一種食道癌易感基因位點高效分子分型的檢測試劑盒的制作方法
【技術領域】
[0001] 本發明屬于基因檢測技術領域,具體為一種食管癌易感基因位點高效分子分型的 檢測試劑盒。
【背景技術】
[0002] 食管癌是世界第八大最常見的腫瘤,分布呈現明顯的區域性;中國有六大食管癌 高發區,其中河南林州市和潮汕南澳島發病率最高,嚴重危害當地人群的生命健康安全, 如何篩查易感個體進行早期預防干預已成為當地亟待解決的社會公共衛生問題。
[0003] 隨著高通量SNP檢測芯片的飛速發展,食管癌大規模關聯研究近年大量涌現,報 道了一批散發食管癌易感基因和位點;本課題組致力于家族性食管癌易感基因定位研究十 余年,已發現多個家族性食管癌易感基因位點;為家族性和散發性食管癌易感個體篩查奠 定了堅實的基礎。
[0004]SequenomMassArray系統是一個高性能的DNA分析平臺,具有通量、準確性、靈敏 度、可重復性和成本效益的綜合優勢,特別適用于檢測幾十個DNA位點的人群篩查項目。
【發明內容】
[0005] 基于18個食管癌易感基因上的18個位點可用來評估個體對食管癌易感性的基 礎上,本發明提供一種食管癌易感基因位點高效分子分型的檢測試劑盒。
[0006] -種食管癌易感基因位點高效分子分型的檢測試劑盒,包括: PCR擴增引物; PCR延伸引物; PCR混合緩沖液(PCRBufferMix); PCR酶(PCREnzyme); SAP酶(SAPEnzyme); 延伸酶(ExtendEnzyme); 延伸混合緩沖液(ExtendBufferMix); 其特征在于:所述的PCR擴增引物和PCR延伸引物針對18個食管癌易感基因位點而設 計,基于SequenomMassArray系統,能對這18個位點高效精確分型。具體如表1所示: 表1食管癌易感基因Sequenom質譜飛行平臺分子分型PCR引物和延伸引物
【主權項】
1. 一種食管癌易感基因位點高效分子分型的檢測試劑盒,包括: PCR擴增引物; PCR延伸引物; PCR 混合緩沖液(PCR Buffer Mix); PCR 酶(PCR Enzyme); SAP 酶(SAP Enzyme); 延伸酶(Extend Enzyme); 延伸混合緩沖液(Extend Buffer Mix); 其特征在于;所述的PCR擴增引物和PCR延伸引物針對18個食管癌易感基因位點而設 計,基于Sequenom MassArray系統,能對該18個位點高效精確分型,具體如表1所示: 表1食管癌易感基因Sequenom質譜飛行平臺分子分型PCR引物和延伸引物
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2.根據權利要求1所述的一種食管癌易感基因位點高效分子分型的檢測試劑盒,其 特征在于;所述的引物混合物PCR產物一般在80-120bp ;延伸引物3'端設計在SNP位點她
鄰處,引物大小一般15-3化口,分子量4500 - 8000 03,而45°(:-60°(:。
3.根據權利要求1所述的一種食管癌易感基因位點高效分子分型的檢測試劑盒,其特 征在于;所述的PCR擴增引物和PCR延伸引物在同一孔內與樣品DNA發生反應,一次性檢測 18個位點判斷易感性。
【專利摘要】本發明公開了一種食管癌易感基因位點高效分子分型的檢測試劑盒。該試劑盒PCR擴增引物和PCR延伸引物是針對18個食管癌易感基因位點而設計,基于Sequenom MassArray系統,能對這18個位點高效精確分型。本發明的試劑盒通過監測分析個體的18個食管癌易感基因上的 18個位點基因攜帶型來評估個體對食管癌易感性。
【IPC分類】C12Q1-68
【公開號】CN104593499
【申請號】CN201510027447
【發明人】蘇敏, 黃博
【申請人】汕頭大學醫學院
【公開日】2015年5月6日
【申請日】2015年1月20日