agtctgggtt20<210>227<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于檢測迪氏分枝桿菌的探針或引物序列)<400>227ttgttgtgtg tgtttgatgt20<210>228<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>228gagcaccacg aaaagcaccc20<210>228<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>229ctggtggggt gcgagccgtg20<210>230<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>230gcgagccgtg aggggttccc20
<210>231<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>231aggggttccc gtctgtagtg20<210>232<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>232acgggggccg ggtgcgcaac20<210>233<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>233caaatgattg ccagacacac20<210>234<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>234tattgggcct gagacaacac20<210>235<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>235cggtccgtcc gtgtggagtc20<210>236<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>236tccatcttgg tggtggggtg20<210>237<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>237ggtgtttgag tattggatag20<210>238<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>238tggttgcgag catctagatg20<210>239<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>239gcgcatggtc tccgtggccg20<210>240<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于檢測副結核分枝桿菌的探針或引物序列)<400>240gttcatcgaa atgtgtaatt20<210>241<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mcobacteria sp.
(用于檢測酒精分枝桿菌的探針或引物序列)<400>241aaaagctgtt gtttgacggt20<210>242<211>25<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of primer for amplifying Mycobacteria ITS selected from the sequence of16S rRNA in Mycobacteria(用于放大從分枝桿菌16S rRNA序列中選擇出來的分枝桿菌ITS的引物序列)<400>242tggatccgac gaagtcgtaa caagg25<210>243<211>25<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>sequence of primer for amplifying Mycobacteria ITS selected from the sequence of23S rRNA in Mycobacteria(用于放大從分枝桿菌23S rRNA序列中選擇出來的分枝桿菌ITS的引物序列)<400>243tggatcctgc caaggcatcc accat2權利要求
1.一種用于檢測和鑒定分枝桿菌的寡聚核苷酸，其特征是內轉錄間隔區的偶發分枝桿菌基因ITS的DNA列于序列鑒別號1中。
2.一種用于檢測和鑒定分枝桿菌的寡聚核苷酸，其特征是檢測和鑒定偶發分枝桿菌的寡聚核苷酸序列列于序列鑒別號28至38中的任一序列鑒別號中。
全文摘要
本發明是用于檢測和鑒定分枝桿菌的寡聚核苷酸。更具體地說，是用來鑒定非結核分枝桿菌的ITS(內轉錄間隔區)的核苷酸序列，這些非結核分枝桿菌包括偶發分枝桿菌，龜分枝桿菌，膿腫分枝桿菌，牝牛分枝桿菌，變黃分枝桿菌，亞洲分枝桿菌，豬分枝桿菌，阿加普爾分枝桿菌和迪氏分枝桿菌。通過這些分枝桿菌的寡聚核苷酸引物或探針。本發明的寡聚核苷酸探針(結合到固相基質中)，它們只能與特異的分枝桿菌中的ITS核苷酸序列進行雜交，因此它們能敏感地檢測和鑒定特異的分枝桿菌。通過PCR放大，與上述探針有相同核苷酸序列的寡聚核苷酸引物也能檢測和鑒定特異的分枝桿菌。應用這些依據分枝桿菌ITS制備的寡聚核苷酸引物或探針，便能夠準確而有效地檢測分枝桿菌，鑒別結核菌與NTM，和鑒定分枝桿菌的種類。
文檔編號C07K14/35GK1542142SQ20041000630
公開日2004年11月3日 申請日期2000年5月16日 優先權日1999年5月29日
發明者金哲民, 樸希卿, 張賢貞 申請人:Sj高技術株式會社, 金哲民, 樸希卿