本發明屬于(yu)分子生物學領域,涉(she)及一種糖肽類抗生素耐藥基(ji)(ji)因檢測(ce)的并聯(lian)探針、基(ji)(ji)因芯(xin)片、試劑盒與檢測(ce)方法。
背景技術:
在過去的(de)(de)幾(ji)(ji)十年(nian),抗(kang)生(sheng)素(su)(su)(su)廣(guang)(guang)泛用于各種(zhong)感(gan)(gan)染性(xing)疾病的(de)(de)治(zhi)療,但也(ye)正是(shi)由(you)于抗(kang)生(sheng)素(su)(su)(su)的(de)(de)廣(guang)(guang)泛使用,導(dao)致新的(de)(de)抗(kang)生(sheng)素(su)(su)(su)耐(nai)藥形式不斷出現(xian)。糞(fen)腸(chang)球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)、結核(he)分枝桿(gan)菌(jun)(jun)(jun)、銅(tong)綠假單胞菌(jun)(jun)(jun)對(dui)(dui)臨床(chuang)上(shang)使用的(de)(de)100多種(zhong)抗(kang)生(sheng)素(su)(su)(su)具(ju)有耐(nai)藥性(xing),成為目前威脅人類(lei)(lei)生(sheng)命的(de)(de)重要(yao)(yao)的(de)(de)細菌(jun)(jun)(jun)殺手(shou)。糖肽(tai)類(lei)(lei)抗(kang)生(sheng)素(su)(su)(su)(G1ycopeptides,Dalbahepides)即(ji)D-丙氨酰-D-丙氨酸(suan)結合性(xing)并(bing)具(ju)有七(qi)肽(tai)結構的(de)(de)一類(lei)(lei)抗(kang)生(sheng)素(su)(su)(su),對(dui)(dui)包(bao)(bao)括(kuo)主要(yao)(yao)病原菌(jun)(jun)(jun)如凝固酶陽性(xing)或陰性(xing)葡(pu)萄球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)、各組鏈球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)、腸(chang)球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)(包(bao)(bao)括(kuo)糞(fen)腸(chang)球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)和屎腸(chang)球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun))、棒桿(gan)菌(jun)(jun)(jun)、厭氧球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)和單核(he)細胞增生(sheng)利斯特(te)氏(shi)菌(jun)(jun)(jun)在內(nei)的(de)(de)幾(ji)(ji)乎所有的(de)(de)革(ge)蘭氏(shi)陽性(xing)菌(jun)(jun)(jun)都具(ju)有活(huo)性(xing),在臨床(chuang)上(shang)常用于由(you)革(ge)蘭氏(shi)陽性(xing)菌(jun)(jun)(jun)尤其是(shi)葡(pu)萄球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)、腸(chang)球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)和肺炎(yan)鏈球(qiu)(qiu)(qiu)菌(jun)(jun)(jun)所致嚴(yan)重感(gan)(gan)染性(xing)疾病的(de)(de)治(zhi)療,代(dai)表著(zhu)治(zhi)療這些嚴(yan)重感(gan)(gan)染性(xing)疾病的(de)(de)最后(hou)防(fang)線。
自1988年報道糖肽(tai)(tai)類(lei)抗(kang)菌(jun)(jun)(jun)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)物耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)的(de)(de)(de)(de)(de)腸(chang)球菌(jun)(jun)(jun)以來,在(zai)全球范圍內的(de)(de)(de)(de)(de)醫院(yuan)中(zhong)(zhong)常出現。現已(yi)發(fa)(fa)現主要耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)基因(yin)(yin)(yin)VanA、VanB、VanC、VanH、VanR、VanS和VanX 7個基因(yin)(yin)(yin)型(xing)。糖肽(tai)(tai)類(lei)抗(kang)生素(su)耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)基因(yin)(yin)(yin)可(ke)由轉(zhuan)(zhuan)座(zuo)子、質粒攜帶,通過細(xi)菌(jun)(jun)(jun)間的(de)(de)(de)(de)(de)接合作用來傳遞(di)(di),使腸(chang)球菌(jun)(jun)(jun)中(zhong)(zhong)糖肽(tai)(tai)耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)率不斷增加,而且(qie)許多萬(wan)(wan)古霉素(su)耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)性(xing)腸(chang)球菌(jun)(jun)(jun)還對(dui)其(qi)它(ta)抗(kang)生素(su)(如(ru)β-內酰胺類(lei)和氨(an)基糖苷類(lei)抗(kang)生素(su))耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao),給(gei)(gei)萬(wan)(wan)古霉素(su)耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)性(xing)腸(chang)球菌(jun)(jun)(jun)感染的(de)(de)(de)(de)(de)臨(lin)(lin)(lin)床治療(liao)造(zao)成很大的(de)(de)(de)(de)(de)困難(nan)。另一方面,已(yi)發(fa)(fa)現一些甲氧西林耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)性(xing)金(jin)黃色葡(pu)萄球菌(jun)(jun)(jun)臨(lin)(lin)(lin)床分(fen)離株(zhu)對(dui)萬(wan)(wan)古霉素(su)和替考拉寧的(de)(de)(de)(de)(de)敏感性(xing)減(jian)弱,在(zai)牛(niu)鏈球菌(jun)(jun)(jun)臨(lin)(lin)(lin)床分(fen)離株(zhu)中(zhong)(zhong)發(fa)(fa)現了可(ke)轉(zhuan)(zhuan)移性(xing)vanB耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)決(jue)定(ding)子,在(zai)環狀芽孢桿(gan)菌(jun)(jun)(jun)臨(lin)(lin)(lin)床分(fen)離株(zhu)中(zhong)(zhong)發(fa)(fa)現存在(zai)vanA基因(yin)(yin)(yin)簇,說明糖肽(tai)(tai)耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)基因(yin)(yin)(yin)不僅在(zai)腸(chang)球菌(jun)(jun)(jun)間傳播,而且(qie)可(ke)傳遞(di)(di)至腸(chang)球菌(jun)(jun)(jun)外的(de)(de)(de)(de)(de)其(qi)它(ta)細(xi)菌(jun)(jun)(jun),給(gei)(gei)未來的(de)(de)(de)(de)(de)抗(kang)感染治療(liao)帶來了極大的(de)(de)(de)(de)(de)威脅,對(dui)研制和開發(fa)(fa)高效準(zhun)確(que)的(de)(de)(de)(de)(de)糖肽(tai)(tai)耐(nai)(nai)(nai)藥(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)(yao)基因(yin)(yin)(yin)的(de)(de)(de)(de)(de)檢(jian)測(ce)在(zai)臨(lin)(lin)(lin)床輔助(zhu)治療(liao)具(ju)有(you)重要的(de)(de)(de)(de)(de)意義。
生物(wu)芯片(pian)技(ji)術是(shi)九十年代(dai)發展起來的(de)一項新興生物(wu)技(ji)術。按照檢(jian)(jian)測(ce)(ce)對象來分類,可以分為基因(yin)芯片(pian)和(he)蛋白(bai)質芯片(pian)等兩大(da)類。與蛋白(bai)質芯片(pian)相比,基因(yin)芯片(pian)利(li)用(yong)的(de)是(shi)核苷(gan)酸鏈之間的(de)互補作用(yong),特異性強,性好。本發明所提供(gong)的(de)糖肽(tai)類抗生素耐藥基因(yin)芯片(pian)與傳統的(de)細菌藥敏(min)性檢(jian)(jian)測(ce)(ce)方(fang)法(fa)相比,直接(jie)針對病原(yuan)體糖肽(tai)類抗生素耐藥基因(yin)進行檢(jian)(jian)測(ce)(ce),其檢(jian)(jian)測(ce)(ce)通量(liang)大(da)、所需樣(yang)本量(liang)少(shao)、靈(ling)敏(min)度高(gao)(gao)、準(zhun)確性高(gao)(gao)和(he)特異性好等優(you)勢。
技術實現要素:
本發明目的(de)是(shi)提供一種特(te)異性好、結果準確、假陽性率低(di)、檢(jian)(jian)測效率高的(de)糖肽(tai)類抗生素(su)耐藥(yao)基(ji)因檢(jian)(jian)測的(de)并聯探針、基(ji)因芯片(pian)、試劑盒(he)與檢(jian)(jian)測方(fang)法。
本發明(ming)實(shi)現其目的技(ji)術方(fang)案為:
一種糖(tang)肽類抗生素耐藥基(ji)因檢測并聯探(tan)針,包括探(tan)針1~23,其(qi)對應的序列如SEQ ID NO.1~23所示(shi)。
一種糖(tang)肽類抗生(sheng)素(su)耐藥基因(yin)檢(jian)測(ce)芯片,包括(kuo)固體相和權利要求1所述的探(tan)針組。
作為優選地(di),所(suo)述固(gu)相載(zai)體為氨基(ji)修飾(shi)的(de)玻璃(li)基(ji)片、尼(ni)龍膜或硝酸(suan)纖維素(su)膜。
一種(zhong)糖肽類抗生素耐藥(yao)基(ji)因(yin)檢測試劑盒,包(bao)括前述的(de)基(ji)因(yin)芯片。
在上述(shu)糖肽(tai)類(lei)抗生素(su)耐藥(yao)基因檢(jian)測試劑盒中(zhong),還(huan)包括糖肽(tai)類(lei)抗生素(su)耐藥(yao)靶(ba)基因擴增引物(wu)對,引物(wu)序列(lie)如(ru)SEQ ID NO.24~39所(suo)示。
作為優選(xuan)地(di),所述引物(wu)對的下游引物(wu)的5’端含有CY3熒(ying)光染料標記。
作為優選地,上述(shu)糖肽(tai)類抗生素(su)耐藥基因(yin)檢測(ce)試劑盒,還包(bao)括PCR反應體(ti)系、雜交緩沖液、洗滌(di)液。
在上述技術方案中,20 μL 的(de)PCR反應體系包括(kuo):50~150 ng/μL的(de)擴增(zeng)模板(ban) 2 μL,Premix Taq 10 μL,濃度為8~12 μM的(de)上、下游引物各1 μL,雙蒸水6 μL。
一種糖(tang)(tang)肽(tai)(tai)類(lei)抗生素(su)耐藥基(ji)因檢(jian)測(ce)方法(fa),使(shi)用前述的(de)(de)糖(tang)(tang)肽(tai)(tai)類(lei)抗生素(su)耐藥基(ji)因檢(jian)測(ce)試劑(ji)盒進行檢(jian)測(ce),當(dang)檢(jian)測(ce)對象的(de)(de)三個探(tan)針顯示的(de)(de)檢(jian)測(ce)結(jie)果一致時(shi)可以判斷樣品是否感染(ran)糖(tang)(tang)肽(tai)(tai)類(lei)抗生素(su)耐藥基(ji)因;當(dang)檢(jian)測(ce)對象的(de)(de)三個探(tan)針顯示的(de)(de)檢(jian)測(ce)結(jie)果不一致時(shi),不能判斷該(gai)待(dai)測(ce)樣品為陽性(xing)或(huo)陰性(xing),建議使(shi)用該(gai)檢(jian)測(ce)試劑(ji)盒重新檢(jian)測(ce)或(huo)者使(shi)用現(xian)有其它檢(jian)測(ce)方法(fa)進一步驗證。
作(zuo)為(wei)優選地,PCR擴(kuo)增(zeng)反應程序為(wei)95℃ 5 min;95℃10 s、55℃ 30 s、72℃30 s、30個循環;72℃ 10 min。
本發明的(de)(de)(de)有(you)益效果(guo)是(shi):每個耐藥(yao)(yao)基(ji)因(yin)設(she)計3條(tiao)高(gao)特(te)(te)異性(xing)(xing)的(de)(de)(de)探(tan)針,當(dang)3條(tiao)探(tan)針的(de)(de)(de)檢測(ce)結(jie)果(guo)均為陽(yang)性(xing)(xing)時(shi)才判斷該項指標為陽(yang)性(xing)(xing),能極大的(de)(de)(de)提高(gao)產(chan)品的(de)(de)(de)準(zhun)確性(xing)(xing)和精確性(xing)(xing),減少其它方(fang)法容易(yi)出(chu)現的(de)(de)(de)假(jia)陽(yang)性(xing)(xing)問題(ti);本發明通(tong)過(guo)(guo)PCR技術對病原(yuan)體(ti)糖肽類抗生(sheng)(sheng)素耐藥(yao)(yao)基(ji)因(yin)組進行擴(kuo)增(zeng),檢測(ce)的(de)(de)(de)特(te)(te)異性(xing)(xing)高(gao),擴(kuo)增(zeng)產(chan)物與(yu)生(sheng)(sheng)物芯片上的(de)(de)(de)寡核苷(gan)酸探(tan)針進行雜交,通(tong)過(guo)(guo)CY3標記的(de)(de)(de)PCR反向擴(kuo)增(zeng)引(yin)物檢測(ce)雜交結(jie)果(guo)。操作(zuo)簡單(dan)、結(jie)果(guo)易(yi)讀,滿(man)足醫療(liao)等現場(chang)檢測(ce)需求(qiu),為臨床(chuang)醫生(sheng)(sheng)快速診斷患者是(shi)否被感染糖肽類抗生(sheng)(sheng)素耐藥(yao)(yao)基(ji)因(yin)提供(gong)了便(bian)捷、快速和準(zhun)確的(de)(de)(de)理論依據,具有(you)廣闊的(de)(de)(de)臨床(chuang)應用市場(chang)潛(qian)力。
附圖說明
圖(tu) 1 檢測糖肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥基(ji)因的基(ji)因芯片(pian)示意圖(tu)。
圖(tu)2待測樣品糖肽類抗生素(su)耐藥基因擴增后PCR產(chan)物電(dian)泳條帶(dai)圖(tu);Marker DL2000 (TAKARA)。
具體實施方式
下(xia)(xia)面將結合附圖(tu),對本(ben)發明(ming)的(de)優(you)選實(shi)(shi)施例進(jin)行(xing)詳細的(de)描(miao)述(shu)。實(shi)(shi)施例中未注明(ming)具體條(tiao)件的(de)實(shi)(shi)驗方法,通常按(an)照常規條(tiao)件,例如分(fen)子克(ke)隆(long)實(shi)(shi)驗指南(nan)(第三版,J. 薩姆布魯克(ke)等著)中所述(shu)的(de)條(tiao)件,或按(an)照制(zhi)造廠商所建(jian)議的(de)條(tiao)件。以下(xia)(xia)實(shi)(shi)施例用(yong)于說明(ming)本(ben)發明(ming),但不用(yong)于限(xian)制(zhi)本(ben)發明(ming)的(de)范圍。
實施例1目的片段引物與探針設計
查找NCBI數據庫中(zhong)糖肽類抗(kang)生素(su)耐藥(yao)基因(yin)(yin)的(de)基因(yin)(yin)序(xu)列VanA、VanB、VanC、VanH、VanR、VanS和(he)VanX,使(shi)用芯片探(tan)針設計(ji)軟件(ArrayDesigner4.2)針對(dui)(dui)每(mei)個耐藥(yao)基因(yin)(yin)設計(ji)3條探(tan)針,另設計(ji)16sRNA基因(yin)(yin)的(de)探(tan)針作(zuo)為(wei)陽性質控(kong)探(tan)針(PC)與隨機合成一段探(tan)針作(zuo)為(wei)陰(yin)性質控(kong)探(tan)針(NC),對(dui)(dui)應探(tan)針序(xu)列如SEQ ID NO .1~23所示。
使(shi)用(yong)NCBI在(zai)(zai)線設計軟(ruan)件(Primer-BLAST)設計VanA、VanB、VanC、VanH、VanR、VanS和VanX基(ji)(ji)因(yin)的PCR擴增引(yin)物,同時設計16sRNA基(ji)(ji)因(yin)的擴增引(yin)物。為了(le)使(shi)芯片(pian)結(jie)果(guo)更為直觀,在(zai)(zai)反向(xiang)擴增引(yin)物(R)5’端用(yong)CY3熒光染(ran)料(liao)進行標(biao)記,對(dui)應(ying)的引(yin)物序列如SEQ ID NO .24~39所示(shi)。
實施例2 芯片的(de)制備(bei)
將實施(shi)例1中的(de)并(bing)聯(lian)探針按照表1的(de)順序點(dian)樣到氨基修飾的(de)玻璃基片上(shang),得(de)到含有探針的(de)基因芯片(如圖(tu)1所(suo)示)。探針濃度為30 μM,每個(ge)點(dian)0.2 μL,然(ran)后80℃孵育1.5 h。
實施例3 檢測方法
1、待(dai)測樣品基因組提取
使用細菌基因組(zu)DNA提取(qu)試劑盒(he),按照操作(zuo)說明(ming)書(shu)的(de)步驟提取(qu)待測樣品的(de)基因組(zu)作(zuo)為擴增(zeng)模板(ban)。
2、PCR擴(kuo)增目的片段
經過(guo)大量實驗摸索,確定Van檢測的靶基因PCR擴增(zeng)(zeng)體系(xi)和PCR反應(ying)程序(xu)。將(jiang)每個Van基因VanA、VanB、VanC、VanH、VanR、VanS、VanX和16SrRNA擴增(zeng)(zeng)的引物,分(fen)別配制PCR擴增(zeng)(zeng)緩沖(chong)液體系(xi),總體積為20 μL的PCR擴增(zeng)(zeng)體系(xi)中含有試劑分(fen)別為:Premix LATaq 10μL、F引物(10μM)1 μL、F引物(10 μM)1 μL、擴增(zeng)(zeng)模板2 μL、雙蒸水6 μL。
PCR反應程序為:95℃ 5 min;95℃10 s、55℃ 30 s、72℃30 s、30個循環;72℃ 10 min。
3、PCR產(chan)物(wu)與芯片(pian)雜交(jiao)
按照如下步驟操作:
a. 在實施例2中制備(bei)好(hao)的(de)基因芯片上,將待測樣品(pin)的(de)VanA、VanB、VanC、VanH、VanR、VanS、VanX和16SrRNA的(de)PCR擴(kuo)增產物(wu)混勻并點(dian)樣到芯片的(de)檢測槽(cao)中,VanA引(yin)物(wu)的(de)PCR產物(wu)分(fen)(fen)別點(dian)到VanA-1、VanA-2、VanA-3探針(zhen)上,VanB、VanC、VanH、VanR、VanS、VanX引(yin)物(wu)的(de)PCR產物(wu)分(fen)(fen)別對(dui)應點(dian)到探針(zhen)上,16sRNA引(yin)物(wu)的(de)PCR產物(wu)分(fen)(fen)別點(dian)到陽性質控(kong)探針(zhen)(PC)與(yu)陰性質控(kong)探針(zhen)(NC)。具體步驟為:PCR產物(wu)95℃解鏈5分(fen)(fen)鐘,迅(xun)速置于冰上,PCR產物(wu)與(yu)雜交緩沖液(ye)(50%甲酰(xian)胺(an),10×SSC,0.2%SDS)等(deng)體積混合,每孔點(dian)10 μL混合液(ye),在濕盒中,于60℃雜交孵育2小時;
b. 取出孵育后的基(ji)因芯片,用洗滌液(ye)(0.3×SSC緩沖(chong)液(ye))清洗3次(ci);
c.將芯(xin)片放入激(ji)光(guang)(guang)共聚焦檢測儀(GenePix)在650 nm處掃(sao)描芯(xin)片;軟件分析熒光(guang)(guang)信號強度值,給(gei)出(chu)結果。
實(shi)施(shi)例(li)4 檢測待測樣品(pin)
從第三軍醫(yi)大(da)學獲取糖肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥細(xi)菌感染的樣本5份(膝(xi)關節積液),無糖肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥基(ji)因感染樣本1份(對照組)。按照實施例(li)1和3中的引物(wu)和方(fang)法分別提(ti)取待測樣品的基(ji)因組,進行PCR擴(kuo)(kuo)增(zeng)(zeng)(zeng)后,使用實施例(li)2中的基(ji)因芯片進行檢測。PCR擴(kuo)(kuo)增(zeng)(zeng)(zeng)后的產物(wu)電(dian)泳條(tiao)帶表明本發明設計的擴(kuo)(kuo)增(zeng)(zeng)(zeng)引物(wu)特異性高,能特異、靈敏地(di)擴(kuo)(kuo)增(zeng)(zeng)(zeng)出目標基(ji)因(如(ru)圖(tu)2所示(shi))。
對(dui)于細(xi)菌感染的樣品,激光共(gong)聚焦檢(jian)測(ce)儀(GenePix)在650 nm處掃描芯片,探針點(dian)熒光信號(hao)較強(qiang)(大于20),記為(+),熒光信號(hao)較弱(小于5),則記為(-),熒光信號(hao)強(qiang)度難以分辨(5~20)則記為(*)。檢(jian)測(ce)中同時設計(ji)陽(yang)性(xing)和陰(yin)性(xing)質(zhi)控對(dui)照,只有當陽(yang)性(xing)和陰(yin)性(xing)質(zhi)控對(dui)照的檢(jian)測(ce)結果(guo)同時分為別陽(yang)性(xing)(+)和陰(yin)性(xing)(-),才認為該(gai)組(zu)檢(jian)測(ce)結果(guo)可信。
判斷(duan)檢(jian)測(ce)(ce)(ce)結(jie)果時,當VanA、VanB、VanC、VanH、VanR、VanS、VanX基因(yin)的(de)3個(ge)探(tan)針均顯示(shi)陽性時才(cai)判斷(duan)該樣(yang)本帶有(you)(you)該耐藥(yao)基因(yin),如(ru)果其(qi)中某一個(ge)或(huo)者兩個(ge)探(tan)針顯示(shi)陽性,則應對該檢(jian)測(ce)(ce)(ce)樣(yang)品(pin)重新(xin)檢(jian)測(ce)(ce)(ce),3個(ge)探(tan)針結(jie)果須一致才(cai)能(neng)采信(xin)該檢(jian)測(ce)(ce)(ce)結(jie)果。3個(ge)探(tan)針檢(jian)測(ce)(ce)(ce)結(jie)果不一致時,也(ye)可使用現(xian)有(you)(you)其(qi)它技術(比(bi)如(ru)elisa方(fang)法(fa))進一步檢(jian)測(ce)(ce)(ce)驗證。檢(jian)測(ce)(ce)(ce)結(jie)果如(ru)表2所示(shi)。
表2 樣本檢測結果
結果顯示為(wei)(wei)陽性(xing)(xing)質(zhi)控(kong)對照(zhao)均(jun)(jun)為(wei)(wei)陽性(xing)(xing)(+),陰性(xing)(xing)質(zhi)控(kong)對照(zhao)均(jun)(jun)為(wei)(wei)陰性(xing)(xing)(-),說明檢(jian)測結果可(ke)信。其中5份樣(yang)(yang)本(ben)中均(jun)(jun)檢(jian)測到(dao)糖(tang)(tang)肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥(yao)基(ji)(ji)(ji)因感(gan)(gan)染(ran)(ran),樣(yang)(yang)本(ben)1被(bei)(bei)糖(tang)(tang)肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥(yao)基(ji)(ji)(ji)因VanA感(gan)(gan)染(ran)(ran),樣(yang)(yang)本(ben)2被(bei)(bei)糖(tang)(tang)肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥(yao)基(ji)(ji)(ji)因VanR感(gan)(gan)染(ran)(ran),樣(yang)(yang)本(ben)3被(bei)(bei)糖(tang)(tang)肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥(yao)基(ji)(ji)(ji)因VanX感(gan)(gan)染(ran)(ran),樣(yang)(yang)本(ben)4被(bei)(bei)糖(tang)(tang)肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥(yao)基(ji)(ji)(ji)因VanX感(gan)(gan)染(ran)(ran),樣(yang)(yang)本(ben)5被(bei)(bei)糖(tang)(tang)肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥(yao)基(ji)(ji)(ji)因VanR感(gan)(gan)染(ran)(ran);對照(zhao)樣(yang)(yang)本(ben)均(jun)(jun)未檢(jian)測到(dao)糖(tang)(tang)肽類抗(kang)生素(su)耐(nai)藥(yao)基(ji)(ji)(ji)因,與(yu)實(shi)際(ji)臨床樣(yang)(yang)本(ben)信息情況相符。
本發明公開的探(tan)針、基因芯片、試劑盒,特異性(xing)高(gao)、結果非常準確(que),檢測快速、工作效率高(gao),操作簡單,滿足醫院等的現(xian)場檢測需求,為(wei)診斷糖(tang)肽類(lei)抗(kang)生素耐(nai)藥細(xi)菌感(gan)染提供可(ke)靠的實驗依(yi)據。
SEQUENCE LISTING
<110> 重慶威斯騰生物醫藥科技有限責任公(gong)司
<120> 一種糖(tang)肽類抗(kang)生素耐藥基因檢測試劑盒
<130> 2017
<160> 39
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
tttttttttt ttttttgacg tgaaaccggg cagagtattg acttc 45
<210> 2
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序(xu)列
<400> 2
tttttttttt tttttgattt ggtccacctc gccaacagct aacgc 45
<210> 3
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
tttttttttt tttttattaa taacccaaaa ggcgggagta gctat 45
<210> 4
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
tttttttttt tttttttttt gaattgtctg gtatccccta tgtaggc 47
<210> 5
<211> 47
<212> DNA
<213> 人(ren)工序列
<400> 5
tttttttttt tttttttccg gcacggtcag gttcgtcctt tggcgta 47
<210> 6
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工(gong)序列
<400> 6
tttttttttt tttttgatca aatccggttg agccacggta tcttc 45
<210> 7
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工(gong)序列
<400> 7
tttttttttt tttttcataa acagaaaata cagccgctat tcgaa 45
<210> 8
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
tttttttttt ttttttctgc cttatgtatg aacaaatggc tgctg 45
<210> 9
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
tttttttttt tttttggcaa cgactctttg actgtcggtg cttgt 45
<210> 10
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
tttttttttt tttttggtgt gaaatatatt tctacccgaa gcatc 45
<210> 11
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
tttttttttt tttttgtggt gggaacgggc cagataggca aagcg 45
<210> 12
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工(gong)序列
<400> 12
tttttttttt tttttattat cagccacgaa caaatacaga gaatg 45
<210> 13
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
tttttttttt tttttatatt ggacatcatg cttcccggca caagc 45
<210> 14
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工(gong)序(xu)列
<400> 14
tttttttttt tttttgggtt aacaatcggc gcggatgatt atata 45
<210> 15
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
tttttttttt tttttgaaaa tgttatcgtc cactccggcc ttgtc 45
<210> 16
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 16
tttttttttt tttttgatgt acttattcag aacgaagata aacaa 45
<210> 17
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 17
tttttttttt tttttggaaa acaggcggtt attcacgccc ccgag 45
<210> 18
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序(xu)列
<400> 18
tttttttttt tttttgccga acaaagaaaa aatgacgttg ttatg 45
<210> 19
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 19
tttttttttt tttttttgaa ggcaaaagaa ctggctgcta cccaa 45
<210> 20
<211> 45
<212> DNA
<213> 人工序(xu)列(lie)
<400> 20
tttttttttt tttttgcttc aaaatcaagc catagccgcg gcagt 45
<210> 21
<211> 45
<212> DNA
<213> 人(ren)工序列
<400> 21
tttttttttt tttttgcggc aaatggaata tcatgcaatg aagcg 45
<210> 22
<211> 34
<212> DNA
<213> 人(ren)工序(xu)列
<400> 22
tttttttttt tttttccgat agtgaaccag tacc 34
<210> 23
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列(lie)
<400> 23
tttttttttt tttttctatc tagctagcta gctagcta 38
<210> 24
<211> 25
<212> DNA
<213> 人(ren)工序列
<400> 24
cgatcaagcg gtcaatcagt tcggg 25
<210> 25
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 25
cctctgagca acccccaaac agta 24
<210> 26
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 26
gcggttgctc ggaggaacat gatgtgtcg 29
<210> 27
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工(gong)序(xu)列
<400> 27
tatcgccaat gtaatcaggc tgtc 24
<210> 28
<211> 27
<212> DNA
<213> 人(ren)工序列
<400> 28
attcaccgga atacaccgtt tctttag 27
<210> 29
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列(lie)
<400> 29
tcttgatagg ataagccgac cgctgc 26
<210> 30
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 30
tcggcattac tgtttatgga tgtga 25
<210> 31
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 31
ctcctgtctc ctttcaaaat ccaaacag 28
<210> 32
<211> 26
<212> DNA
<213> 人(ren)工序列
<400> 32
gtggatgatg aacatgaaat tgccga 26
<210> 33
<211> 25
<212> DNA
<213> 人(ren)工序(xu)列
<400> 33
aaccaagtct ggcatcgctg gaagc 25
<210> 34
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 34
attcgtgttg tatattcgtt caatg 25
<210> 35
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 35
aaccaagtct ggcatcgctg gaagc 25
<210> 36
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 36
gatgaaatag tacacggtg 19
<210> 37
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 37
ggggaaatca aaatagctat t 21
<210> 38
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序(xu)列
<400> 38
gagagtttga tyctggctca g 21
<210> 39
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序(xu)列(lie)
<400> 39
aaggaggtga tccarccgca 20