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大豆bHLH轉錄因子基因GmFER及其編碼蛋白和應用的制作方法

文檔序號(hao):11126057閱(yue)讀:1657來源:國知局(ju)
大豆bHLH轉錄因子基因GmFER及其編碼蛋白和應用的制造方法與工藝

本發明屬(shu)于(yu)植物基因工程(cheng)領域,涉及(ji)植物FER基因及(ji)其(qi)編(bian)碼蛋白和應用,特(te)別涉及(ji)大(da)豆bHLH轉錄(lu)因子基因GmFER,其(qi)編(bian)碼蛋白,及(ji)其(qi)在提高酵母及(ji)煙(yan)草(cao)對鎘的耐受性中的應用。



背景技術:

隨著社會的日益發展,非農業建設用地(di)迅速(su)擴張,廢棄物(wu)排放(fang)量以及農業化肥使(shi)用量增加(jia),土壤重金屬污染逐漸成為(wei)世界(jie)性環境問題(ti)。鎘(Cd)是一(yi)種生(sheng)物(wu)毒性很強的重金屬,半衰期非常長,攝(she)入過量會導致(zhi)腎臟和骨骼的病變(參(can)見Nawrot T.,Plusquin M.,Hogervorst J.,et al.,Environmental exposure to cadmium and risk of cancer:a prospective population-based study[J],Lancet Oncology,2006,7(2):119-126)。

大(da)豆是在農業生(sheng)產上具(ju)有較(jiao)高經(jing)濟價值(zhi)的(de)(de)(de)農作物(wu)(wu),含有豐富(fu)的(de)(de)(de)蛋白質和油脂,與人類的(de)(de)(de)生(sheng)活息息相關。但(dan)是,大(da)豆極易積累(lei)重金屬(shu)(shu)(參見Wolnik K.A.,Fricke F.L.,Capar S.G.,et al.,Elements in major raw agricultural crops in the United States.1.Cadmium and lead in lettuce,peanuts,potatoes,soybeans,sweet corn,and wheat[J],J.Agric.Food Chem.,1983,31(6):1240-1244),重金屬(shu)(shu)在植(zhi)物(wu)(wu)體內的(de)(de)(de)大(da)量(liang)積累(lei),不(bu)僅嚴重影響植(zhi)物(wu)(wu)的(de)(de)(de)生(sheng)長和發育(yu),而且會通過食物(wu)(wu)鏈(lian)危及人類的(de)(de)(de)健(jian)康。

bHLH(basic/Helix-Loop-Helix,堿性(xing)/螺旋(xuan)-環-螺旋(xuan))轉錄(lu)因(yin)(yin)子是植(zhi)(zhi)物(wu)轉錄(lu)因(yin)(yin)子中(zhong)最大的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)家族之(zhi)一。同一bHLH轉錄(lu)因(yin)(yin)子中(zhong)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)兩個(ge)α-螺旋(xuan)之(zhi)間或(huo)者不(bu)同bHLH轉錄(lu)因(yin)(yin)子的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)α-螺旋(xuan)之(zhi)間可(ke)以(yi)相互作用,形成同源(yuan)或(huo)異源(yuan)二(er)聚(ju)體(ti),與(yu)靶基因(yin)(yin)啟動子結合,調(diao)控(kong)基因(yin)(yin)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)轉錄(lu)(參(can)(can)見(jian)Ma P.C.M.,Rould M.A.,Weintraub H.,et al.,Crystal structure of MyoDbHLH domain-DNA complex:Perspectives on DNA recognition and implications for transcriptional activation[J],Cell,1994,77(3):451-459)。bHLH廣泛存在于植(zhi)(zhi)物(wu)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)不(bu)同組織中(zhong),在植(zhi)(zhi)物(wu)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)生長(chang)發育調(diao)控(kong)過程中(zhong)發揮極為重要的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)作用。擬南芥bHLH基因(yin)(yin)(FIT、AtbHLH38和AtbHLH39)參(can)(can)與(yu)了植(zhi)(zhi)物(wu)對Cd脅迫的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)響應(ying)(ying),組成性(xing)地啟動了一些參(can)(can)與(yu)重金屬區隔化(hua)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)基因(yin)(yin)(如HMA3、MTP3、IREG2和IRT2)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)表達,從(cong)而(er)將吸收的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)Cd大部分區隔化(hua)在根部,減少了向地上部的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)轉運(參(can)(can)見(jian)Wu HL,Chen CL,Du J,et al.,Co-Overexpression FIT with AtbHLH38 or AtbHLH39 inArabidopsis-Enhanced Cadmium Tolerance via IncreasedCadmium Sequestration in Roots and Improved Iron Homeostasis of Shoots[J],Plant Physiology,2012,158:790-800),但至今(jin)尚(shang)未有(you)報(bao)道(dao)披露大豆bHLH轉錄(lu)因(yin)(yin)子基因(yin)(yin)的(de)(de)(de)(de)(de)(de)(de)相關應(ying)(ying)用。



技術實現要素:

針對(dui)上述情況,本發明(ming)根(gen)據(ju)同源克(ke)隆(long)的(de)(de)方(fang)法(fa),從栽(zai)培大豆的(de)(de)根(gen)系中克(ke)隆(long)出一種(zhong)bHLH轉錄因(yin)子基因(yin)GmFER,該基因(yin)對(dui)Cd脅迫(po)有(you)響應。分(fen)離與(yu)克(ke)隆(long)大豆GmFER基因(yin)不僅有(you)利于揭示大豆的(de)(de)抗Cd機制,還可以通過基因(yin)操作的(de)(de)手段(duan)進行微生物(wu)或植(zhi)物(wu)的(de)(de)抗Cd分(fen)子育種(zhong),以便提(ti)高抗Cd性。

具(ju)體而言,本發明提(ti)供了大豆bHLH轉錄因子基因GmFER,全長972bp,其核苷酸序列(lie)如(ru)SEQ ID NO:1所示(shi)。

本發明還提供了由上述(shu)大豆bHLH轉(zhuan)錄(lu)因(yin)子基(ji)(ji)因(yin)GmFER編(bian)碼的蛋白,包含323個氨基(ji)(ji)酸(其中從N端第129位(wei)到第185位(wei)的氨基(ji)(ji)酸序(xu)列(lie)為bHLH轉(zhuan)錄(lu)因(yin)子的保守結構域),其氨基(ji)(ji)酸序(xu)列(lie)如SEQ ID NO:2所示。

此(ci)外,包含如SEQ ID NO:1所示的(de)(de)核(he)(he)苷酸(suan)序(xu)列(lie)(lie)并且編碼如SEQ ID NO:2所示的(de)(de)氨(an)基(ji)(ji)酸(suan)序(xu)列(lie)(lie)的(de)(de)多核(he)(he)苷酸(suan)序(xu)列(lie)(lie)以及將如SEQ ID NO:2所示的(de)(de)氨(an)基(ji)(ji)酸(suan)序(xu)列(lie)(lie)中的(de)(de)一個(ge)(ge)或(huo)多個(ge)(ge)(不多于十個(ge)(ge))氨(an)基(ji)(ji)酸(suan)殘基(ji)(ji)進(jin)行取代和/或(huo)缺失和/或(huo)添加并且具有轉(zhuan)錄激活功(gong)能、調控植物(wu)抗逆性的(de)(de)氨(an)基(ji)(ji)酸(suan)序(xu)列(lie)(lie)也(ye)在(zai)本(ben)發明的(de)(de)保護范圍之內。

本發明(ming)還(huan)提供(gong)了包含(han)上(shang)述(shu)大豆bHLH轉錄(lu)因子(zi)基因GmFER的(de)表(biao)達載(zai)體(ti),所述(shu)表(biao)達載(zai)體(ti)通(tong)過將上(shang)述(shu)大豆bHLH轉錄(lu)因子(zi)基因GmFER插入載(zai)體(ti)而得(de),所述(shu)載(zai)體(ti)選(xuan)自p424GPD、pBI121、pCXSN、pCAMBIA2301、pCAMBIA1301、pAHC25中的(de)任意一種(zhong)。

當使用上(shang)述大豆(dou)bHLH轉錄(lu)(lu)因(yin)(yin)(yin)(yin)(yin)子(zi)基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)(yin)GmFER構(gou)建表達載體時(shi),在其轉錄(lu)(lu)起始核苷酸前可(ke)(ke)加上(shang)任(ren)何一種組(zu)成型(xing)、組(zu)織特異型(xing)、誘導(dao)型(xing)或(huo)增強型(xing)啟動(dong)子(zi)。為(wei)了便于對轉基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)(yin)微(wei)生(sheng)物或(huo)植物進行(xing)(xing)鑒(jian)定及篩(shai)選(xuan),可(ke)(ke)對所用表達載體進行(xing)(xing)加工,如(ru)加入具有抗(kang)(kang)性的(de)抗(kang)(kang)生(sheng)素(su)標(biao)(biao)記(ji)物(如(ru)卡那霉素(su)標(biao)(biao)記(ji)物、潮霉素(su)標(biao)(biao)記(ji)物等(deng)(deng))、抗(kang)(kang)化(hua)學試劑標(biao)(biao)記(ji)基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)(yin)(如(ru)抗(kang)(kang)除草劑bar基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)(yin)等(deng)(deng))或(huo)可(ke)(ke)產生(sheng)顏(yan)色變化(hua)的(de)酶或(huo)蛋白(如(ru)GUS基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)(yin)、GFP基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)(yin)等(deng)(deng))等(deng)(deng)。

本(ben)發明還(huan)提(ti)供(gong)了包含(han)上(shang)述大豆(dou)bHLH轉(zhuan)錄(lu)因(yin)子(zi)基(ji)因(yin)GmFER的工程(cheng)菌(jun),所述工程(cheng)菌(jun)中的宿主為大腸桿菌(jun)或酵母菌(jun),通過PEG/LiAc介(jie)導的方法將上(shang)述大豆(dou)bHLH轉(zhuan)錄(lu)因(yin)子(zi)基(ji)因(yin)GmFER轉(zhuan)入(ru)。

本發明還提供了(le)包(bao)含上述(shu)大(da)(da)豆(dou)(dou)bHLH轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)因子(zi)基(ji)(ji)(ji)因GmFER的轉(zhuan)(zhuan)基(ji)(ji)(ji)因植物(wu)細胞(bao)系(xi),所述(shu)植物(wu)為煙草,通過農桿菌介導的方法將(jiang)上述(shu)大(da)(da)豆(dou)(dou)bHLH轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)因子(zi)基(ji)(ji)(ji)因GmFER轉(zhuan)(zhuan)入。

本發明還(huan)提供了一對用于擴(kuo)增(zeng)上述(shu)大豆bHLH轉錄因子基因GmFER的(de)引(yin)物(wu),其中正向引(yin)物(wu)的(de)核苷酸序(xu)列(lie)如(ru)(ru)SEQ ID NO:3所示,反向引(yin)物(wu)的(de)核苷酸序(xu)列(lie)如(ru)(ru)SEQ ID NO:4所示。

本發明還(huan)提供了上(shang)述大(da)豆(dou)bHLH轉錄因子基(ji)因GmFER及(ji)其(qi)(qi)編碼蛋(dan)白和包(bao)含(han)其(qi)(qi)的(de)表達載體在提高酵(jiao)母對Cd的(de)耐(nai)受性中的(de)應用。通過將(jiang)大(da)豆(dou)bHLH轉錄因子基(ji)因GmFER導入(ru)酵(jiao)母中,提高了酵(jiao)母的(de)抗(kang)Cd性。此外,上(shang)述大(da)豆(dou)bHLH轉錄因子基(ji)因GmFER及(ji)其(qi)(qi)編碼蛋(dan)白和包(bao)含(han)其(qi)(qi)的(de)表達載體在提高植物(wu)(優選單(dan)子葉(xie)和雙子葉(xie)植物(wu))對Cd的(de)耐(nai)受性中的(de)應用也在本發明的(de)保護范(fan)圍之(zhi)內。

本發(fa)明提(ti)(ti)(ti)供的(de)(de)大豆bHLH轉錄因(yin)(yin)子基(ji)(ji)因(yin)(yin)GmFER來自大豆(Williams 82品種),半定量(liang)PCR檢(jian)測結果表(biao)明GmFER基(ji)(ji)因(yin)(yin)主要在大豆的(de)(de)根中表(biao)達。在Cd脅迫后,其表(biao)達量(liang)明顯提(ti)(ti)(ti)高,說(shuo)明該基(ji)(ji)因(yin)(yin)受Cd誘導。在酵(jiao)母中過表(biao)達GmFER基(ji)(ji)因(yin)(yin)能夠提(ti)(ti)(ti)高酵(jiao)母對Cd的(de)(de)耐受性(xing),并能提(ti)(ti)(ti)高轉GmFER基(ji)(ji)因(yin)(yin)煙草對Cd的(de)(de)耐受性(xing)。因(yin)(yin)此,GmFER基(ji)(ji)因(yin)(yin)可以作為目的(de)(de)基(ji)(ji)因(yin)(yin)導入植(zhi)(zhi)物(wu)(wu)(包括單子葉和(he)雙子葉植(zhi)(zhi)物(wu)(wu)),從(cong)而提(ti)(ti)(ti)高植(zhi)(zhi)物(wu)(wu)對Cd的(de)(de)耐受性(xing),具(ju)有較高的(de)(de)應用價值。

附圖說明

圖1為(wei)大豆bHLH轉錄因(yin)子基因(yin)GmFER編碼蛋白與(yu)其(qi)他(ta)植物bHLH結構域的氨基酸序列多重比對(dui)結果,其(qi)中:GmFER-like來(lai)自(zi)大豆,LjbHLH21來(lai)自(zi)百脈根,MtbHLH來(lai)自(zi)蒺藜(li)苜蓿(xu),AtFER來(lai)自(zi)擬(ni)南芥,AtbHLH來(lai)自(zi)擬(ni)南芥。

圖(tu)2為(wei)GmFER的進化樹(shu)分析(xi)圖(tu),其中:GmFER-like(Glycine max,XP_003541980.1);LjbHLH21(Lotus japonicus,ACN21647.1);MtbHLH(Medicago truncatula,XP_003606331.1);AtFER-like(Arabidopsis thaliana,NP_850114.1);AtbHLH(Arabidopsis thaliana,AAM10938.1);VvFER-like(Vitis vinifera,XP_002272647.1);SlbHLH(Solanum lycopersicum,NP_001234654.1);ZmbHLH(Zea mays,DAA38198.1);BnbHLH(Brassica napus,CAD54298.1);VvbHLH35(Vitis vinifera,XP_002263999.1)。

圖3為(wei)GmFERmRNA在葉、莖和根中表達(da)豐度(du)的半定量(liang)PCR檢測結(jie)果(guo)。

圖4為采用100μM的CdCl2處理(li)不同時間后對GmFERmRNA表達(da)影響的半(ban)定量PCR檢(jian)測(ce)結(jie)果。

圖(tu)5為酵母表達載體(ti)的構建示意圖(tu),其中(zhong):A為p424GPD空載體(ti)物(wu)理圖(tu)譜(pu);B為p424GPD::GmFER植物(wu)表達載體(ti)物(wu)理圖(tu)譜(pu)。

圖6為GmFER基因對于酵母對Cd的耐受性的影響的檢測結果。

圖7為pCXSN::GmFER植物表達(da)載體示意圖。

圖8為轉基因煙草在CdCl2脅迫下的根(gen)長生長情況,其(qi)中:WT表(biao)示野生型煙草,T表(biao)示轉基(ji)因煙草。

具體實施方式

以下(xia)將結合附圖和(he)具體實施(shi)例(li)(li)來(lai)說(shuo)(shuo)明(ming)本發明(ming)的(de)技術(shu)方案(an)。應當理解(jie)的(de)是(shi),這些實施(shi)例(li)(li)僅(jin)用(yong)于舉例(li)(li)說(shuo)(shuo)明(ming)本發明(ming),而非以任何(he)方式限制本發明(ming)的(de)范圍(wei)。除非另有說(shuo)(shuo)明(ming),下(xia)列實施(shi)例(li)(li)中(zhong)所使(shi)用(yong)的(de)術(shu)語(yu)具有本領域(yu)普通技術(shu)人員通常(chang)理解(jie)的(de)含義,未注(zhu)明(ming)的(de)實驗方法均可按(an)照(zhao)(zhao)常(chang)規(gui)(gui)方法進行,例(li)(li)如(ru)參(can)照(zhao)(zhao)J.薩姆布魯克(Sambrook J.)和(he)D.W.拉塞爾(Russell D.W.)著《分子克隆實驗指(zhi)南》(科學(xue)出(chu)版社,2005)或者按(an)照(zhao)(zhao)生物試劑生產廠商的(de)使(shi)用(yong)說(shuo)(shuo)明(ming)中(zhong)記載的(de)條件。另外,下(xia)列實施(shi)例(li)(li)中(zhong)所使(shi)用(yong)的(de)儀器、材料、試劑均可通過常(chang)規(gui)(gui)商業手段獲得。

實(shi)施例1:大豆bHLH轉錄因子(zi)基因GmFER的克(ke)隆(long)。

利用(yong)生物信息學(xue)和常規聚合酶鏈式反應(PCR)相結合的(de)方法克隆大豆GmFER基因的(de)DNA序列,具(ju)體方法如下(xia)所(suo)述:

以Williams 82品種大豆的根系作為實驗材料,采用SV Total RNAlysis試劑盒(Promega公司,美國)提取總RNA。按照TaKaRa公司提供的方法,采用PrimeScriptTM逆轉(zhuan)錄酶(mei)合成(cheng)(cheng)出cDNA,并(bing)以其作為模板進行PCR擴增,PCR擴增過(guo)程中使用的一對引(yin)物(wu)P1(如SEQ ID NO:3所示,由(you)上海生物(wu)工程公司合成(cheng)(cheng))和(he)P2(如SEQ ID NO:4所示,由(you)上海生物(wu)工程公司合成(cheng)(cheng))則根據NCBI中已(yi)知的GmFER序(xu)列進行設計與(yu)合成(cheng)(cheng):

P1:5’-ATGGATGTTCACGAAGACACACTCA-3’;

P2:5’-TCAAGCAGGAAAAGATGCCACGAAT-3’。

通過RT-PCR方法擴增,獲得GmFER基因完整的開放閱讀框(ORF)片段。25μlPCR反應體系如下:含MgCl2的(de)10×PCR緩沖液2.5μl,正向、反向引物(wu)各1.0μl(10μM),dNTP(10mM)1.0μl,cDNA樣品2.0μl,Ex-Taq酶(寶生物(wu)工(gong)程(大連)有限(xian)公(gong)司(si))0.25μl,雙(shuang)蒸水17.5μl。PCR反應條(tiao)件:95℃預變性(xing)5min;95℃變性(xing)30s,58℃復性(xing)45s,72℃延伸1min,30個循(xun)環后,72℃延伸10min。將(jiang)擴(kuo)增(zeng)得到的(de)大約(yue)800bp的(de)DNA片(pian)段進(jin)行瓊脂糖(tang)凝(ning)(ning)膠(jiao)電泳分(fen)離,采用凝(ning)(ning)膠(jiao)回(hui)(hui)收(shou)試劑盒(he)(杭州愛思進(jin)生物(wu)技(ji)術有限(xian)公(gong)司(si))并(bing)按(an)照試劑盒(he)中提供的(de)方(fang)案進(jin)行回(hui)(hui)收(shou),并(bing)克隆(long)到pEASY-T1(Clontech)載體上(shang),進(jin)行測序(xu)分(fen)析(由上(shang)海invitrogen公(gong)司(si)完成),測序(xu)結果和NCBI中的(de)GmFER基因序(xu)列完全相同。

實施例2:GmFER轉錄本(ben)的(de)時空(kong)分(fen)布以及Cd脅(xie)迫對GmFER基(ji)因(yin)表(biao)達的(de)影響(xiang)。

利用半定量(liang)PCR的(de)(de)方法(fa)(fa),檢測GmFER在大豆植(zhi)株中(zhong)的(de)(de)組(zu)織分布情況,并采取(qu)以下措(cuo)施保(bao)證檢測結果的(de)(de)可(ke)靠(kao)性:利用擴(kuo)增級別DNase I消(xiao)(xiao)(xiao)化(hua)提取(qu)的(de)(de)總(zong)RNA中(zhong)可(ke)能(neng)存在的(de)(de)少量(liang)的(de)(de)基因(yin)組(zu)DNA的(de)(de)污染,為了(le)(le)檢測基因(yin)組(zu)DNA是否(fou)消(xiao)(xiao)(xiao)除干凈,可(ke)以取(qu)出(chu)一(yi)部分用DNase I消(xiao)(xiao)(xiao)化(hua)的(de)(de)總(zong)RNA樣(yang)品進行(xing)常規(gui)PCR反應。當發現沒有擴(kuo)增條帶(dai)產生時(shi),再進行(xing)反轉(zhuan)錄步驟,同時(shi)為了(le)(le)進一(yi)步驗證實時(shi)定量(liang)PCR擴(kuo)增的(de)(de)條帶(dai)是否(fou)就是GmFER,將PCR產物切膠(jiao)回(hui)收進行(xing)測序。具體方法(fa)(fa)為:取(qu)大豆不同生長時(shi)期根、莖(jing)、葉、花和(he)莢(jia)等(deng)材料提取(qu)總(zong)RNA為模(mo)板,半定量(liang)PCR的(de)(de)引物為P1和(he)P2。

以大豆激動蛋白(GmActin)cDNA作為(wei)內參(can),半(ban)定量PCR引物P3(如(ru)SEQ ID NO:5所(suo)示(shi),由上海生(sheng)物工程公(gong)司合成)和P4(如(ru)SEQ ID NO:6所(suo)示(shi),由上海生(sheng)物工程公(gong)司合成)的核苷酸序列如(ru)下:

P3(actin-F):5’-CGGTGGTTCTATCTTGGCATC-3’;

P4(actin-R):5’-GTCTTTCGCTTCAATAACCCTA-3’。

先(xian)取(qu)1μg總RNA,加入擴(kuo)增級別DNase I(Sigma公司(si),美(mei)國),于(yu)室溫(wen)放置(zhi)30min以(yi)(yi)除去基(ji)因組DNA的污染,然后(hou)加入停止緩沖液(50mM EDTA),于(yu)70℃加熱(re)10min變(bian)性(xing)DNase I和RNA,然后(hou)采(cai)用寶生物(wu)工(gong)程(大連(lian))有限(xian)公司(si)的反(fan)(fan)(fan)轉(zhuan)(zhuan)錄試劑盒并(bing)按照試劑盒中(zhong)說明(ming)書記載的方法進(jin)行反(fan)(fan)(fan)轉(zhuan)(zhuan)錄,每個樣(yang)品取(qu)1μg總RNA,于(yu)42℃反(fan)(fan)(fan)應1h,于(yu)70℃加熱(re)10min后(hou)取(qu)出(chu),置(zhi)于(yu)冰上,以(yi)(yi)使反(fan)(fan)(fan)轉(zhuan)(zhuan)錄酶失(shi)活,最后(hou)取(qu)1μl反(fan)(fan)(fan)轉(zhuan)(zhuan)錄產物(wu)進(jin)行半(ban)定(ding)量PCR擴(kuo)增,檢測結果如圖3所(suo)示,從中(zhong)可以(yi)(yi)看出(chu)GmFER基(ji)因主要在大豆根系中(zhong)表達。

為了研究GmFER基因對Cd脅迫的響應,采用半定量PCR的方法檢測GmFER基因在Cd脅迫下的表達模式。將三葉期大豆以100μM的CdCl2處理0h、1h、3h和(he)24h,以(yi)未做任何處理的三葉期大豆作為對照,然(ran)后(hou)采用與上述(shu)相同(tong)的方(fang)法檢測(ce)大豆根(gen)系(xi)中(zhong)GmFER基因(yin)的表(biao)達(da)情(qing)況,同(tong)樣以(yi)大豆的actin(激動蛋白)cDNA作為內參(can),以(yi)P1和(he)P2作為引物,檢測(ce)結果如圖4所示,從(cong)中(zhong)可(ke)以(yi)看(kan)出,在Cd脅迫后(hou),大豆根(gen)系(xi)中(zhong)GmFER的表(biao)達(da)量表(biao)現出先下(xia)降后(hou)上升(sheng)的趨勢(shi)。

實施(shi)例3:包含GmFER基因的(de)酵母(mu)表達載(zai)體的(de)構建以(yi)及(ji)轉基因酵母(mu)對Cd的(de)耐受性檢測。

(1)酵母(mu)表達載(zai)體的構建:

以GmFERcDNA全長序(xu)列(lie)為模板,在(zai)含有(you)酶(mei)切位(wei)(wei)點的正向引(yin)物(wu)(wu)P5(如(ru)SEQ ID NO:7所示(shi)(shi),由上(shang)海生物(wu)(wu)工程(cheng)公(gong)司合(he)成)和反向引(yin)物(wu)(wu)P6(如(ru)SEQ ID NO:8所示(shi)(shi),由上(shang)海生物(wu)(wu)工程(cheng)公(gong)司合(he)成)的引(yin)導下(xia),PCR擴增5’端添加(jia)BamHI識(shi)別位(wei)(wei)點、3’端添加(jia)SmaI識(shi)別位(wei)(wei)點的GmFERcDNA全長序(xu)列(lie),引(yin)物(wu)(wu)的核(he)苷酸序(xu)列(lie)如(ru)下(xia):

P5:5′-CGCGGATCCATGGATGTTCACGAAGACACACTCA-3′(帶下劃線(xian)的堿基(ji)為限制內切酶BamHI識別位點);

P6:5′-TCCCCCGGGTCAAGCAGGAAAAGATGCCACGAAT-3′(帶下劃線的(de)堿基為(wei)限(xian)制內切(qie)酶SmaI識別(bie)位點)。

反應結束后,對PCR擴增產物進行1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測,回收并純化972bp的目的片段,將其用BamHI和SmaI酶切后,與經相同酶雙酶切的載體p424GPD采用T4DNA連接酶于4℃連接過夜(20μl反應體系含1×T4DNA連接酶緩沖液,p424GPD片段0.03pmol,GmFER片段0.3pmol,T4DNA連接酶350U)。

將連接產物轉化大腸(chang)桿菌DH5α感受態細(xi)胞(轉化方法參照《分(fen)子克隆(long)實驗指(zhi)南(nan)》第二版,1992,科(ke)學出版社,第55~56頁),將轉化后的(de)(de)大腸(chang)桿菌DH5α細(xi)胞懸液(ye)涂布在含有(you)80mg/L氨芐青霉素(su)的(de)(de)平(ping)板上,將對抗氨芐青霉素(su)的(de)(de)陽性克隆(long)進行(xing)擴增并提取質粒,采取酶切和測序的(de)(de)方法驗證連接的(de)(de)正確性,得到酵母表(biao)達載(zai)體(ti)p424GPD::GmFER(如圖5所示)。

(2)PEG/LiAc法介導的(de)酵母轉(zhuan)化(hua)與(yu)篩選鑒(jian)定:

采用PEG/LiAc法轉化酵母細胞W303B,涂布在缺色氨酸(-Trp)的SD固體培養基上,于30℃培養3d,從培養平板中挑取單克隆進行PCR檢測,采用引物P1和P2,25μl PCR反應體系如下:含MgCl2的(de)10×PCR緩沖(chong)液2.5μl,正向、反(fan)向引物各(ge)1.0μl(10μM),dNTP 1.0μl(10mM),基因(yin)組DNA模(mo)板1.0μl,雙(shuang)蒸水18.5μl,以及Ex-Taq酶(寶(bao)生物工程(大連)有限公司(si))0.25μl。擴(kuo)增(zeng)反(fan)應條件如下(xia):95℃預變性4min,95℃變性30s,62℃復性50s,72℃延伸1min,35次循環后,72℃延伸min。將擴(kuo)增(zeng)產物進行凝膠電泳(yong),在鑒定(ding)的(de)9個單(dan)克隆中有3個陽性轉p424GPD::GmFER的(de)單(dan)克隆,得到含有p424GPD::GmFER的(de)酵母菌株。

(3)基因功能分析:

把含有p424GPD::GmFER表達載體的酵母及帶有空載體p424GPD的酵母分別以1%的接種量接種于100ml缺色氨酸(-Trp)的SD液體培養基中培養過夜,直至OD600=1,用SD(-Trp)液體培養基進行稀釋至OD600=0.1、0.01、0.001,分別滴在含有50μMCdCl2和不含有CdCl2的SD(-Trp)固體(ti)培(pei)養(yang)基(ji)上,于30℃培(pei)養(yang)3d,觀察菌落的生長情況,其結果(guo)如(ru)圖6所示。

從圖6中可以看出,在含有50μM CdCl2的培養基上,含有p424GPD::GmFER表達載體的酵母明顯比帶有空載體p424GPD的酵母生長得好,帶空載體p424GPD的酵母菌株在含有50μM CdCl2的培養基上幾(ji)乎(hu)不能(neng)生長(chang)。由(you)此可見,GmFER基因能(neng)夠提高酵母對Cd的耐受性(xing)。將GmFER基因作為(wei)目的基因導入(ru)植物(包括單子葉和雙子葉植物)也可以(yi)提高植物對Cd的耐受性(xing),具有較(jiao)高的應用價(jia)值。

實施例4:包含GmFER基因(yin)的(de)植物表達載(zai)體的(de)構(gou)建以(yi)及轉基因(yin)煙草對(dui)Cd的(de)耐受性檢測。

(1)植物表達載體的構建:

以GmFERcDNA全長序列(lie)為模板,通(tong)(tong)過(guo)P和(he)P2進行PCR擴(kuo)增(zeng)。反應結束(shu)后,對PCR擴(kuo)增(zeng)產物進行1.0%瓊脂(zhi)糖凝膠電泳檢測,回(hui)收并純化972bp的目的片段(duan),通(tong)(tong)過(guo)TA克隆的方法,把GmFER的ORF連接到植物表達(da)載體pCXSN。

將連接產(chan)物轉(zhuan)化大腸桿菌(jun)DH5α感(gan)受態細胞(bao)(轉(zhuan)化方(fang)法(fa)參照《分子克隆實驗(yan)指(zhi)南》第二版(ban),1992,科學出版(ban)社,第55~56頁),將轉(zhuan)化后(hou)的(de)(de)(de)大腸桿菌(jun)DH5α細胞(bao)懸液涂布在含(han)(han)有(you)80mg/L卡那霉毒(du)(du)的(de)(de)(de)平板(ban)上,將卡那霉毒(du)(du)的(de)(de)(de)陽性克隆進行擴增并提取質粒,采(cai)取測序(xu)的(de)(de)(de)方(fang)法(fa)驗(yan)證連接的(de)(de)(de)正確性,得(de)到植物表達載(zai)體pCXSN::GmFER(如圖7所(suo)示)。采(cai)用凍融轉(zhuan)化法(fa)將此載(zai)體轉(zhuan)化根癌農桿菌(jun)EH105,得(de)到含(han)(han)有(you)pCXSN::GmFER的(de)(de)(de)農桿菌(jun)菌(jun)株(zhu)。

(2)農桿菌介導的煙草轉化與(yu)篩選鑒定:

從培養平板中挑取單個農桿菌菌落,在2ml YEB培養基(含有50mg/L卡那霉素、30mg/L利福平)中培養過夜;以1%的接種量接種于100ml YEB培養基(含有50mg/L卡那霉素、30mg/L利福平)中培養過夜,6000rpm離心收集菌體,用侵染培養基重新懸浮,菌液濃度調整至OD600約為0.5,作為侵染菌液。采用葉圓盤轉化法,用無菌刀片將無菌煙草試管苗葉片切成4~6mm的葉盤,葉盤外植體在OD600約0.5的(de)(de)(de)pCXSN::GmFER農桿菌(jun)侵(qin)染溶液中(zhong)感(gan)染10min,取出(chu)后(hou)用(yong)無(wu)菌(jun)濾(lv)紙(zhi)吸干表(biao)面(mian)液體,放入含有(you)共培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)液(MS基(ji)(ji)(ji)本(ben)(ben)培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)基(ji)(ji)(ji)加(jia)6-芐(xia)氨(an)基(ji)(ji)(ji)嘌呤(ling)1.0mg/L、萘(nai)乙酸0.1mg/L、蔗糖30g/L,pH=5.8)的(de)(de)(de)濾(lv)紙(zhi)上黑暗條件(jian)下,25℃共培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)2天(tian)。經共培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)2天(tian)的(de)(de)(de)葉盤(pan)用(yong)含有(you)500mg/L的(de)(de)(de)羧(suo)芐(xia)青霉素水(shui)溶液洗滌3次,用(yong)無(wu)菌(jun)濾(lv)紙(zhi)吸干表(biao)面(mian)液體轉(zhuan)(zhuan)入篩(shai)選(xuan)分化(hua)(hua)培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)基(ji)(ji)(ji)中(zhong),25℃光(guang)照培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)。轉(zhuan)(zhuan)化(hua)(hua)體的(de)(de)(de)篩(shai)選(xuan)在(zai)篩(shai)選(xuan)分化(hua)(hua)培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)基(ji)(ji)(ji)(MS基(ji)(ji)(ji)本(ben)(ben)培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)基(ji)(ji)(ji)加(jia)6-芐(xia)氨(an)基(ji)(ji)(ji)嘌呤(ling)1.0mg/L、萘(nai)乙酸0.1mg/L、卡(ka)那(nei)(nei)霉素80mg/L、羧(suo)芐(xia)青霉素400mg/L、蔗糖30g/L,pH=5.8)中(zhong)進(jin)行。待葉片邊緣長出(chu)叢生(sheng)再(zai)生(sheng)芽至2~3cm時,用(yong)解(jie)剖刀將再(zai)生(sheng)芽切下,并(bing)轉(zhuan)(zhuan)入生(sheng)根培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)基(ji)(ji)(ji)(MS基(ji)(ji)(ji)本(ben)(ben)培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)基(ji)(ji)(ji)加(jia)卡(ka)那(nei)(nei)霉素50mg/L、蔗糖20g/L,pH=5.8)中(zhong)培(pei)(pei)(pei)養(yang)(yang)(yang)(yang)25天(tian)。轉(zhuan)(zhuan)化(hua)(hua)細胞再(zai)生(sheng)的(de)(de)(de)植株具有(you)卡(ka)那(nei)(nei)霉素抗性,為正常綠色植株,獲得轉(zhuan)(zhuan)基(ji)(ji)(ji)因植株。

提取pCXSN::GmFER轉基因煙草基因組DNA,以基因組DNA為模板進行PCR反應。將擴增產物進行凝膠電泳,并回收PCR產物進行測序。為了進一步鑒定轉基因植株,提取通過基因組檢測為陽性的轉pCXSN::GmFER煙草葉片總RNA,用1μg葉片總RNA經反轉錄試劑盒(寶生物工程(大連)有限公司)按試劑盒的方法反轉錄得到的cDNA為模板,PCR引物為實例4中的引物P1和P2,25μl PCR反應體系含2.5μl含MgCl2的(de)10×PCR緩沖(chong)液、正、反向(xiang)10μM的(de)引物(wu)(wu)各1.0μl、1.0μl 10mM的(de)dNTP(脫氧核(he)苷酸混合物(wu)(wu))、1.0μl cDNA模板和18.5μl雙蒸水,以及0.25μl rTaq酶(寶生物(wu)(wu)工(gong)程(大連)有(you)限公司)。擴增反應(ying)條件如(ru)下:95℃預變性4min,95℃30s,55℃50s,72℃1min,33次循(xun)環,72℃延伸10min。將(jiang)擴增產物(wu)(wu)進(jin)行凝膠電(dian)泳,獲得GmFER基因進(jin)行正常表達的(de)轉(zhuan)基因植(zhi)株。

(3)基(ji)因(yin)功能分(fen)析:

將轉基因煙草T0代種子及野生型種子在濾紙上進行萌發,28℃的光照培養箱中培養,10天后,取出大小生長一致的轉GmFER基因陽性煙草苗與對照煙草苗,將其分別轉移至含有50μM CdCl2的濾紙(zhi)上,在28℃的光照培養(yang)箱中培養(yang),處理(li)4天(tian)后,測量根長,其結果如圖8所示。結果顯示,GmFER基因(yin)在煙(yan)草(cao)中的過(guo)量表(biao)達能夠提高煙(yan)草(cao)轉(zhuan)基因(yin)植株對Cd脅迫的抗性。

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