本發明(ming)屬于(yu)微生物(wu)合成生物(wu)學(xue)領域,具(ju)體涉及(ji)一種利用(yong)植(zhi)物(wu)維生素c合成途徑構(gou)建大(da)腸(chang)桿菌菌株合成維生素c的方法(fa)。
背景技術:
維生(sheng)素c(簡寫(xie)vc),又名抗壞血酸(suan),是一(yi)(yi)種水(shui)溶性維生(sheng)素。人(ren)類(lei)(lei)、猿猴(hou)、天竺(zhu)鼠(shu)和一(yi)(yi)些魚(yu)類(lei)(lei)、鳥類(lei)(lei)無法自行合成(cheng)維生(sheng)素c,需通過(guo)食(shi)物來(lai)供應(ying)身體(ti)(ti)所(suo)需。vc是一(yi)(yi)種必需維生(sheng)素,參(can)與(yu)膠原蛋白的合成(cheng),可(ke)預(yu)防動脈硬化;vc是一(yi)(yi)種強抗氧化劑,具有(you)保(bao)護細胞、解(jie)毒和保(bao)護肝臟作用;vc還(huan)可(ke)用于增強肌體(ti)(ti)免疫力(li),預(yu)防感(gan)冒等(deng)(deng)急(ji)、慢(man)性傳染病,還(huan)可(ke)用于病后(hou)恢(hui)復期(qi)、創傷(shang)愈(yu)合期(qi)及過(guo)敏性疾病的輔助治療,vc缺乏引起(qi)壞血病,造成(cheng)牙齦萎縮(suo)、出(chu)血等(deng)(deng)等(deng)(deng)病癥(zheng)。人(ren)類(lei)(lei)vc的主要食(shi)物來(lai)源:柑(gan)桔類(lei)(lei)水(shui)果、蔬菜(cai)等(deng)(deng)。食(shi)物中的vc能被(bei)人(ren)體(ti)(ti)小腸(chang)吸收(shou),分布(bu)到體(ti)(ti)內所(suo)有(you)的水(shui)溶性結構中,普通成(cheng)人(ren)體(ti)(ti)內vc代謝活(huo)性池中vc量(liang)1500mg左右(you)。
維生(sheng)素(su)c主(zhu)要應用在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)制藥(yao)、保健品、軟飲(yin)料及(ji)飼料添(tian)加等領(ling)域,主(zhu)要消費市場在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)歐美(mei)(mei)等發達國(guo)(guo)(guo)(guo)家。目前,全球(qiu)vc市場需(xu)求量約12萬噸。我國(guo)(guo)(guo)(guo)是(shi)(shi)全球(qiu)最(zui)大(da)的(de)(de)c生(sheng)產(chan)(chan)國(guo)(guo)(guo)(guo)和(he)出(chu)口(kou)國(guo)(guo)(guo)(guo),每年(nian)出(chu)口(kou)超過(guo)10億美(mei)(mei)元。但(dan)是(shi)(shi),每當人(ren)們提到vc產(chan)(chan)業(ye),自然就會聯(lian)想(xiang)到無情的(de)(de)價(jia)格戰,以羅氏(roche)為主(zhu)的(de)(de)跨國(guo)(guo)(guo)(guo)公司試圖擠(ji)垮中(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)的(de)(de)vc企業(ye),從1996年(nian)至2001年(nian),出(chu)現兩次降價(jia)狂潮,使vc價(jia)格從12美(mei)(mei)元/kg降到2001年(nian)的(de)(de)2.8美(mei)(mei)元/kg,使我國(guo)(guo)(guo)(guo)20多家企業(ye)被迫(po)停產(chan)(chan)。在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)幾(ji)輪競(jing)爭中(zhong),由于中(zhong)國(guo)(guo)(guo)(guo)企業(ye)首創“兩步(bu)發酵(jiao)法(fa)”生(sheng)產(chan)(chan)vc核心技(ji)術,在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)人(ren)力等成(cheng)(cheng)本(ben)(ben)上也(ye)有明(ming)顯(xian)競(jing)爭優勢(shi),保住了(le)vc產(chan)(chan)業(ye)的(de)(de)一席之(zhi)地,使國(guo)(guo)(guo)(guo)內企業(ye)與roche(dsm)和(he)basf形(xing)成(cheng)(cheng)了(le)三足(zu)鼎立之(zhi)勢(shi)。但(dan)是(shi)(shi)vc產(chan)(chan)業(ye)化技(ji)術的(de)(de)研(yan)發工作(zuo)并沒有停息(xi),如:eastman與genencor合(he)(he)作(zuo)開發的(de)(de)生(sheng)化觸媒法(fa),即(ji)用多個(ge)酶(mei)進行多步(bu)轉(zhuan)化,從玉米制造維生(sheng)素(su)c。其他國(guo)(guo)(guo)(guo)際大(da)廠也(ye)都(dou)在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)不斷(duan)降低制造成(cheng)(cheng)本(ben)(ben),如巴斯夫除(chu)了(le)致力于將目前的(de)(de)制造工藝(yi)進行優化外,也(ye)在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)開發或(huo)引進新(xin)的(de)(de)低成(cheng)(cheng)本(ben)(ben)制造工藝(yi)。目前,歐美(mei)(mei)廠商目前都(dou)在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)積極探索(suo)vc新(xin)的(de)(de)合(he)(he)成(cheng)(cheng)路徑。國(guo)(guo)(guo)(guo)內在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)“二步(bu)發酵(jiao)法(fa)”生(sheng)產(chan)(chan)vc研(yan)究和(he)應用領(ling)域均處(chu)于世(shi)界領(ling)先水平,但(dan)新(xin)的(de)(de)途徑研(yan)究投入不足(zu),在(zai)(zai)(zai)(zai)(zai)細菌“一步(bu)發酵(jiao)法(fa)”合(he)(he)成(cheng)(cheng)vc研(yan)究領(ling)域已經處(chu)于明(ming)顯(xian)劣勢(shi)。
在二步發酵法中,依次在d-山梨醇脫氫酶(sldh)、l-山梨糖脫氫酶(sdh)及l-山梨酮脫氫酶(sndh)的作用下,可以有效地將d-山梨醇轉化為維生素c的前體物質2-klg(尹光琳等,微生物學報,1980,20(3),246-251)。細菌山梨醇“一步發酵法”研發工作走在最前列的首推dsm,取得一系列領先成果,包括葡糖桿菌gluconobacteroxydansdsm17078全部kga代(dai)謝密(mi)切相關的(de)(de)(de)基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)(l-山(shan)(shan)梨酮(tong)脫氫(qing)酶(mei)基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)、d-山(shan)(shan)梨醇脫氫(qing)酶(mei)基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin),以(yi)及(ji)l-山(shan)(shan)梨糖脫氫(qing)酶(mei)基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)a、b、c、d)的(de)(de)(de)分(fen)離(li)克(ke)隆(usptopatent,20110250636),及(ji)以(yi)上基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)敲除或過表達(da)對(dui)kga生(sheng)物合成(cheng)(cheng)的(de)(de)(de)影(ying)響(xiang);糖轉運蛋白基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)sts24和sts01的(de)(de)(de)敲除或過表達(da)對(dui)kga生(sheng)物合成(cheng)(cheng)的(de)(de)(de)影(ying)響(xiang)(unitedstatespatent5437989);pqq生(sheng)物合成(cheng)(cheng)基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)對(dui)kga合成(cheng)(cheng)的(de)(de)(de)影(ying)響(xiang)(yuan等(deng)bmcbiotechnology,2016,16,1-14);以(yi)及(ji)其他基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)(vcs01和vcs08等(deng))對(dui)kga合成(cheng)(cheng)的(de)(de)(de)影(ying)響(xiang)(europeanpatentapplicationep1103603)。此外(wai),還嘗(chang)試了(le)多(duo)種技術手段對(dui)葡(pu)糖桿(gan)菌(jun)(jun)進行基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)改良,取得了(le)理想的(de)(de)(de)研究效果。申報相關國際發明專利30多(duo)項,專利覆蓋了(le)50多(duo)個細菌(jun)(jun)相關基(ji)(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)以(yi)及(ji)10多(duo)個細菌(jun)(jun)種類的(de)(de)(de)利用,包括大腸桿(gan)菌(jun)(jun)、假單胞菌(jun)(jun)、泛菌(jun)(jun)、谷氨(an)酸棒桿(gan)菌(jun)(jun)、普(pu)通酮(tong)古龍(long)酸菌(jun)(jun)、氧(yang)化葡(pu)萄糖酸桿(gan)菌(jun)(jun)、醋細菌(jun)(jun)和葡(pu)糖醋桿(gan)菌(jun)(jun)等(deng)。
大(da)部分(fen)(fen)的(de)(de)(de)(de)(de)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)和(he)動物(wu)(wu)(wu)(wu)都可以通(tong)過(guo)(guo)一(yi)(yi)系列(lie)的(de)(de)(de)(de)(de)酶(mei)(mei)促(cu)反應轉化(hua)(hua)(hua)d-葡萄糖合成(cheng)(cheng)(cheng)維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c。在(zai)(zai)(zai)真核生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)中(zhong),維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c可以通(tong)過(guo)(guo)兩個不(bu)(bu)同的(de)(de)(de)(de)(de)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)化(hua)(hua)(hua)途(tu)徑(jing)合成(cheng)(cheng)(cheng)。在(zai)(zai)(zai)鼠類及(ji)其(qi)它(ta)的(de)(de)(de)(de)(de)哺(bu)乳(ru)動物(wu)(wu)(wu)(wu)中(zhong),葡萄糖通(tong)過(guo)(guo)一(yi)(yi)個復(fu)雜途(tu)徑(jing)轉化(hua)(hua)(hua)成(cheng)(cheng)(cheng)l-古洛糖酸(suan)-1,4-內酯。這一(yi)(yi)途(tu)徑(jing)是由終端酶(mei)(mei)l-古洛糖酸(suan)-1,4-內酯氧(yang)化(hua)(hua)(hua)酶(mei)(mei)在(zai)(zai)(zai)動物(wu)(wu)(wu)(wu)界中(zhong)的(de)(de)(de)(de)(de)普遍存(cun)(cun)在(zai)(zai)(zai)推斷而來的(de)(de)(de)(de)(de)。而在(zai)(zai)(zai)人類及(ji)其(qi)它(ta)一(yi)(yi)些動物(wu)(wu)(wu)(wu)中(zhong),編碼l-古洛糖酸(suan)-1,4-內酯氧(yang)化(hua)(hua)(hua)酶(mei)(mei)的(de)(de)(de)(de)(de)基因發(fa)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)了突變(bian),造(zao)成(cheng)(cheng)(cheng)其(qi)合成(cheng)(cheng)(cheng)維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c能力的(de)(de)(de)(de)(de)喪失。大(da)多(duo)數的(de)(de)(de)(de)(de)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)細(xi)(xi)胞(bao)(bao)中(zhong)都有(you)大(da)量維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c的(de)(de)(de)(de)(de)合成(cheng)(cheng)(cheng),它(ta)在(zai)(zai)(zai)過(guo)(guo)氧(yang)化(hua)(hua)(hua)物(wu)(wu)(wu)(wu)、臭氧(yang)及(ji)自(zi)由基的(de)(de)(de)(de)(de)解毒方面起著至關重要的(de)(de)(de)(de)(de)作用(yong)。另外(wai),維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c在(zai)(zai)(zai)通(tong)過(guo)(guo)水溶性(xing)抗氧(yang)化(hua)(hua)(hua)劑(α-生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)育酚)、玉米(mi)黃質和(he)ph介導的(de)(de)(de)(de)(de)psii活性(xing)的(de)(de)(de)(de)(de)再生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)調節光(guang)合作用(yong)活性(xing)的(de)(de)(de)(de)(de)過(guo)(guo)程中(zhong)是必不(bu)(bu)可少的(de)(de)(de)(de)(de)。植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)細(xi)(xi)胞(bao)(bao)可以積累大(da)量的(de)(de)(de)(de)(de)維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c,特別(bie)是在(zai)(zai)(zai)綠色組(zu)織和(he)貯藏器官中(zhong)。因為在(zai)(zai)(zai)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)細(xi)(xi)胞(bao)(bao)中(zhong)存(cun)(cun)在(zai)(zai)(zai)由d-半乳(ru)糖生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)成(cheng)(cheng)(cheng)維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c的(de)(de)(de)(de)(de)完(wan)整合成(cheng)(cheng)(cheng)途(tu)徑(jing),目前研究人員已經開(kai)始(shi)嘗試(shi)利用(yong)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)細(xi)(xi)胞(bao)(bao)或微藻(zao)(zao)培養物(wu)(wu)(wu)(wu)通(tong)過(guo)(guo)發(fa)酵(jiao)(jiao)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)產(chan)(chan)維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c。據報(bao)道,running等人分(fen)(fen)離得(de)(de)到的(de)(de)(de)(de)(de)小球藻(zao)(zao)突變(bian)體產(chan)(chan)維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c的(de)(de)(de)(de)(de)產(chan)(chan)量從0.64mg/g干細(xi)(xi)胞(bao)(bao)提高到45mg/g細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(journalofappliedphycology,1994,6(2),99-104),但是這與(yu)工(gong)業上采用(yong)的(de)(de)(de)(de)(de)經典(dian)二步(bu)發(fa)酵(jiao)(jiao)法的(de)(de)(de)(de)(de)高產(chan)(chan)量尚無競(jing)爭性(xing)。進(jin)一(yi)(yi)步(bu)提高利用(yong)植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)細(xi)(xi)胞(bao)(bao)或藻(zao)(zao)類一(yi)(yi)步(bu)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)產(chan)(chan)維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c的(de)(de)(de)(de)(de)產(chan)(chan)量需要進(jin)行系統的(de)(de)(de)(de)(de)代謝工(gong)程改(gai)(gai)造(zao),然(ran)而植(zhi)(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(wu)(wu)中(zhong)維(wei)(wei)(wei)生(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)(sheng)素(su)(su)c合成(cheng)(cheng)(cheng)途(tu)徑(jing)的(de)(de)(de)(de)(de)研究進(jin)展非(fei)常緩慢使(shi)得(de)(de)代謝工(gong)程改(gai)(gai)造(zao)很難操作。
植(zhi)(zhi)物中初始(shi)的(de)(de)(de)(de)維生(sheng)素c合(he)(he)成(cheng)模型是(shi)根據動物中的(de)(de)(de)(de)合(he)(he)成(cheng)機(ji)理建(jian)立(li)的(de)(de)(de)(de)。然(ran)而(er),植(zhi)(zhi)物細胞中是(shi)不含l-古(gu)洛糖(tang)酸-1,4-內酯氧化酶的(de)(de)(de)(de),多年來一直(zhi)未得到植(zhi)(zhi)物中維生(sheng)素c合(he)(he)成(cheng)途徑的(de)(de)(de)(de)直(zhi)接證據,直(zhi)到后(hou)來利(li)用擬(ni)南芥中影(ying)響維生(sheng)素c生(sheng)物合(he)(he)成(cheng)突變體的(de)(de)(de)(de)鑒定(ding),提出了(le)經過gdp-甘露糖(tang)和l-半(ban)乳糖(tang)的(de)(de)(de)(de)維生(sheng)素c從頭合(he)(he)成(cheng)途徑。在隨后(hou)的(de)(de)(de)(de)幾年間(jian),研究(jiu)者提出了(le)植(zhi)(zhi)物細胞中還可能存在一些其它的(de)(de)(de)(de)維生(sheng)素c合(he)(he)成(cheng)途徑,但目前對這(zhe)些新(xin)合(he)(he)成(cheng)途徑的(de)(de)(de)(de)認識比較有限。
植物細胞中(zhong)維生(sheng)(sheng)素(su)c從(cong)葡(pu)萄糖(tang)(tang)(tang)(tang)開始合(he)成(cheng)(cheng)(cheng)(cheng)途(tu)徑(jing)涉及10個酶(mei)(mei),擬(ni)南芥中(zhong)這10個酶(mei)(mei)包括:athxk1、atpgi、atdin9、atpmm、atvtc1、atgme、atvtc2、atvtc4、atgaldh和atgldh(conklin,genetics,2000,154,847-856)。葡(pu)萄糖(tang)(tang)(tang)(tang)在(zai)己(ji)糖(tang)(tang)(tang)(tang)激酶(mei)(mei)hxk催(cui)化(hua)(hua)下(xia)轉(zhuan)化(hua)(hua)為(wei)葡(pu)萄糖(tang)(tang)(tang)(tang)-6-磷(lin)酸(suan)(suan),再經(jing)磷(lin)酸(suan)(suan)葡(pu)萄糖(tang)(tang)(tang)(tang)異(yi)構(gou)(gou)酶(mei)(mei)pgi轉(zhuan)化(hua)(hua)為(wei)果糖(tang)(tang)(tang)(tang)-6-磷(lin)酸(suan)(suan),磷(lin)酸(suan)(suan)甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang)異(yi)構(gou)(gou)酶(mei)(mei)(pmi或din9)將(jiang)果糖(tang)(tang)(tang)(tang)-6-磷(lin)酸(suan)(suan)轉(zhuan)化(hua)(hua)為(wei)d-甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang)-6-磷(lin)酸(suan)(suan),在(zai)甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang)變位酶(mei)(mei)(pmm)催(cui)化(hua)(hua)下(xia)轉(zhuan)化(hua)(hua)為(wei)d-甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang)-1-磷(lin)酸(suan)(suan),進一步(bu)經(jing)過gdp-甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang)焦磷(lin)酸(suan)(suan)化(hua)(hua)酶(mei)(mei)(vtc1)催(cui)化(hua)(hua)形成(cheng)(cheng)(cheng)(cheng)gdp-d-甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang),再經(jing)過gdp-甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang)-3’5’異(yi)構(gou)(gou)酶(mei)(mei)(gme)作用下(xia)合(he)成(cheng)(cheng)(cheng)(cheng)gdp-l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)。gdp-l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)通過半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)途(tu)徑(jing)合(he)成(cheng)(cheng)(cheng)(cheng)vc,其中(zhong)需(xu)要gdp-l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)磷(lin)酸(suan)(suan)化(hua)(hua)酶(mei)(mei)(vtc2)將(jiang)gdp-l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)轉(zhuan)化(hua)(hua)為(wei)l-甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang)-1-磷(lin)酸(suan)(suan),l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)-1-磷(lin)酸(suan)(suan)酯(zhi)酶(mei)(mei)(vtc4)將(jiang)l-甘(gan)(gan)(gan)露(lu)(lu)糖(tang)(tang)(tang)(tang)-1-磷(lin)酸(suan)(suan)轉(zhuan)化(hua)(hua)為(wei)l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang),l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)脫氫(qing)酶(mei)(mei)(galdh)將(jiang)l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)轉(zhuan)化(hua)(hua)為(wei)l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)-1,4-內(nei)酯(zhi),最后在(zai)l-半(ban)(ban)(ban)(ban)(ban)乳(ru)(ru)(ru)糖(tang)(tang)(tang)(tang)-1,4-內(nei)酯(zhi)脫氫(qing)酶(mei)(mei)(gldh)作用下(xia)合(he)成(cheng)(cheng)(cheng)(cheng)維生(sheng)(sheng)素(su)c。植物中(zhong)維生(sheng)(sheng)素(su)c合(he)成(cheng)(cheng)(cheng)(cheng)途(tu)徑(jing)的發(fa)(fa)現使得(de)實現由(you)葡(pu)萄糖(tang)(tang)(tang)(tang)、淀粉或者(zhe)纖維素(su)直接發(fa)(fa)酵(jiao)生(sheng)(sheng)產維生(sheng)(sheng)素(su)c成(cheng)(cheng)(cheng)(cheng)為(wei)可能(neng)。
技術實現要素:
本發明的目的在(zai)于(yu)提供一(yi)種利(li)用大(da)(da)腸(chang)桿菌(jun)生產維(wei)生素(su)c的方法,該方法通過將植物維(wei)生素(su)c合成(cheng)途(tu)徑中的11個基(ji)因轉化到大(da)(da)腸(chang)桿菌(jun)中,使(shi)大(da)(da)腸(chang)桿菌(jun)能夠(gou)直接利(li)用葡萄糖為(wei)(wei)碳源,轉化為(wei)(wei)維(wei)生素(su)c。
為達到上述目的,本(ben)發明(ming)的技術(shu)方(fang)案(an)是。
一(yi)種利用植物的(de)維(wei)生素c合(he)(he)成(cheng)途徑創制一(yi)步(bu)發酵(jiao)合(he)(he)成(cheng)維(wei)生素c大(da)(da)腸桿(gan)菌(jun)菌(jun)株的(de)方法:將(jiang)植物的(de)維(wei)生素c合(he)(he)成(cheng)的(de)基因構建(jian)多(duo)基因單順(shun)反子組(zu)成(cheng)的(de)原核表達載(zai)體;將(jiang)所(suo)述原核表達載(zai)體轉化(hua)到大(da)(da)腸桿(gan)菌(jun)中。
優選地,所述植物的維生(sheng)素c合成的基因來源于草莓。
優(you)選地,所述植物的(de)(de)維生(sheng)素c合成的(de)(de)基因通過(guo)多基因定(ding)點突變(bian)方法消(xiao)除了基因中常用的(de)(de)限制性內切酶位點。這些(xie)位點包括ecori、sali、bamhi、kpni,xbai、saci和hindiii。
優選(xuan)地,多基(ji)因單(dan)順反子組成的(de)原核表達載(zai)體由(you)t7表達系統組成,11個改(gai)造的(de)維生素c合成基(ji)因全(quan)部使用t7啟(qi)動(dong)子和終止子控制,構建基(ji)因表達元件。
所(suo)述維生素c合(he)(he)成的(de)(de)原核表達(da)載(zai)(zai)(zai)體(ti)(ti)的(de)(de)構建方法為:利(li)用改良的(de)(de)“重疊延伸(shen)pcr技(ji)術(shu)”構建維生素c合(he)(he)成所(suo)有11個基(ji)因(yin)的(de)(de)表達(da)盒。在pcambia-1301載(zai)(zai)(zai)體(ti)(ti)的(de)(de)基(ji)礎上,通過在ecori和(he)(he)hindiii限制性內切酶(mei)切點(dian)間(jian)(jian)插(cha)入(ru)的(de)(de)多克隆位點(dian)片段,可(ke)以構成多基(ji)因(yin)表達(da)單元,該載(zai)(zai)(zai)體(ti)(ti)的(de)(de)ecori和(he)(he)sali,sali和(he)(he)bamhi,bamhi和(he)(he)kpni,kpni和(he)(he)xbai,xbai和(he)(he)hindiii限制性內切酶(mei)切點(dian)之間(jian)(jian)均可(ke)以插(cha)入(ru)基(ji)因(yin)表達(da)盒,從而構成多基(ji)因(yin)表達(da)載(zai)(zai)(zai)體(ti)(ti)。
所述構建的大(da)腸(chang)桿菌表達載體pyb2130通過(guo)電擊法導入到(dao)大(da)腸(chang)桿菌中。
優選地(di),所(suo)(suo)述大腸桿菌包括bl21(de3)等(deng)所(suo)(suo)有(you)含有(you)t7rna聚合酶的菌株。
本發(fa)明的有益(yi)效果如下。
1,當大腸桿菌獲得植物的維(wei)生(sheng)素c合成(cheng)(cheng)基因后能夠合成(cheng)(cheng)維(wei)生(sheng)素c。
2,通過(guo)本(ben)發明構建的(de)大腸桿菌菌株可以直接(jie)將葡萄糖(tang)轉化(hua)為維生素c。
3,該套體系操作簡單,避免了使用兩步(bu)發酵過程的麻煩。
附圖說明
圖1為本發明實施例中構建(jian)的維生(sheng)素c原(yuan)核表達載(zai)體pyb2130。
圖(tu)2為本(ben)發明實(shi)施例中大腸桿菌發酵后檢測。
具體實施方式
以下(xia)實施(shi)例中涉(she)及(ji)的構建維生素c合成原核表(biao)達載(zai)體pyb2130,其具體的構建方法如下(xia)。
草莓果實總rna,cdna合成(cheng)試劑盒(he)為clontech公(gong)(gong)司(si)產品(pin);dna柱回收試劑盒(he)購(gou)置(zhi)amersham公(gong)(gong)司(si);試劑rna抽提(ti)試劑盒(he)rneasyplantminikit為qiagen公(gong)(gong)司(si)產品(pin);各種(zhong)限制性內(nei)切(qie)酶和t4dnaligase均購(gou)自上海takara公(gong)(gong)司(si)。總rna采用qiagen公(gong)(gong)司(si)的rneasyplantminikit提(ti)取。
取約50μl草莓草莓果實總rna進行(xing)cdna合成,cdna的合成按clontech公(gong)司smartcdnalibraryconstructionkit說(shuo)明書(shu)操(cao)作(zuo)進行(xing)第一鏈合成。
1、構建改造的(de)草莓己糖磷酸激酶基因(fvhxk1)。
從草莓中克隆己糖磷酸激(ji)酶(mei)基因并利用定(ding)點突變方法將90位(wei)(wei)(wei)xhoi限(xian)制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)位(wei)(wei)(wei)點;229位(wei)(wei)(wei)hindiii限(xian)制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)位(wei)(wei)(wei)點;632位(wei)(wei)(wei)saci限(xian)制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)位(wei)(wei)(wei)點;720位(wei)(wei)(wei)kpni限(xian)制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)位(wei)(wei)(wei)點;935和(he)1148位(wei)(wei)(wei)bgii限(xian)制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)位(wei)(wei)(wei)點;1238位(wei)(wei)(wei)bamhi限(xian)制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)位(wei)(wei)(wei)點;1342位(wei)(wei)(wei)ecori限(xian)制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)位(wei)(wei)(wei)點消(xiao)除。
以合(he)成的cdna第一鏈為模板,擴增引物:hxk1:atggggaaggtggcggtgggt(seqidno.1所示(shi)(shi)),hxk2:ttaggagtcctcgacaccaag(seqidno.2所示(shi)(shi))。pcr反應條件:98℃預變(bian)性3min;94℃變(bian)性30s,60℃退(tui)火(huo)30s,72℃延伸90s,30個循環;72℃保溫10min。pcr結(jie)束后(hou),采用酚:氯仿(fang)抽提,再(zai)加入(ru)2倍體積(ji)的無水乙醇進行沉(chen)淀。沉(chen)淀用30μl水溶解,取1μl為模板。
90位xhoi限制性內切酶位突變引物(wu):90z:gagattgaaaagcttgagga(seqidno.3所示(shi));90f:tcctcaagcttttcaatctc(seqidno.4所示(shi))。
229位hindiii限制性內切酶位突變引物:229z:agcaagcctaagatgctcatcag(seqidno.5所示);229f:ctgatgagcatcttaggcttgct(seqidno.6所示)。
632位saci限制性內切(qie)酶位突(tu)變引物:632z:cagagttcaccaaatcagtgga(seqidno.7所示);632f:tccactgatttggtgaactctg(seqidno.8所示)。
720位(wei)kpni限(xian)制性內(nei)切(qie)酶位(wei)突變(bian)引(yin)物(wu):720z:aggtaacacaatccgcatgt(seqidno.9所示);720f:acatgcggattgtgttacct(seqidno.10所示)。
935位bglii限制性內(nei)切酶位突(tu)變引物:935z:agaactttgagaagattatttc(seqidno.11所示);935f:gaaataatcttctcaaagttct(seqidno.12所示)。
1148位(wei)(wei)bglii限制性內切酶位(wei)(wei)突變引物(wu):1148z:gaaggatatcttagagacct(seqidno.13所示);1148f:aggtctctaagatatccttc(seqidno.14所示)。
1238位bamhi限制性內切酶位突變引(yin)物:1238z:ctgggattctgggagtcctta(seqidno.15所(suo)示);1238f:taaggactcccagaatcccag(seqidno.16所(suo)示)。
以引物(wu)hxk1和(he)90f;90z和(he)229f;229z和(he)632f;632z和(he)720f;720z和(he)935f;935z和(he)1148f;1148z和(he)1238f;1238z和(he)hxk2進行pcr擴(kuo)增,擴(kuo)增條(tiao)件(jian)為(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共25個循環,pcr結束后,dna片(pian)斷用(yong)10%丙烯(xi)酰(xian)胺膠回(hui)收(shou)(shou),將(jiang)上述8個回(hui)收(shou)(shou)片(pian)斷取10-100ng為(wei)模板混合(he),以hxk1和(he)hxk2為(wei)引物(wu)將(jiang)上述片(pian)斷拼接,擴(kuo)增條(tiao)件(jian)為(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共25個循環。pcr結束后,dna柱回(hui)收(shou)(shou)pcr片(pian)斷。將(jiang)片(pian)段進行ta克隆,獲得(de)質(zhi)粒t1,并將(jiang)質(zhi)粒t1高效轉化到大腸桿菌dh5α感受態細胞中(zhong)。
2、構(gou)建改造的草莓己(ji)糖磷酸異構(gou)酶(pgi)基(ji)因fvpgi。
從(cong)草莓(mei)中克隆草莓(mei)己糖磷酸異構酶(mei)并(bing)利用定(ding)點(dian)突(tu)變方法將264位(wei)xbai限制性(xing)內(nei)(nei)切(qie)酶(mei)位(wei)點(dian);293位(wei)saci限制性(xing)內(nei)(nei)切(qie)酶(mei)位(wei)點(dian);1126位(wei)bamhi限制性(xing)內(nei)(nei)切(qie)酶(mei)位(wei)點(dian);1294位(wei)sphi限制性(xing)內(nei)(nei)切(qie)酶(mei)位(wei)點(dian);1504位(wei)bgii限制性(xing)內(nei)(nei)切(qie)酶(mei)位(wei)點(dian)消除。
擴增引物為:pgi1:5’-atggcatctatctctggtatctgttc-3’(seqidno.17所示)pgi2:5’-taggagtacagtgcatcgacgttg-3’(seqidno.18所示)。pcr反應(ying)條(tiao)件:98℃預變(bian)性(xing)3min;94℃變(bian)性(xing)30s,60℃退火30s,72℃延伸120s,30個(ge)循環;72℃保溫(wen)10min。pcr結(jie)束后,采(cai)用酚:氯仿抽(chou)提,再加入2倍體積的無水乙醇進行沉淀。沉淀用30μl水溶解,取1μl為模板。
264位(wei)xbai和293位(wei)saci限制性內切酶(mei)位(wei)突變(bian)引物:264z:tcttgactggctgtaccagcacaaggagttcg(seqidno.19所示(shi));264f:cgaactccttgtgctggtacagccagtcaaga(seqidno.20所示(shi))。
1126位(wei)bamhi限制性內切(qie)酶位(wei)突變引物:1126z:ggaaccaaggatatggttgttct(seqidno.21所(suo)示);1126f:agaacaaccatatccttggttcc(seqidno.22所(suo)示)。
1294位(wei)sphi限制性內切(qie)酶位(wei)突變引物:1294z:ggagcacggatcagcttgca(seqidno.23所示(shi));1294f:tgcaagctgatccgtgctcc(seqidno.24所示(shi))。
1504位bglii限制性內(nei)切酶位突變引物:1504z:gaagaagtaacacctagaact(seqidno.25所(suo)示);1504f:agttctaggtgttacttcttc(seqidno.26所(suo)示)。
以引(yin)(yin)物pgi1和(he)(he)(he)264f;264z和(he)(he)(he)1126f;1126z和(he)(he)(he)1294f;1294z和(he)(he)(he)1504f;1504z和(he)(he)(he)pgi2進行pcr擴(kuo)增(zeng),擴(kuo)增(zeng)條件(jian)(jian)為(wei)(wei):94℃預(yu)熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共25個(ge)循(xun)環,pcr結束后,dna片(pian)斷用10%丙烯酰胺膠(jiao)回收(shou),將上述8個(ge)回收(shou)片(pian)斷取10-100ng為(wei)(wei)模板混合(he),以pgi1和(he)(he)(he)pgi2為(wei)(wei)引(yin)(yin)物將上述片(pian)斷拼接(jie),擴(kuo)增(zeng)條件(jian)(jian)為(wei)(wei):94℃預(yu)熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共25個(ge)循(xun)環。pcr結束后,dna柱(zhu)回收(shou)pcr片(pian)斷。將片(pian)段進行ta克(ke)隆,獲得質粒t2,并將質粒t2高效轉化到大(da)腸桿菌dh5α感受態細胞中。
3、構(gou)建改造的草(cao)莓磷酸甘露糖異構(gou)酶(mei)(pmi)基因(yin)fvpmi。
從草莓(mei)中克隆(long)甘露糖(tang)異構酶(mei)(mei)基(ji)因并利用定點突變方(fang)法(fa)將817位(wei)(wei)hindiii限制性(xing)內(nei)切酶(mei)(mei)位(wei)(wei)點;1038位(wei)(wei)kpni限制性(xing)內(nei)切酶(mei)(mei)位(wei)(wei)點;1110和1221位(wei)(wei)psti限制性(xing)內(nei)切酶(mei)(mei)位(wei)(wei)點消除(chu)。
以合成的(de)cdna第一鏈為(wei)模板(ban),擴增引物為(wei):pmi1:5’-atggagaagtccatgatcgagaagtc-3’(seqidno.27所(suo)示(shi))pmi2:5’-ttatggcagctggaagaacatggagt-3’(seqidno.28所(suo)示(shi))。pcr反應條(tiao)件:98℃預變性3min;94℃變性30s,60℃退火(huo)30s,72℃延伸90s,30個(ge)循環(huan);72℃保溫10min。pcr結束(shu)后,采用(yong)酚:氯仿(fang)抽提,再加(jia)入(ru)2倍體積的(de)無水乙醇進行沉淀。沉淀用(yong)30μl水溶解,取1μl為(wei)模板(ban)。
817位hindiii限制性內切酶位突變(bian)引物:817z:ctcaactatgtcaaggtt(seqidno.29所示(shi));817f:aaccttgacatagttgag(seqidno.30所示(shi))。
1038位kpni和1110位psti限(xian)制性內切酶(mei)位突變引物(wu):1038z:ggttcctcccaccttttgacgagtttgaggtcgatcggtgccatcttccccagggagaatcagtggaatttcctgaag(seqidno.31所示);1038f:cttcaggaaattccactgattctccctggggaagatggcaccgatcgacctcaaactcgtcaaaaggtgggaggaacc(seqidno.32所示)。
1221位psti限(xian)制性內切酶位突變(bian)引物:1221z:cttttcgtgcctgaaggt(seqidno.33所示);1221f:accttcaggcacgaaaag(seqidno.34所示)。
以(yi)引物(wu)pmi1和(he)817f;817z和(he)1038f;1038z和(he)1221f;1221z和(he)720f;720z和(he)935f;935z和(he)1148f;1148z和(he)1238f;1238z和(he)pmi2進(jin)行(xing)pcr擴(kuo)增(zeng),擴(kuo)增(zeng)條(tiao)件(jian)為:94℃預熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共25個循(xun)環,pcr結束后,dna片(pian)斷(duan)用(yong)10%丙(bing)烯酰(xian)胺膠回收,將上述(shu)(shu)8個回收片(pian)斷(duan)取(qu)10-100ng為模(mo)板混合,以(yi)pmi1和(he)pmi2為引物(wu)將上述(shu)(shu)片(pian)斷(duan)拼(pin)接,擴(kuo)增(zeng)條(tiao)件(jian)為:94℃預熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共25個循(xun)環。pcr結束后,dna柱回收pcr片(pian)斷(duan)。將片(pian)段進(jin)行(xing)ta克隆,獲得(de)質粒(li)t3,并將質粒(li)t3高效(xiao)轉化到大腸桿(gan)菌dh5α感受態細(xi)胞中。
4、構建改(gai)造的草莓磷酸甘露糖變位酶(pmm)基因fvpmm。
從草(cao)莓中克隆磷酸甘(gan)露(lu)糖變(bian)位(wei)酶(mei)(mei)基因并利用定點(dian)突變(bian)方法將(jiang)139位(wei)bamhi限制(zhi)性內切酶(mei)(mei)位(wei)點(dian);537位(wei)hindiii限制(zhi)性內切酶(mei)(mei)位(wei)點(dian)消除。
以合成的cdna第一鏈為(wei)模(mo)板,擴增引物為(wei):pmm1:5’-atggctgtcatgaagcctggtgtc-3’(seqidno.35所(suo)(suo)示)pmm2:5’-ttaggaagagaagaacagagccttaac-3’(seqidno.36所(suo)(suo)示)。pcr反應條件:98℃預變性3min;94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延伸60s,30個循(xun)環;72℃保溫10min。pcr結束后,采用酚:氯仿抽提,再(zai)加入2倍體積(ji)的無水(shui)乙醇進行沉(chen)淀。沉(chen)淀用30μl水(shui)溶(rong)解,取1μl為(wei)模(mo)板。
139位(wei)(wei)bamhi限制性內切酶位(wei)(wei)突變引物(wu):139z:cagtgggcattgttggaggaacc(seqidno.37所示(shi));139f:ggttcctccaacaatgcccactg(seqidno.38所示(shi))。
537位hindiii限(xian)制性內切酶位突變(bian)引物:537z:gatatgctttgatgtttttcctc(seqidno.39所(suo)(suo)示(shi));537f:gaggaaaaacatcaaagcatatc(seqidno.40所(suo)(suo)示(shi))。
以引(yin)物pmm1和(he)(he)139f;139z和(he)(he)537f;537z和(he)(he)pmm2進行(xing)pcr擴(kuo)增,擴(kuo)增條件為(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共25個循(xun)環,pcr結束后,dna片(pian)(pian)斷用(yong)10%丙烯酰胺(an)膠回收,將(jiang)(jiang)上(shang)述8個回收片(pian)(pian)斷取10-100ng為(wei)模板混合,以pmm1和(he)(he)pmm2為(wei)引(yin)物將(jiang)(jiang)上(shang)述片(pian)(pian)斷拼接(jie),擴(kuo)增條件為(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共25個循(xun)環。pcr結束后,dna柱回收pcr片(pian)(pian)斷。將(jiang)(jiang)片(pian)(pian)段進行(xing)ta克隆,獲得質粒(li)t4,并(bing)將(jiang)(jiang)質粒(li)t4高效轉(zhuan)化到大腸桿菌dh5α感受態細胞中。
5、構建改造的草莓gdp-d-甘露(lu)糖焦磷酸(suan)化酶(mei)(gmpase,vtc1)基因fvvtc。
從草莓(mei)中克(ke)隆gdp-d-甘露糖焦磷(lin)酸(suan)化酶(mei)基(ji)因并利(li)用定點突變方法將367位ecori限制(zhi)性內(nei)切酶(mei)位點;904位sphi限制(zhi)性內(nei)切酶(mei)位點消除。
以合成的(de)cdna第一鏈為模(mo)板,擴增引物為:vtc1z:5’-atgaaggcactgattctggtcggt-3’(seqidno.41所(suo)示(shi))vtc1f:5’-ttacatgacgatctcaggcttc-3’(seqidno.42所(suo)示(shi))。pcr反(fan)應條件:98℃預變性3min;94℃變性30s,60℃退火(huo)30s,72℃延(yan)伸60s,30個循(xun)環;72℃保溫(wen)10min。pcr結束后,采用酚(fen):氯仿(fang)抽提,再加入2倍體(ti)積的(de)無水乙(yi)醇進行沉(chen)淀。沉(chen)淀用30μl水溶解,取1μl為模(mo)板。
367位ecori限(xian)制性內(nei)切酶位突(tu)變引物:367z:tggattccataaatcccatg(seqidno.43所示);367f:catgggatttatggaatcca(seqidno.44所示)。
904位sphi限制性內(nei)切酶位突變引物:904z:tcggatcaagaagcttgcttg(seqidno.45所(suo)示);904f:caagcaagcttcttgatccga(seqidno.46所(suo)示)。
以引(yin)物(wu)vtc1z和(he)367f;367z和(he)904f;904z和(he)vtc1f進行pcr擴增(zeng),擴增(zeng)條(tiao)件(jian)(jian)為:94℃預熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共(gong)25個循環,pcr結束(shu)后(hou),dna片(pian)斷(duan)(duan)用(yong)10%丙烯酰胺膠回(hui)收,將(jiang)上述(shu)(shu)8個回(hui)收片(pian)斷(duan)(duan)取10-100ng為模板混合,以vtc1z和(he)vtc1f為引(yin)物(wu)將(jiang)上述(shu)(shu)片(pian)斷(duan)(duan)拼(pin)接,擴增(zeng)條(tiao)件(jian)(jian)為:94℃預熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共(gong)25個循環。pcr結束(shu)后(hou),dna柱回(hui)收pcr片(pian)斷(duan)(duan)。將(jiang)片(pian)段(duan)進行ta克隆,獲得質(zhi)粒t5,并將(jiang)質(zhi)粒t5高效(xiao)轉(zhuan)化到大腸桿菌dh5α感(gan)受態細胞中(zhong)。
6、構建改造的(de)草莓gdp-d-甘(gan)露糖-3,5-表異構酶(gme)fvgme。
從草莓(mei)中克隆gdp-d-甘露(lu)糖-3,5-表(biao)異構(gou)酶基(ji)因并利(li)用(yong)定點突變方法將(jiang)217位(wei)ecori限(xian)制(zhi)性內切酶位(wei)點;667位(wei)psti限(xian)制(zhi)性內切酶位(wei)點消除。
以合成(cheng)的(de)cdna第一(yi)鏈為(wei)(wei)模板,擴增引(yin)物為(wei)(wei):gme1:5’-atgggttctgctggtgagtctg-3’(seqidno.47所(suo)示(shi))gme2:5’-ttactccttaccatcagcagcac-3’(seqidno.48所(suo)示(shi))。pcr反應條(tiao)件(jian):98℃預變性3min;94℃變性30s,60℃退(tui)火30s,72℃延伸60s,30個循環;72℃保溫(wen)10min。pcr結束后,采(cai)用酚(fen):氯仿(fang)抽提(ti),再加入2倍體積的(de)無水(shui)乙醇進行沉淀。沉淀用30μl水(shui)溶解,取(qu)1μl為(wei)(wei)模板。
217位ecori限(xian)制性內(nei)切酶(mei)位突變引(yin)物:217z:gagttccatcttgtggatctcag(seqidno.49所示);217f:ctgagatccacaagatggaactc(seqidno.50所示)。
667位(wei)(wei)psti限制(zhi)性(xing)內切酶位(wei)(wei)突(tu)變引物(wu):667z:ctgaagaaaggctctcacatccac(seqidno.51所(suo)示);667f:gtggatgtgagagcctttcttcag(seqidno.52所(suo)示)。
以引物gme1和217f;217z和667f;667z和gme2進行pcr擴增(zeng),擴增(zeng)條(tiao)件(jian)為(wei)(wei):94℃預熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共25個(ge)循(xun)環,pcr結(jie)束(shu)后,dna片斷(duan)(duan)(duan)用10%丙(bing)烯酰胺膠回(hui)(hui)收(shou)(shou),將上(shang)述8個(ge)回(hui)(hui)收(shou)(shou)片斷(duan)(duan)(duan)取10-100ng為(wei)(wei)模板混(hun)合,以gme1和gme2為(wei)(wei)引物將上(shang)述片斷(duan)(duan)(duan)拼接,擴增(zeng)條(tiao)件(jian)為(wei)(wei):94℃預熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共25個(ge)循(xun)環。pcr結(jie)束(shu)后,dna柱回(hui)(hui)收(shou)(shou)pcr片斷(duan)(duan)(duan)。將片段進行ta克隆,獲得質粒t6,并將質粒t6高效轉化到大(da)腸桿菌dh5α感受態細胞(bao)中。
7、構建改造(zao)的(de)草莓gdp-l-半乳糖磷(lin)酸化酶(ggp,vtc2)基因(yin)fvvtc2。
從草(cao)莓中克隆gdp-l-半乳糖磷酸化酶(mei)(mei)基因并利用定點(dian)突(tu)變方法將258位(wei)(wei)sphi限制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)(mei)位(wei)(wei)點(dian);624位(wei)(wei)hindiii限制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)(mei)位(wei)(wei)點(dian);1070位(wei)(wei)ndei限制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)(mei)位(wei)(wei)點(dian);1236位(wei)(wei)bamhi限制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)(mei)位(wei)(wei)點(dian);1337位(wei)(wei)psti限制性(xing)(xing)(xing)內切(qie)酶(mei)(mei)位(wei)(wei)點(dian)消除。
以合成的(de)cdna第(di)一鏈為(wei)模(mo)(mo)板,擴(kuo)增引(yin)物為(wei):vtc2z:5’-atgatgctgaagatcaagcgtg-3’(seqidno.53所(suo)示);vtc2f:5’-ttactggagaaccagacactcct-3’(seqidno.54所(suo)示)。pcr反應條件:98℃預變性3min;94℃變性30s,60℃退(tui)火30s,72℃延伸90s,30個循環;72℃保溫10min。pcr結束后(hou),采用(yong)酚:氯仿(fang)抽(chou)提,再(zai)加入(ru)2倍(bei)體(ti)積(ji)的(de)無水(shui)乙醇進行沉淀。沉淀用(yong)30μl水(shui)溶解(jie),取(qu)1μl為(wei)模(mo)(mo)板。
258位sphi限制性內切酶位突變引物:258z:gcttgcagaaagggctatttc(seqidno.55所示(shi));258f:gaaatagccctttctgcaagc(seqidno.56所示(shi))。
624位hindiii限(xian)制(zhi)性內切酶(mei)位突(tu)變引(yin)物:624z:gaaaccttcttgcttgcacttc(seqidno.57所(suo)示);624f:gaagtgcaagcaagaaggtttc(seqidno.58所(suo)示)。
1070位ndei限(xian)制性內切酶位突變引物(wu):1070z:caccacatgtccactaatttc(seqidno.59所(suo)示);1070f:gaaattagtggacatgtggtg(seqidno.60所(suo)示)。
1236位(wei)kpni限(xian)制(zhi)性內切(qie)酶位(wei)突變引物(wu):1236z:gaggaaccagatgtcaatcctc(seqidno.61所示);1236f:gaggattgacatctggttcctc(seqidno.62所示)。
以(yi)引物vtc2z和258f;258z和624f;624z和1070f;1070z和1236f;1236z和vtc2f進行(xing)pcr擴(kuo)(kuo)增(zeng),擴(kuo)(kuo)增(zeng)條件(jian)為:94℃預熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共25個循(xun)環,pcr結束后,dna片(pian)(pian)斷(duan)(duan)用10%丙烯(xi)酰胺膠回(hui)收(shou)(shou),將上(shang)(shang)述8個回(hui)收(shou)(shou)片(pian)(pian)斷(duan)(duan)取10-100ng為模板混合,以(yi)vtc2z和vtc2f為引物將上(shang)(shang)述片(pian)(pian)斷(duan)(duan)拼接,擴(kuo)(kuo)增(zeng)條件(jian)為:94℃預熱1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共25個循(xun)環。pcr結束后,dna柱回(hui)收(shou)(shou)pcr片(pian)(pian)斷(duan)(duan)。將片(pian)(pian)段進行(xing)ta克隆,獲得質粒t7,并將質粒t7高效轉化到(dao)大(da)腸桿菌(jun)dh5α感受態細(xi)胞中。
8、構(gou)建改造的(de)草莓(mei)l-半乳糖-1-磷(lin)酸(suan)酶(gpp,vtc4)基因fvvtc4。
從(cong)草莓(mei)中克(ke)隆l-半(ban)乳糖-1-磷酸酶(mei)基因并利用定點突變方(fang)法將(jiang)42位psti限制性(xing)內(nei)切酶(mei)位點;161位saci限制性(xing)內(nei)切酶(mei)位點;270位bamhi限制性(xing)內(nei)切酶(mei)位點消除(chu)。
以合(he)成(cheng)的(de)cdna第(di)一鏈為模(mo)板,擴增(zeng)引物:vtc4z:atggctgaaaatgattcgcttgctctgttcttggcctctgcagt(seqidno.63所(suo)示),vtc4f:ttaggagtcctcgacaccaag(seqidno.64所(suo)示)。pcr反應(ying)條件:98℃預變(bian)性3min;94℃變(bian)性30s,60℃退火30s,72℃延伸90s,30個循環;72℃保(bao)溫(wen)10min。pcr結(jie)束后,采用酚:氯仿抽提,再加入(ru)2倍體(ti)積的(de)無水乙醇進行沉淀。沉淀用30μl水溶解(jie),取1μl為模(mo)板。
161位saci限(xian)制性內切酶位突變(bian)引(yin)物:161z:gagttcatatttaatcatctca(seqidno.65所(suo)示(shi)(shi));161f:tgagatgattaaatatgaactc(seqidno.66所(suo)示(shi)(shi))。
270位(wei)bamhi限制(zhi)性內切酶位(wei)突變引物:270z:gtggaacccctggatggcac(seqidno.67所示);270f:gtgccatccaggggttccac(seqidno.68所示)。
以(yi)引物(wu)vtc4z和(he)161f;161z和(he)270f;270z和(he)vtc4f進行(xing)pcr擴增(zeng),擴增(zeng)條件(jian)為:94℃預(yu)熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共(gong)25個(ge)循環,pcr結束后(hou),dna片(pian)斷(duan)用10%丙(bing)烯酰(xian)胺(an)膠(jiao)回(hui)收,將(jiang)上述(shu)(shu)8個(ge)回(hui)收片(pian)斷(duan)取10-100ng為模板混合(he),以(yi)vtc4z和(he)vtc4f為引物(wu)將(jiang)上述(shu)(shu)片(pian)斷(duan)拼接,擴增(zeng)條件(jian)為:94℃預(yu)熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共(gong)25個(ge)循環。
pcr結束(shu)后(hou),dna柱(zhu)回收pcr片斷。將片段進行ta克(ke)隆,獲得(de)質粒t8,并將質粒t8高效轉化到(dao)大腸(chang)桿菌dh5α感(gan)受(shou)態細胞(bao)中。
9、構建改造的草莓l-半乳(ru)糖醛酸內(nei)酯脫氫酶(galdh)基因fvgaldh。
從草莓中克(ke)隆l-半乳糖醛酸內酯(zhi)脫(tuo)氫酶基因并(bing)利用(yong)定點突變方法(fa)將(jiang)678位ndei限制性內切酶位點消除。
以合(he)成的(de)cdna第(di)一鏈為(wei)模(mo)板,擴增(zeng)引物為(wei):galdh1:5’-atgactatccactactctgtcg-3’(seqidno.69所示(shi))galdh2:5’-ttaggactgctggataccagaag-3’(seqidno.70所示(shi))。pcr反應條件(jian):98℃預變(bian)性(xing)3min;94℃變(bian)性(xing)30s,60℃退火30s,72℃延伸60s,30個循(xun)環;72℃保溫(wen)10min。pcr結(jie)束后(hou),采用(yong)酚:氯仿抽提,再加入(ru)2倍體(ti)積的(de)無水(shui)(shui)乙醇進行沉淀(dian)。沉淀(dian)用(yong)30μl水(shui)(shui)溶(rong)解,取1μl為(wei)模(mo)板。
678位(wei)xhoi限(xian)制性內(nei)切酶位(wei)突變引(yin)物:678z:ctttaggaattttcacatatgt(seqidno.71所(suo)示(shi));678f:acatatgtgaaaattcctaaag(seqidno.72所(suo)示(shi))。
以(yi)引(yin)物galdh1和678f;678z和galdh2進(jin)(jin)行pcr擴(kuo)(kuo)增(zeng),擴(kuo)(kuo)增(zeng)條件(jian)為(wei)(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共(gong)25個循(xun)環,pcr結束后(hou),dna片(pian)(pian)(pian)斷用10%丙烯(xi)酰(xian)胺膠回收,將(jiang)上述(shu)8個回收片(pian)(pian)(pian)斷取(qu)10-100ng為(wei)(wei)模板混合,以(yi)galdh1和galdh2為(wei)(wei)引(yin)物將(jiang)上述(shu)片(pian)(pian)(pian)斷拼接,擴(kuo)(kuo)增(zeng)條件(jian)為(wei)(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共(gong)25個循(xun)環。pcr結束后(hou),dna柱回收pcr片(pian)(pian)(pian)斷。將(jiang)片(pian)(pian)(pian)段進(jin)(jin)行ta克隆,獲得質粒(li)t9,并(bing)將(jiang)質粒(li)t9高效轉化到大腸桿菌dh5α感受(shou)態細胞中。
10、構(gou)建改造的草莓l-半乳(ru)糖脫氫酶(mei)(gldh)基因fvgldh。
從草莓克隆l-半乳(ru)糖脫(tuo)氫酶基因(yin)并(bing)利用定點(dian)突變方法將12和263位(wei)(wei)(wei)(wei)saci限制(zhi)(zhi)性(xing)內(nei)(nei)切(qie)(qie)酶位(wei)(wei)(wei)(wei)點(dian);340位(wei)(wei)(wei)(wei)xhoi限制(zhi)(zhi)性(xing)內(nei)(nei)切(qie)(qie)酶位(wei)(wei)(wei)(wei)點(dian);602位(wei)(wei)(wei)(wei)ecori限制(zhi)(zhi)性(xing)內(nei)(nei)切(qie)(qie)酶位(wei)(wei)(wei)(wei)點(dian);611和1625位(wei)(wei)(wei)(wei)psti限制(zhi)(zhi)性(xing)內(nei)(nei)切(qie)(qie)酶位(wei)(wei)(wei)(wei)點(dian);1320位(wei)(wei)(wei)(wei)bgii限制(zhi)(zhi)性(xing)內(nei)(nei)切(qie)(qie)酶位(wei)(wei)(wei)(wei)點(dian);1419位(wei)(wei)(wei)(wei)hindiii限制(zhi)(zhi)性(xing)內(nei)(nei)切(qie)(qie)酶位(wei)(wei)(wei)(wei)點(dian)消(xiao)除。
以(yi)合(he)成的cdna第一鏈為(wei)模板,擴(kuo)增(zeng)引物為(wei):gldhz:5’-atgcaacgagcactgactctgaag-3’(seqidno.73所(suo)示)gldhf:5’-ttagatggtgtcagaggatggga-3’(seqidno.74所(suo)示)。pcr反應(ying)條(tiao)件:98℃預變性3min;94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延伸120s,30個循環;72℃保溫10min。pcr結(jie)束后,采(cai)用(yong)酚(fen):氯仿抽提,再(zai)加入2倍體積的無(wu)水乙醇進(jin)行(xing)沉淀。沉淀用(yong)30μl水溶(rong)解,取1μl為(wei)模板。
263位(wei)saci限制性內(nei)切酶位(wei)突變引物:263z:gagttccacaccgtctctaac(seqidno.75所示);263f:gttagagacggtgtggaactc(seqidno.76所示)。
340位(wei)xhoi限制性內(nei)切(qie)酶位(wei)突變引物:340z:gagctggagaaagtggtcaag(seqidno.77所(suo)示);340f:cttgaccactttctccagctc(seqidno.78所(suo)示)。
602位(wei)ecori限(xian)制性內切酶位(wei)突變引物:602z:gaactctgcaggttggtgcacatggtac(seqidno.79所(suo)示(shi)(shi));602f:gtaccatgtgcaccaacctgcagagttc(seqidno.80所(suo)示(shi)(shi))。
1320位bglii限(xian)制性(xing)內(nei)切酶位突變引物:1320z:agttctaaaacagctaatag(seqidno.81所示(shi));1320f:ctattagctgttttagaact(seqidno.82所示(shi))。
1419位(wei)bglii限制性內切(qie)酶位(wei)突變引物(wu):1419z:aaggttaaaggaggatgatata(seqidno.83所示);1419f:tatatcatcctcctttaacctt(seqidno.84所示)。
1625位(wei)psti限制性內切酶位(wei)突變引物(wu):1625z:caaagaacagcttaccactctgaag(seqidno.85所示(shi));1625f:cttcagagtggtaagctgttctttg(seqidno.86所示(shi))。
以引(yin)物(wu)gldhz和(he)(he)263f;263z和(he)(he)340f;340z和(he)(he)602f;602z和(he)(he)1320f;1320z和(he)(he)1419f;1419z和(he)(he)1625f;1625z和(he)(he)gldhf進行pcr擴增(zeng),擴增(zeng)條件(jian)為(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共(gong)25個循環,pcr結束(shu)(shu)后,dna片(pian)斷(duan)用(yong)10%丙烯(xi)酰胺膠回(hui)(hui)收,將(jiang)上述8個回(hui)(hui)收片(pian)斷(duan)取10-100ng為(wei)模(mo)板混合,以gldhz和(he)(he)gldhf為(wei)引(yin)物(wu)將(jiang)上述片(pian)斷(duan)拼接,擴增(zeng)條件(jian)為(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共(gong)25個循環。pcr結束(shu)(shu)后,dna柱回(hui)(hui)收pcr片(pian)斷(duan)。將(jiang)片(pian)段進行ta克(ke)隆,獲得質粒(li)t10,并將(jiang)質粒(li)t10高效轉化到大腸桿菌dh5α感受態細胞中。
11、構建改造的草(cao)莓脫氫抗壞(huai)血酸(suan)還原酶(dhar)基因fvdhar。
從草(cao)莓中克隆脫氫抗壞血酸還原酶基因并利用定(ding)點突變方法將33位(wei)(wei)psti限(xian)制性(xing)內切酶位(wei)(wei)點;339位(wei)(wei)bamhi限(xian)制性(xing)內切酶位(wei)(wei)點;453和521位(wei)(wei)hindiii限(xian)制性(xing)內切酶位(wei)(wei)點消(xiao)除。
以合成的cdna第一(yi)鏈為(wei)模板,擴增引物(wu)為(wei):dharz:5’-atggctcttgaggttgctgccaaggctgctggag-3’(seqidno.87所(suo)示(shi))dharf:5’-ttacttaggattgaccttaggttc-3’(seqidno.88所(suo)示(shi))。pcr反應(ying)條件(jian):98℃預變(bian)(bian)性(xing)3min;94℃變(bian)(bian)性(xing)30s,60℃退(tui)火30s,72℃延伸60s,30個循環(huan);72℃保溫(wen)10min。pcr結束后,采用酚(fen):氯仿抽提,再加入2倍體(ti)積的無水(shui)乙(yi)醇進行(xing)沉(chen)(chen)淀。沉(chen)(chen)淀用30μl水(shui)溶解,取1μl為(wei)模板。
339位bamhi限制性內切酶位突變引物:339z:gacattcctcaagagcaaggaacc(seqidno.89所(suo)示(shi));339f:ggttccttgctcttgaggaatgtc(seqidno.90所(suo)示(shi))。
453位hindiii限制(zhi)性內切酶位突(tu)變引物:453z:gtcactgctgctgatctaaccttg(seqidno.91所示);453f:caaggttagatcagcagcagtgac(seqidno.92所示)。
521位hindiii限制性內切酶位突變引物:521z:ctaaaggtttgacccattaccat(seqidno.93所(suo)示(shi));521f:atggtaatgggtcaaacctttag(seqidno.94所(suo)示(shi))。
以引物dharz和(he)(he)339f;339z和(he)(he)453f;453z和(he)(he)521f;521z和(he)(he)dharf進(jin)行pcr擴(kuo)(kuo)增,擴(kuo)(kuo)增條件為(wei)(wei)(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,1min。共25個循環(huan),pcr結束(shu)后,dna片(pian)斷用10%丙烯酰胺膠回(hui)(hui)收(shou)(shou),將(jiang)上(shang)述8個回(hui)(hui)收(shou)(shou)片(pian)斷取10-100ng為(wei)(wei)(wei)模(mo)板混合,以dharz和(he)(he)dharf為(wei)(wei)(wei)引物將(jiang)上(shang)述片(pian)斷拼接,擴(kuo)(kuo)增條件為(wei)(wei)(wei):94℃預熱(re)1min;94℃,30s,60℃,30s,72℃,2min。共25個循環(huan)。pcr結束(shu)后,dna柱回(hui)(hui)收(shou)(shou)pcr片(pian)斷。將(jiang)片(pian)段進(jin)行ta克隆,獲得質粒t11,并(bing)將(jiang)質粒t11高效轉化(hua)到大腸桿(gan)菌dh5α感(gan)受(shou)態細胞中。
實施例1,構建葡萄糖合成(cheng)維生素c原核(he)表達載體(ti)。
將上(shang)述11個改造的維(wei)生(sheng)素c合成基(ji)(ji)因(yin)(yin)全部使(shi)用t7啟(qi)動(dong)子和終止(zhi)子控制,構(gou)(gou)(gou)建基(ji)(ji)因(yin)(yin)表(biao)達(da)元件。首(shou)先,我們利(li)用“重疊延伸pcr技術”構(gou)(gou)(gou)建維(wei)生(sheng)素c合成所有11個基(ji)(ji)因(yin)(yin)的表(biao)達(da)盒(he)。啟(qi)動(dong)子、基(ji)(ji)因(yin)(yin)和終止(zhi)子之間不含限(xian)制性(xing)內(nei)切(qie)酶位點。構(gou)(gou)(gou)建的大腸(chang)桿菌表(biao)達(da)單元為:t7fvhxk1s、t7fvpgis、t7fvpmis、t7fvpmms、t7fvvtc1s、t7fvgmes、t7fvvtc2s、t7fvvtc4s、t7fvgaldhs、t7fvgldhs、t7fvdhars。
t7啟動子序(xu)列(lie)為:gaattcctcgagcgatcccgcgaaattaatacgactcactataggggaattgtgagcggataacaattcccctctagaaataattttgtttaactttaagaaggagatatacc(seqidno.95所(suo)示(shi))。
t7終止子序列為(wei):ctagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttggtcgacggtgacgttgagcatggtaagctt(seqidno.96所示(shi))。
構(gou)建的表達單元(yuan)在puc18載(zai)體上兩(liang)兩(liang)拼接,完(wan)成(cheng)(cheng)后消除內(nei)在的酶切位點,然后依次插入(ru)載(zai)體pcambia-1301,最(zui)終(zhong)構(gou)建成(cheng)(cheng)大腸桿菌維生素c合成(cheng)(cheng)載(zai)體pyb2130。
實施例(li)2,葡萄(tao)糖合成維生素c原核(he)表達載體(ti)pyb2130大腸桿菌轉化
1)大腸桿菌感受態細胞制備。
大腸桿菌(jun)(jun)(jun)菌(jun)(jun)(jun)株為bl21(de3),或bl21-ai等(deng)含有t7rna聚合酶的(de)菌(jun)(jun)(jun)株。挑取單菌(jun)(jun)(jun)在(zai)25mllb培養(yang)(yang)(yang)基37℃培養(yang)(yang)(yang)過夜(ye),取5ml菌(jun)(jun)(jun)液轉(zhuan)接(jie)到(dao)100mllb培養(yang)(yang)(yang)基,培養(yang)(yang)(yang)至(zhi)od600=0.7-0.8,菌(jun)(jun)(jun)液冰上放置10分(fen)鐘(zhong),5000rpm離(li)心10min,4℃,收集菌(jun)(jun)(jun)體,加入100ml無菌(jun)(jun)(jun)雙蒸(zheng)水清洗(xi)兩次。加入4ml10%甘油懸浮菌(jun)(jun)(jun)體,轉(zhuan)到(dao)50ml離(li)心管。5500rpm離(li)心10min,4℃。收集菌(jun)(jun)(jun)體,加入500μl10%甘油懸浮菌(jun)(jun)(jun)體,轉(zhuan)到(dao)1.5ml離(li)心管。
2)維(wei)生素c原核表達載體yb2130經電擊法導人(ren)大腸(chang)桿菌中。
取(qu)70μl農(nong)桿菌感受態細(xi)胞(bao),加入1μl表達載體pyb2130。混勻(yun),轉到(dao)0.1cm電(dian)擊(ji)杯中。電(dian)擊(ji)參數:200ω,1.7kv,2.5f,電(dian)擊(ji)后立即加入800μlsoc培(pei)養(yang)(yang)(yang)液。培(pei)養(yang)(yang)(yang)1小時(shi)后,取(qu)100μl涂50μg/l卡(ka)那霉素抗性板篩選轉化子,37℃培(pei)養(yang)(yang)(yang)。篩選生長良好的菌落(luo)培(pei)養(yang)(yang)(yang)后-70℃甘油(you)管凍存。
3)驗證大腸桿菌利用葡萄糖(tang)合成維生(sheng)素c。
將(jiang)在-70℃甘油管凍存的(de)工程菌接(jie)種(zhong)(zhong)于裝有所需培(pei)養基的(de)小試(shi)管中,接(jie)種(zhong)(zhong)含卡那(nei)霉素(su)(kmp,30mg/l)的(de)3mllb試(shi)管,在30℃培(pei)養過(guo)夜,過(guo)夜菌再(zai)以2%接(jie)種(zhong)(zhong)50ml含抗生(sheng)素(su)的(de)lb搖(yao)瓶,在30℃培(pei)養2-6h后,加入iptg或iptg+0.2%阿(a)拉伯糖誘(you)導培(pei)養24-72小時,轉速(su)均為200r/min。加入葡萄糖終(zhong)濃度10mg/ml。測定發酵終(zhong)止液(ye)的(de)菌體光密(mi)度值和維生(sheng)素(su)c的(de)含量。
4)維生素c含量hplc檢測。
取10ml發(fa)酵(jiao)菌液,離心收(shou)集菌體(ti),液氮研磨,加0.1%草酸1ml,冰浴1小時,超聲(sheng)處理5min。10000rpm離心10min,取上(shang)清,過(guo)0.45μm濾膜。發(fa)酵(jiao)上(shang)清樣(yang)品用等(deng)體(ti)積0.2%草酸稀釋,過(guo)0.45μm濾膜。
高效液(ye)相(xiang)(hplc)條件:色譜柱(zhu)(zhu):symmetryshieldrp18柱(zhu)(zhu)(5μm,150x4.6mm)。流動相(xiang)為甲醇(chun):0.1%草酸=5:95,檢測波長245nm,柱(zhu)(zhu)溫(wen)為30℃,流速(su)1.0ml/min,外標法(fa)定量。樣(yang)品每次(ci)進(jin)樣(yang)10μl,將與標品相(xiang)同(tong)保留時間處(chu)的(de)峰的(de)峰面積代入(ru)標準曲線方程,計算樣(yang)品中(zhong)維生素c的(de)含量。
色譜圖(tu)結果表明:大腸桿菌誘導培養3天后(hou),可以檢測到維生素c,維生素c的含量(liang)為(wei)0.5-1μg/ml。
序列表
<110>上海市農業(ye)科學院
<120>一種利(li)用植(zhi)物維生素c合(he)成途徑構建生產維生素c大腸(chang)桿菌(jun)菌(jun)株的方法
<130>2017
<160>96
<170>patentinversion3.3
<210>1
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>1
atggggaaggtggcggtgggt21
<210>2
<211>21
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>2
ttaggagtcctcgacaccaag21
<210>3
<211>20
<212>dna
<213>人工序列
<400>3
gagattgaaaagcttgagga20
<210>4
<211>20
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>4
tcctcaagcttttcaatctc20
<210>5
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>5
agcaagcctaagatgctcatcag23
<210>6
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>6
ctgatgagcatcttaggcttgct23
<210>7
<211>22
<212>dna
<213>人(ren)工序列
<400>7
cagagttcaccaaatcagtgga22
<210>8
<211>22
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>8
tccactgatttggtgaactctg22
<210>9
<211>60
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>9
aggtaacacaatccgcatgt20
<210>10
<211>20
<212>dna
<213>人工序列
<400>10
acatgcggattgtgttacct20
<210>11
<211>22
<212>dna
<213>人工(gong)序列(lie)
<400>11
agaactttgagaagattatttc22
<210>12
<211>22
<212>dna
<213>人工序列
<400>12
gaaataatcttctcaaagttct22
<210>13
<211>20
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>13
gaaggatatcttagagacct20
<210>14
<211>20
<212>dna
<213>人工序列
<400>14
aggtctctaagatatccttc20
<210>15
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>15
ctgggattctgggagtcctta21
<210>16
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>16
taaggactcccagaatcccag21
<210>17
<211>26
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>17
atggcatctatctctggtatctgttc26
<210>18
<211>25
<212>dna
<213>人(ren)工序(xu)列
<400>18
taggagtacagtgcatcgacgttgc25
<210>19
<211>32
<212>dna
<213>人工序列
<400>19
tcttgactggctgtaccagcacaaggagttcg32
<210>20
<211>32
<212>dna
<213>人工序列
<400>20
cgaactccttgtgctggtacagccagtcaaga32
<210>21
<211>23
<212>dna
<213>人工(gong)序列(lie)
<400>21
ggaaccaaggatatggttgttct23
<210>22
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>22
agaacaaccatatccttggttcc23
<210>23
<211>20
<212>dna
<213>人工序列
<400>23
ggagcacggatcagcttgca20
<210>24
<211>20
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>24
tgcaagctgatccgtgctcc20
<210>25
<211>21
<212>dna
<213>人工序(xu)列
<400>25
gaagaagtaacacctagaact21
<210>26
<211>21
<212>dna
<213>人工序(xu)列
<400>26
agttctaggtgttacttcttc21
<210>27
<211>26
<212>dna
<213>人(ren)工序列
<400>27
atggagaagtccatgatcgagaagtc26
<210>28
<211>26
<212>dna
<213>人工(gong)序(xu)列
<400>28
ttatggcagctggaagaacatggagt26
<210>29
<211>18
<212>dna
<213>人工序列
<400>29
ctcaactatgtcaaggtt18
<210>30
<211>18
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>30
aaccttgacatagttgag18
<210>31
<211>76
<212>dna
<213>人工序列
<400>31
ggttcctcccaccttttgacgagtttgaggtcgatcggtgccatcttccccagggagaat60
cagtggaatttcctgaag78
<210>32
<211>78
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>32
cttcaggaaattccactgattctccctggggaagatggcaccgatcgacctcaaactcgt60
caaaaggtgggaggaacc78
<210>33
<211>18
<212>dna
<213>人工序列
<400>33
cttttcgtgcctgaaggt18
<210>34
<211>18
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>34
accttcaggcacgaaaag18
<210>35
<211>25
<212>dna
<213>人工序列
<400>35
atggctgtcatgaagcctggtgtc25
<210>36
<211>27
<212>dna
<213>人工序列
<400>36
ttaggaagagaagaacagagccttaac27
<210>37
<211>22
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>37
cagtgggcattgttggaggaac22
<210>38
<211>22
<212>dna
<213>人(ren)工序列
<400>38
ggttcctccaacaatgcccactg22
<210>39
<211>23
<212>dna
<213>人工序(xu)列
<400>39
gatatgctttgatgtttttcctc23
<210>40
<211>37
<212>dna
<213>人工(gong)序(xu)列
<400>40
gaggaaaaacatcaaagcatatc23
<210>41
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>41
atgaaggcactgattctggtcgg23
<210>42
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>42
ttacatgacgatctcaggcttct23
<210>43
<211>20
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>43
tggattccataaatcccatg20
<210>44
<211>20
<212>dna
<213>人(ren)工序列
<400>44
catgggatttatggaatcca20
<210>45
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>45
tcggatcaagaagcttgcttg21
<210>46
<211>21
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>46
caagcaagcttcttgatccga21
<210>47
<211>22
<212>dna
<213>人工序列
<400>47
atgggttctgctggtgagtctg22
<210>48
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>48
ttactccttaccatcagcagcac23
<210>49
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>49
gagttccatcttgtggatctcag23
<210>50
<211>23
<212>dna
<213>人(ren)工序列
<400>50
ctgagatccacaagatggaactc23
<210>51
<211>24
<212>dna
<213>人工序列
<400>51
ctgaagaaaggctctcacatccac24
<210>52
<211>24
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>52
gtggatgtgagagcctttcttcag24
<210>53
<211>22
<212>dna
<213>人工序列
<400>53
atgatgctgaagatcaagcgtg22
<210>54
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>54
ttactggagaaccagacactcct23
<210>55
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>55
gcttgcagaaagggctatttc21
<210>56
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>56
gaaatagccctttctgcaagc21
<210>57
<211>22
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>57
gaaaccttcttgcttgcacttc22
<210>58
<211>22
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>58
gaagtgcaagcaagaaggtttc22
<210>59
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>59
caccacatgtccactaatttc21
<210>60
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>60
gaaattagtggacatgtggtg21
<210>61
<211>22
<212>dna
<213>人工序列
<400>61
gaggaaccagatgtcaatcctc22
<210>62
<211>22
<212>dna
<213>人工(gong)序(xu)列
<400>62
gaggattgacatctggttcctc22
<210>63
<211>44
<212>dna
<213>人工序列
<400>63
atggctgaaaatgattcgcttgctctgttcttggcctctgcagt44
<210>64
<211>21
<212>dna
<213>人(ren)工序列
<400>64
ttaggagtcctcgacaccaag21
<210>65
<211>22
<212>dna
<213>人工序列
<400>65
gagttcatatttaatcatctca22
<210>66
<211>22
<212>dna
<213>人工序列
<400>66
tgagatgattaaatatgaactc22
<210>67
<211>20
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>67
gtggaacccctggatggcac20
<210>68
<211>20
<212>dna
<213>人工序列
<400>68
gtgccatccaggggttccac20
<210>69
<211>22
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>69
atgactatccactactctgtcg22
<210>70
<211>23
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>70
ttaggactgctggataccagaag23
<210>71
<211>22
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>71
ctttaggaattttcacatatgt22
<210>72
<211>22
<212>dna
<213>人(ren)工序列(lie)
<400>72
acatatgtgaaaattcctaaag22
<210>73
<211>24
<212>dna
<213>人工(gong)序(xu)列
<400>73
atgcaacgagcactgactctgaag24
<210>74
<211>23
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>74
ttagatggtgtcagaggatggga23
<210>75
<211>21
<212>dna
<213>人工序列(lie)
<400>75
gagttccacaccgtctctaac21
<210>76
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>76
gttagagacggtgtggaactc21
<210>77
<211>21
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>77
gagctggagaaagtggtcaag21
<210>78
<211>21
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>78
cttgaccactttctccagctc21
<210>79
<211>28
<212>dna
<213>人工序列
<400>79
gaactctgcaggttggtgcacatggtac28
<210>80
<211>28
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>80
gtaccatgtgcaccaacctgcagagttc28
<210>81
<211>20
<212>dna
<213>人工序列
<400>81
agttctaaaacagctaatag20
<210>82
<211>20
<212>dna
<213>人工(gong)序列
<400>82
ctattagctgttttagaact20
<210>83
<211>22
<212>dna
<213>人工序列
<400>83
aaggttaaaggaggatgatata22
<210>84
<211>22
<212>dna
<213>人工序(xu)列
<400>84
tatatcatcctcctttaacctt22
<210>85
<211>25
<212>dna
<213>人工序(xu)列
<400>85
caaagaacagcttaccactctgaag25
<210>86
<211>25
<212>dna
<213>人(ren)工序列
<400>86
cttcagagtggtaagctgttctttg25
<210>87
<211>34
<212>dna
<213>人工序(xu)列(lie)
<400>87
atggctcttgaggttgctgccaaggctgctggag34
<210>88
<211>24
<212>dna
<213>人工序(xu)列
<400>88
ttacttaggattgaccttaggttc24
<210>89
<211>24
<212>dna
<213>人工序列
<400>89
gacattcctcaagagcaaggaacc24
<210>90
<211>24
<212>dna
<213>人工序(xu)列(lie)
<400>90
ggttccttgctcttgaggaatgtc24
<210>91
<211>24
<212>dna
<213>人工序列
<400>91
gtcactgctgctgatctaaccttg24
<210>92
<211>24
<212>dna
<213>人工序列
<400>92
caaggttagatcagcagcagtgac24
<210>93
<211>23
<212>dna
<213>人(ren)工序(xu)列
<400>93
ctaaaggtttgacccattaccat23
<210>94
<211>23
<212>dna
<213>人工序列
<400>94
atggtaatgggtcaaacctttag23
<210>95
<211>113
<212>dna
<213>人工序(xu)列
<400>95
gaattcctcgagcgatcccgcgaaattaatacgactcactataggggaattgtgagcgga60
taacaattcccctctagaaataattttgtttaactttaagaaggagatatacc113
<210>24
<211>78
<212>dna
<213>人工序列
<400>96
ctagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttggtcgacggtgac60
gttgagcatggtaagctt78