本(ben)披露涉(she)及一種用于確定某一位(wei)置中植物病原體的抗性和/或毒(du)力(li)特性的方法。這可用于提(ti)供控(kong)制(zhi)病害措施(shi)的實(shi)時或接近實(shi)時的針對(dui)性的建議。

背景技術：

1、植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)病(bing)(bing)(bing)原體(ti)是(shi)在植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)中(zhong)引起病(bing)(bing)(bing)害(hai)的(de)(de)(de)生物(wu)(wu)(wu)(wu)體(ti)。這可(ke)能(neng)(neng)導致植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)生長減(jian)少，植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)同化或(huo)(huo)甚(shen)至植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)的(de)(de)(de)重要功(gong)能(neng)(neng)的(de)(de)(de)損(sun)害(hai)，從而導致植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)生產力(li)的(de)(de)(de)降低或(huo)(huo)損(sun)失。植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)病(bing)(bing)(bing)原體(ti)包括病(bing)(bing)(bing)毒(du)、細菌(jun)、線蟲、昆蟲和真(zhen)菌(jun)，并且它(ta)們(men)能(neng)(neng)夠在其宿(su)(su)主內(nei)或(huo)(huo)其宿(su)(su)主上繁殖，從一(yi)(yi)株植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)擴散(san)到另一(yi)(yi)株植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)。植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)病(bing)(bing)(bing)害(hai)的(de)(de)(de)癥狀(zhuang)包括顏色(se)、形狀(zhuang)或(huo)(huo)功(gong)能(neng)(neng)的(de)(de)(de)變化，例如真(zhen)菌(jun)小(xiao)麥(mai)發酵殼針孢(zymoseptoria?tritici)導致小(xiao)麥(mai)葉中(zhong)的(de)(de)(de)淡棕色(se)至綠灰色(se)橢圓形病(bing)(bing)(bing)灶。在中(zhong)度至高度的(de)(de)(de)病(bing)(bing)(bing)害(hai)壓力(li)的(de)(de)(de)情況下(xia)，它(ta)可(ke)能(neng)(neng)導致植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)生產力(li)的(de)(de)(de)顯著損(sun)失。

2、所有植(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)物(wu)(wu)(wu)種，無論(lun)是(shi)(shi)栽(zai)培的(de)(de)還(huan)是(shi)(shi)野生的(de)(de)，都可能(neng)(neng)易受病害(hai)的(de)(de)影響。對(dui)于農(nong)民來說，植(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)病原體可能(neng)(neng)降低農(nong)業生產的(de)(de)產量和質量，從(cong)而造成(cheng)巨(ju)大的(de)(de)經濟損失(shi)。因(yin)此，在管理(li)或(huo)控制植(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)病害(hai)方面(mian)已經進行了廣泛的(de)(de)研究和開發，包(bao)括作物(wu)(wu)(wu)輪作、適當的(de)(de)種植(zhi)(zhi)日期(qi)和植(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)密度、控制田地水分、育種對(dui)病原體具有更(geng)大抗(kang)性的(de)(de)植(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)、以及施用殺(sha)有害(hai)生物(wu)(wu)(wu)劑或(huo)生物(wu)(wu)(wu)殺(sha)有害(hai)生物(wu)(wu)(wu)劑。

3、殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)有(you)害(hai)生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)劑(ji)(ji)(ji)是(shi)用(yong)于保護植物(wu)對抗病(bing)原(yuan)體(ti)(ti)(ti)的(de)(de)(de)化學(xue)(xue)劑(ji)(ji)(ji)或(huo)(huo)生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)劑(ji)(ji)(ji)。殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)(ji)(ji)是(shi)一(yi)種(zhong)類型的(de)(de)(de)殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)有(you)害(hai)生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)劑(ji)(ji)(ji)，其(qi)可以是(shi)噴霧到作物(wu)、土壤或(huo)(huo)種(zhong)子(zi)上的(de)(de)(de)抑(yi)(yi)(yi)制(zhi)(zhi)真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)和(he)/或(huo)(huo)其(qi)孢子(zi)的(de)(de)(de)發(fa)育或(huo)(huo)將其(qi)殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)滅的(de)(de)(de)化學(xue)(xue)化合物(wu)、生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)有(you)機(ji)體(ti)(ti)(ti)或(huo)(huo)生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)有(you)機(ji)體(ti)(ti)(ti)的(de)(de)(de)衍生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)。存在以不同方(fang)式(shi)影(ying)響病(bing)原(yuan)體(ti)(ti)(ti)的(de)(de)(de)各種(zhong)類型的(de)(de)(de)殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)(ji)(ji)。活性成分(ai)殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)(ji)(ji)和(he)被(bei)抑(yi)(yi)(yi)制(zhi)(zhi)的(de)(de)(de)靶標的(de)(de)(de)化學(xue)(xue)結(jie)(jie)構通常定義了其(qi)作用(yong)方(fang)式(shi)，換言(yan)之，它(ta)如何與病(bing)原(yuan)體(ti)(ti)(ti)相互作用(yong)。例如，一(yi)種(zhong)類型的(de)(de)(de)殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)(ji)(ji)可以與參與真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)的(de)(de)(de)核酸(suan)代謝的(de)(de)(de)酶結(jie)(jie)合，使得(de)病(bing)原(yuan)體(ti)(ti)(ti)的(de)(de)(de)繁殖和(he)控(kong)制(zhi)(zhi)其(qi)生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)學(xue)(xue)關鍵方(fang)面(mian)的(de)(de)(de)能力被(bei)破壞。另一(yi)種(zhong)類型的(de)(de)(de)殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)(ji)(ji)抑(yi)(yi)(yi)制(zhi)(zhi)參與將營養素(su)轉化為病(bing)原(yuan)體(ti)(ti)(ti)生(sheng)(sheng)(sheng)長所需(xu)的(de)(de)(de)能量(liang)的(de)(de)(de)生(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)化學(xue)(xue)途徑。這(zhe)樣(yang)的(de)(de)(de)殺(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)(sha)真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)(ji)(ji)類的(de)(de)(de)實例是(shi)琥(hu)珀酸(suan)脫氫(qing)酶抑(yi)(yi)(yi)制(zhi)(zhi)劑(ji)(ji)(ji)(sdhi)，其(qi)通過靶向琥(hu)珀酸(suan)脫氫(qing)酶來抑(yi)(yi)(yi)制(zhi)(zhi)真(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)的(de)(de)(de)細胞呼(hu)吸和(he)能量(liang)產生(sheng)(sheng)(sheng)。

4、盡(jin)管殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑可(ke)(ke)(ke)以(yi)(yi)非常有(you)(you)(you)效(xiao)地控(kong)制(zhi)(zhi)(zhi)植(zhi)物(wu)病(bing)(bing)(bing)(bing)害，但病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)通過(guo)進化(hua)抗(kang)性(xing)(xing)來響應殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑，這意味著(zhu)殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑變(bian)(bian)(bian)(bian)得(de)(de)(de)(de)不(bu)那么有(you)(you)(you)效(xiao)。病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)對控(kong)制(zhi)(zhi)(zhi)劑(例(li)如(ru)(ru)殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)抗(kang)性(xing)(xing)可(ke)(ke)(ke)以(yi)(yi)通過(guo)病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)單個(ge)或(huo)(huo)幾個(ge)基因(yin)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)突變(bian)(bian)(bian)(bian)而發(fa)生。一個(ge)或(huo)(huo)多個(ge)突變(bian)(bian)(bian)(bian)可(ke)(ke)(ke)以(yi)(yi)導(dao)(dao)致各種機(ji)(ji)制(zhi)(zhi)(zhi)，其(qi)中(zhong)病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)變(bian)(bian)(bian)(bian)得(de)(de)(de)(de)對殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑具(ju)有(you)(you)(you)抗(kang)性(xing)(xing)或(huo)(huo)較不(bu)敏感。例(li)如(ru)(ru)，突變(bian)(bian)(bian)(bian)可(ke)(ke)(ke)以(yi)(yi)導(dao)(dao)致病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)具(ju)有(you)(you)(you)改變(bian)(bian)(bian)(bian)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)靶(ba)位點，使(shi)得(de)(de)(de)(de)殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑可(ke)(ke)(ke)能不(bu)再或(huo)(huo)不(bu)太有(you)(you)(you)效(xiao)地與(yu)其(qi)結合。除了(le)靶(ba)標(biao)修飾(shi)之外，還可(ke)(ke)(ke)能發(fa)生其(qi)他抗(kang)性(xing)(xing)機(ji)(ji)制(zhi)(zhi)(zhi)。發(fa)展(zhan)了(le)將殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑泵出(chu)其(qi)細胞的(de)(de)(de)(de)(de)(de)有(you)(you)(you)效(xiao)流出(chu)機(ji)(ji)制(zhi)(zhi)(zhi)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)、或(huo)(huo)過(guo)表(biao)達靶(ba)蛋白的(de)(de)(de)(de)(de)(de)病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)可(ke)(ke)(ke)以(yi)(yi)產生抗(kang)性(xing)(xing)或(huo)(huo)降(jiang)低(di)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)敏感性(xing)(xing)。抗(kang)性(xing)(xing)機(ji)(ji)制(zhi)(zhi)(zhi)可(ke)(ke)(ke)能對病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)克服殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑作(zuo)用(yong)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)能力具(ju)有(you)(you)(you)突然或(huo)(huo)漸進的(de)(de)(de)(de)(de)(de)作(zuo)用(yong)。如(ru)(ru)果(guo)存(cun)在(zai)突然的(de)(de)(de)(de)(de)(de)突變(bian)(bian)(bian)(bian)，則病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)可(ke)(ke)(ke)能對特定殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑產生完全抗(kang)性(xing)(xing)，使(shi)得(de)(de)(de)(de)殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑不(bu)再有(you)(you)(you)效(xiao)。如(ru)(ru)果(guo)存(cun)在(zai)漸進的(de)(de)(de)(de)(de)(de)作(zuo)用(yong)，則在(zai)不(bu)同基因(yin)中(zhong)存(cun)在(zai)許多突變(bian)(bian)(bian)(bian)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)積累(lei)，每個(ge)突變(bian)(bian)(bian)(bian)以(yi)(yi)漸進的(de)(de)(de)(de)(de)(de)方式促成對病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)抗(kang)性(xing)(xing)，使(shi)得(de)(de)(de)(de)可(ke)(ke)(ke)以(yi)(yi)在(zai)幾年內觀察到病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)對殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑的(de)(de)(de)(de)(de)(de)敏感性(xing)(xing)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)增(zeng)加(jia)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)轉變(bian)(bian)(bian)(bian)。如(ru)(ru)果(guo)連續(xu)施用(yong)殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑以(yi)(yi)控(kong)制(zhi)(zhi)(zhi)可(ke)(ke)(ke)能導(dao)(dao)致抗(kang)性(xing)(xing)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)特定病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)，則病(bing)(bing)(bing)(bing)原(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)體(ti)(ti)(ti)對特定殺(sha)真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑的(de)(de)(de)(de)(de)(de)敏感性(xing)(xing)可(ke)(ke)(ke)以(yi)(yi)繼續(xu)降(jiang)低(di)。

5、例如，在過去幾十年中，含(han)有醌外部抑(yi)制(zhi)(zhi)劑(ji)(qoi)、脫甲基化抑(yi)制(zhi)(zhi)劑(ji)(dmi)或琥珀酸脫氫酶抑(yi)制(zhi)(zhi)劑(ji)(sdhi)的殺真菌劑(ji)在歐洲和全球的其(qi)他地理區(qu)域(yu)已(yi)被廣泛用于小麥發酵(jiao)殼針孢控制(zhi)(zhi)。

6、由于cytb基因中產生(sheng)了(le)單突(tu)變，導致(zhi)氨基酸改變，鑒(jian)定為g143a(其賦予對(dui)病原體(ti)的完全抗性(xing))，因此qoi失去了(le)控(kong)制(zhi)病原體(ti)的能(neng)力。如今(jin)，這種突(tu)變在歐(ou)洲的大多數谷類生(sheng)長(chang)區域(yu)廣(guang)泛(fan)存在，并(bing)且最大程度減小(xiao)了(le)qoi對(dui)控(kong)制(zhi)小(xiao)麥發酵殼針孢(bao)的貢獻。

7、在幾(ji)年中，由于(yu)小麥發酵殼針孢(bao)的(de)(de)敏感性轉變(bian)，另(ling)一種殺(sha)(sha)真菌劑(ji)(ji)類(lei)dmi殺(sha)(sha)真菌劑(ji)(ji)的(de)(de)活性隨時間而降低。這種降低背后的(de)(de)機制(zhi)主(zhu)要(yao)歸(gui)因于(yu)病原體的(de)(de)cyp51基(ji)因中不(bu)同突變(bian)的(de)(de)積累(lei)。應注意(yi)，不(bu)同的(de)(de)突變(bian)或突變(bian)的(de)(de)組合可(ke)以賦(fu)予對(dui)dmi組內不(bu)同殺(sha)(sha)真菌劑(ji)(ji)的(de)(de)不(bu)同程度(du)的(de)(de)抗性。這種作用被稱為不(bu)完(wan)全交叉(cha)抗性，如(ru)由殺(sha)(sha)真菌劑(ji)(ji)抗性行(xing)動委員會(hui)(fungicideresistance?action?committee，frac)報道(dao)的(de)(de)。因此，特定(ding)(ding)dmi殺(sha)(sha)真菌劑(ji)(ji)的(de)(de)功效可(ke)以根(gen)據病原體在特定(ding)(ding)位置的(de)(de)抗性特性變(bian)化，響應于(yu)具有不(bu)同類(lei)型(xing)抗性特點的(de)(de)個體的(de)(de)本地分布。

8、近年來(lai)已經報(bao)道(dao)了對(dui)sdhi的(de)抗性(xing)。例(li)如，在小麥(mai)發(fa)酵(jiao)殼針孢中，已經發(fa)現sdh基(ji)因的(de)亞基(ji)b、c和d(其(qi)是復(fu)合物(wu)ii的(de)泛(fan)醌和sdhi結(jie)合位點(dian)的(de)一(yi)部分)中的(de)不同(tong)(tong)突變降低了病原體對(dui)sdhi殺真菌(jun)劑的(de)敏感性(xing)。frac網站上(shang)公布的(de)監測數據表明(ming)b-n225t、c-t79n、c-w80s、c-n86s和c-h152r等突變可(ke)以(yi)賦予對(dui)小麥(mai)發(fa)酵(jiao)殼針孢不同(tong)(tong)程(cheng)度的(de)抗性(xing)。已經觀察(cha)到對(dui)sdhi的(de)不完全交叉抗性(xing)。此外，已知殺真菌(jun)劑類的(de)一(yi)些成員可(ke)以(yi)通過顯示出以(yi)更高效率結(jie)合靶標從而導(dao)致(zhi)更高的(de)效力而維持顯著的(de)性(xing)能，盡管在田地(di)存在抗性(xing)個體。

9、近年來，已(yi)經(jing)向市場引入(ru)了具(ju)有不同作用(yong)方式的(de)新殺真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)，如(ru)醌內(nei)部(bu)抑(yi)制(zhi)劑(ji)(qii)和(he)醌外(wai)部(bu)抑(yi)制(zhi)劑(ji)(qoi)，其具(ju)有控(kong)制(zhi)攜(xie)帶g143a突變(bian)的(de)病(bing)原體的(de)能力(li)(由frac分類為11a組)。已(yi)經(jing)證明單點突變(bian)影響這(zhe)些新殺真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)的(de)性能，并(bing)且病(bing)原體可(ke)(ke)能進化以獲得克(ke)服這(zhe)些新殺真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)劑(ji)的(de)殺真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)活性的(de)能力(li)。例如(ru)，實驗室研究表明，細胞色素b中(zhong)的(de)單突變(bian)(g37v)可(ke)(ke)賦予小麥發酵殼針孢克(ke)服醌內(nei)部(bu)抑(yi)制(zhi)劑(ji)(qii)(如(ru)吡(bi)啶(ding)(ding)菌(jun)(jun)胺(an)(fenpicoxamid)和(he)吡(bi)啶(ding)(ding)菌(jun)(jun)酰胺(an)(florylpicoxamid))的(de)殺真(zhen)(zhen)菌(jun)(jun)作用(yong)的(de)能力(li)。

技術實現思路

1、如背景技術部分中所(suo)討論的(de)，病原(yuan)體(ti)可(ke)以對(dui)殺(sha)有害(hai)生物劑產生抗(kang)性，使得殺(sha)有害(hai)生物劑在管(guan)理病原(yuan)體(ti)的(de)感染、繁殖和擴散方面變得不(bu)太(tai)有效或甚至無效。此外，病原(yuan)體(ti)的(de)毒力可(ke)能由于(yu)突變而改變，并且還根據植(zhi)物品種而不(bu)同。因此，需要(yao)仔細地(di)實施殺(sha)有害(hai)生物劑的(de)病害(hai)控制和抗(kang)性管(guan)理，以避免(mian)抗(kang)性的(de)快(kuai)速選(xuan)擇(ze)，導致(zhi)農(nong)民、農(nong)學(xue)家、農(nong)藝(yi)學(xue)家等可(ke)用于(yu)控制病原(yuan)體(ti)的(de)選(xuan)擇(ze)無效和減少。

2、本披露至少部分(fen)地(di)旨在解決(jue)這一挑戰。

3、根(gen)據本披露的(de)(de)方面(mian)，提供(gong)(gong)了(le)一(yi)(yi)種用于(yu)確(que)定(ding)某一(yi)(yi)位置(zhi)中植(zhi)物(wu)(wu)病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)(ti)的(de)(de)抗(kang)(kang)性和(he)(he)/或(huo)(huo)(huo)毒(du)力(li)(li)特性的(de)(de)方法(fa)(fa)。該方法(fa)(fa)包(bao)括接收包(bao)含植(zhi)物(wu)(wu)病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)(ti)的(de)(de)樣品，對樣品進行(xing)dna測序，基于(yu)dna測序確(que)定(ding)植(zhi)物(wu)(wu)病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)(ti)的(de)(de)至少(shao)一(yi)(yi)種遺(yi)傳(chuan)變異(yi)的(de)(de)存(cun)在(zai)，并且對該至少(shao)一(yi)(yi)種遺(yi)傳(chuan)變異(yi)進行(xing)定(ding)量；以及生成植(zhi)物(wu)(wu)病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)(ti)的(de)(de)抗(kang)(kang)性特性和(he)(he)/或(huo)(huo)(huo)毒(du)力(li)(li)特性。因此，該方法(fa)(fa)可以在(zai)植(zhi)物(wu)(wu)病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)(ti)的(de)(de)抗(kang)(kang)性發(fa)展和(he)(he)/或(huo)(huo)(huo)毒(du)力(li)(li)方面(mian)提供(gong)(gong)對植(zhi)物(wu)(wu)或(huo)(huo)(huo)植(zhi)物(wu)(wu)田地的(de)(de)診斷。為了(le)了(le)解病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)(ti)在(zai)某一(yi)(yi)位置(zhi)處(chu)的(de)(de)抗(kang)(kang)性和(he)(he)毒(du)力(li)(li)的(de)(de)發(fa)展，這可能(neng)特別有(you)用。它(ta)還可用于(yu)確(que)定(ding)當前季(ji)(ji)節(jie)(jie)(jie)和(he)(he)未來季(ji)(ji)節(jie)(jie)(jie)的(de)(de)更有(you)針對性的(de)(de)病(bing)害控(kong)制措施(shi)和(he)(he)/或(huo)(huo)(huo)抗(kang)(kang)性管(guan)理程序。例如，可以在(zai)一(yi)(yi)個季(ji)(ji)節(jie)(jie)(jie)內或(huo)(huo)(huo)針對未來季(ji)(ji)節(jie)(jie)(jie)選擇用于(yu)控(kong)制病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)(ti)的(de)(de)最有(you)效類型的(de)(de)殺真菌劑和(he)(he)/或(huo)(huo)(huo)最佳作物(wu)(wu)品種，使得可以避免具有(you)高抗(kang)(kang)性存(cun)在(zai)的(de)(de)殺真菌劑。

4、該方法的(de)dna測(ce)序可以在單(dan)個讀段中(zhong)提(ti)供植物病原體(ti)的(de)多個遺傳變異和(he)相關數量(liang)。這意(yi)味著可以同時監測(ce)一些或所(suo)(suo)有變異以及所(suo)(suo)有變異的(de)組合。此外，每種鑒定(ding)的(de)變異和(he)基因(yin)型的(de)定(ding)量(liang)提(ti)供了(le)對植物病原體(ti)或植物病原體(ti)群(qun)體(ti)的(de)更準確理解，使得可以提(ti)供用(yong)于病害(hai)控制和(he)抗(kang)性管理的(de)更有針對性的(de)處理程序。

5、生(sheng)成(cheng)抗(kang)性(xing)(xing)(xing)特性(xing)(xing)(xing)可以包括(kuo)將至少(shao)一(yi)種遺傳變異和(he)(he)相應(ying)數量(liang)與(yu)對殺有(you)害生(sheng)物劑和(he)(he)/或(huo)(huo)一(yi)組殺有(you)害生(sheng)物劑的(de)(de)抗(kang)性(xing)(xing)(xing)水平相關聯(lian)。另(ling)外(wai)或(huo)(huo)可替代地，生(sheng)成(cheng)毒(du)力(li)特性(xing)(xing)(xing)可以包括(kuo)將至少(shao)一(yi)種遺傳變異和(he)(he)相應(ying)數量(liang)與(yu)毒(du)力(li)水平相關聯(lian)。這提(ti)供了對存(cun)在于植物或(huo)(huo)某一(yi)位置(例如植物田地)中(zhong)的(de)(de)病原體(ti)或(huo)(huo)植物病原體(ti)群體(ti)的(de)(de)抗(kang)性(xing)(xing)(xing)和(he)(he)/或(huo)(huo)毒(du)力(li)的(de)(de)更好的(de)(de)總體(ti)理解。

6、該(gai)方法可以(yi)(yi)進一(yi)步包(bao)括基于(yu)抗性(xing)(xing)特(te)性(xing)(xing)和/或(huo)毒力(li)特(te)性(xing)(xing)確(que)(que)定(ding)用(yong)于(yu)控(kong)制(zhi)(zhi)植物(wu)病(bing)原體的發育、繁殖和/或(huo)生存(cun)力(li)的至(zhi)(zhi)少一(yi)種(zhong)病(bing)害(hai)控(kong)制(zhi)(zhi)措施(shi)(shi)。這(zhe)對(dui)于(yu)試圖控(kong)制(zhi)(zhi)田地中存(cun)在的病(bing)害(hai)的農(nong)民(min)、農(nong)學家、農(nong)藝學家等特(te)別有(you)用(yong)，因為病(bing)害(hai)控(kong)制(zhi)(zhi)措施(shi)(shi)可以(yi)(yi)針對(dui)田地中存(cun)在的病(bing)原體的特(te)定(ding)變體進行調整，同(tong)時管(guan)理抗性(xing)(xing)。例如，所(suo)確(que)(que)定(ding)的病(bing)害(hai)控(kong)制(zhi)(zhi)措施(shi)(shi)可以(yi)(yi)是至(zhi)(zhi)少一(yi)種(zhong)殺有(you)害(hai)生物(wu)劑，其中該(gai)殺有(you)害(hai)生物(wu)劑可以(yi)(yi)是至(zhi)(zhi)少一(yi)種(zhong)殺真菌(jun)劑。

7、該方法可(ke)以進(jin)(jin)一步包括接(jie)收(shou)包含植(zhi)(zhi)(zhi)物病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)的(de)(de)(de)已經經受至少一種病(bing)害控(kong)制措(cuo)(cuo)施的(de)(de)(de)后續樣(yang)品(pin)(pin)(pin)，對樣(yang)品(pin)(pin)(pin)進(jin)(jin)行(xing)dna測序(xu)，基于(yu)dna測序(xu)確定(ding)植(zhi)(zhi)(zhi)物病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)的(de)(de)(de)至少一種遺傳變(bian)異的(de)(de)(de)存在(zai)，并(bing)且(qie)(qie)對至少一種遺傳變(bian)異進(jin)(jin)行(xing)定(ding)量(liang)，生成植(zhi)(zhi)(zhi)物病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)的(de)(de)(de)抗(kang)性(xing)(xing)(xing)特(te)性(xing)(xing)(xing)和(he)/或(huo)(huo)毒力(li)特(te)性(xing)(xing)(xing)，并(bing)且(qie)(qie)將后續樣(yang)品(pin)(pin)(pin)的(de)(de)(de)抗(kang)性(xing)(xing)(xing)特(te)性(xing)(xing)(xing)和(he)/或(huo)(huo)毒力(li)特(te)性(xing)(xing)(xing)與先前樣(yang)品(pin)(pin)(pin)的(de)(de)(de)抗(kang)性(xing)(xing)(xing)特(te)性(xing)(xing)(xing)和(he)/或(huo)(huo)毒力(li)特(te)性(xing)(xing)(xing)進(jin)(jin)行(xing)比較。這可(ke)以深(shen)入了解所(suo)施用(yong)(yong)的(de)(de)(de)病(bing)害控(kong)制措(cuo)(cuo)施的(de)(de)(de)成功(gong)。例(li)如，它可(ke)以表明所(suo)施用(yong)(yong)的(de)(de)(de)病(bing)害控(kong)制措(cuo)(cuo)施是次(ci)優的(de)(de)(de)或(huo)(huo)成功(gong)地(di)控(kong)制植(zhi)(zhi)(zhi)物病(bing)原(yuan)(yuan)體(ti)，同時控(kong)制抗(kang)性(xing)(xing)(xing)發展(zhan)。另外(wai)，可(ke)以共享關于(yu)病(bing)害控(kong)制措(cuo)(cuo)施的(de)(de)(de)信息，例(li)如施用(yong)(yong)日期、施用(yong)(yong)的(de)(de)(de)植(zhi)(zhi)(zhi)物保護產品(pin)(pin)(pin)、施用(yong)(yong)率和(he)其他信息，從而能夠發出(chu)關于(yu)風險決策的(de)(de)(de)警報，并(bing)且(qie)(qie)為接(jie)下來的(de)(de)(de)季節提(ti)出(chu)可(ke)替(ti)代方案。

8、可以在植物病原體的宿主植物的分蘗階(jie)段(duan)(duan)收(shou)集(ji)樣品，并且可以在所述植物的果實發育階(jie)段(duan)(duan)收(shou)集(ji)后續樣品。這使得能夠在季(ji)節早期確定并施用適當的病害(hai)控(kong)制(zhi)措施，并且能夠評估所施用的病害(hai)控(kong)制(zhi)措施的有效性。

9、樣品(pin)和后續樣品(pin)可以從多(duo)個(ge)植物、孢子捕(bu)捉(zhuo)物和/或土壤中獲得的。這使(shi)得能夠分析各種類型的病原體并提出建議。

10、可以從(cong)該(gai)位(wei)(wei)置(zhi)獲得樣品和(he)/或(huo)后(hou)續樣品，并且該(gai)方法可以進一步包括(kuo)基于(yu)(yu)(yu)抗(kang)性和(he)/或(huo)毒力特性確定用于(yu)(yu)(yu)施(shi)用于(yu)(yu)(yu)相鄰(lin)位(wei)(wei)置(zhi)的(de)至少一種病害控制(zhi)(zhi)措施(shi)。這意味著(zhu)在(zai)(zai)一些(xie)情況下，可以假設存在(zai)(zai)于(yu)(yu)(yu)該(gai)位(wei)(wei)置(zhi)中(zhong)的(de)植物病原體(ti)的(de)變體(ti)也(ye)存在(zai)(zai)于(yu)(yu)(yu)相鄰(lin)位(wei)(wei)置(zhi)中(zhong)，使得針(zhen)對該(gai)位(wei)(wei)置(zhi)確定的(de)病害控制(zhi)(zhi)措施(shi)在(zai)(zai)相鄰(lin)位(wei)(wei)置(zhi)中(zhong)也(ye)可以有效(xiao)，而不(bu)必基于(yu)(yu)(yu)來(lai)自任何相鄰(lin)位(wei)(wei)置(zhi)的(de)樣品確定抗(kang)性和(he)/或(huo)毒力特性。

11、對(dui)樣品進行dna測(ce)序可(ke)以(yi)(yi)包(bao)括使用能夠(gou)在(zai)單個(ge)讀段(duan)中對(dui)至(zhi)(zhi)(zhi)少200個(ge)堿基對(dui)、優選地(di)至(zhi)(zhi)(zhi)少500個(ge)堿基對(dui)進行測(ce)序的(de)和(he)/或被(bei)配(pei)置為(wei)在(zai)單個(ge)實驗或運行中處理(li)至(zhi)(zhi)(zhi)少100個(ge)讀段(duan)的(de)測(ce)序儀(yi)。這樣的(de)測(ce)序儀(yi)可(ke)以(yi)(yi)使用納米孔(kong)測(ce)序技術和(he)/或單分子實時(shi)測(ce)序。這提供了(le)以(yi)(yi)下優勢：可(ke)以(yi)(yi)快(kuai)速(su)分析樣品并且實時(shi)、接(jie)近實時(shi)、瞬時(shi)或接(jie)近瞬時(shi)給出病(bing)害(hai)進展的(de)表現(xian)。因此，包(bao)括病(bing)害(hai)控制措施(shi)和(he)抗性管理(li)在(zai)內的(de)建議可(ke)以(yi)(yi)在(zai)季節內實施(shi)。與基于(yu)歷史數據(ju)的(de)建議相比(bi)，這提供了(le)更有效或最優的(de)建議。

12、該方法(fa)可以進一步(bu)包(bao)(bao)括(kuo)基于dna測序，確(que)定以小(xiao)(xiao)麥植物為(wei)宿(su)主的(de)(de)植物病(bing)原(yuan)體小(xiao)(xiao)麥發酵殼針孢中sdhc_079n、sdhc_086s和(he)/或sdhc_h152r遺傳(chuan)變體的(de)(de)存在，其中該方法(fa)進一步(bu)包(bao)(bao)括(kuo)推(tui)薦抗性小(xiao)(xiao)麥品種和(he)/或包(bao)(bao)含高內在活性sdhi或具有不同作(zuo)用(yong)方式的(de)(de)至少一種殺真(zhen)菌(jun)劑的(de)(de)噴霧程序作(zuo)為(wei)病(bing)害(hai)控(kong)制(zhi)措施(shi)，該殺真(zhen)菌(jun)劑包(bao)(bao)括(kuo)吡(bi)啶菌(jun)酰胺、吡(bi)啶菌(jun)胺、四(si)唑(zuo)(zuo)菌(jun)酮、氯(lv)氟醚菌(jun)唑(zuo)(zuo)和(he)/或丙硫(liu)菌(jun)唑(zuo)(zuo)。

13、該方(fang)法可(ke)以進一步包括(kuo)基于dna測序，確定以小麥(mai)(mai)植物(wu)(wu)為宿主(zhu)的植物(wu)(wu)病原體(ti)小麥(mai)(mai)發酵殼針(zhen)孢中cyp51_379g、cyp51_381v、cyp51_460、cyp51_524t遺傳變(bian)體(ti)的存在，其中該方(fang)法進一步包括(kuo)推薦(jian)抗性小麥(mai)(mai)品種和(he)/或高內在活性dmi或具有不同(tong)作用方(fang)式的至少一種殺真(zhen)菌(jun)劑(ji)(ji)的噴霧程序作為病害控制措施，該殺真(zhen)菌(jun)劑(ji)(ji)包括(kuo)吡(bi)啶(ding)菌(jun)酰(xian)胺(an)、吡(bi)啶(ding)菌(jun)胺(an)、四唑(zuo)菌(jun)酮、異丙氟(fu)吡(bi)菌(jun)胺(an)、氟(fu)唑(zuo)菌(jun)酰(xian)胺(an)、苯并烯(xi)氟(fu)菌(jun)唑(zuo)或氟(fu)唑(zuo)菌(jun)酰(xian)羥胺(an)。

14、在(zai)該方法中，接(jie)(jie)收(shou)包(bao)(bao)含植物(wu)病原體(ti)的樣品的步驟可以(yi)包(bao)(bao)括從作(zuo)物(wu)田(tian)地接(jie)(jie)收(shou)包(bao)(bao)含植物(wu)病原體(ti)的作(zuo)物(wu)樣品。

15、在(zai)一個實例中，用戶(hu)例如農(nong)民、農(nong)學(xue)家(jia)、農(nong)藝學(xue)家(jia)等收(shou)集(ji)樣品，然后將其發送(song)至進行本文所(suo)述(shu)的任何方(fang)法的組織(zhi)、公司或人員，然后用戶(hu)接收(shou)抗性(xing)和/或毒力特(te)性(xing)，和/或基于所(suo)述(shu)抗性(xing)特(te)性(xing)和/或毒力特(te)性(xing)用于控(kong)制(zhi)植物病原體(ti)的發育、繁殖(zhi)和/或生存力的至少一種病害控(kong)制(zhi)措施。