一種仿刺參種質鑒定方法
【專利摘要】本發明是一種仿刺參種質鑒定方法,所述的鑒定方法步驟如下:(1)樣本提取:將疑似仿刺參樣本,隨機取樣,加液氮在研砵中研成粉末,分裝到2mLEP管中;提取DNA;(2)PCR鑒定;(3)鑒定標準:產物8%聚丙烯酰胺凝膠電泳2.5h,銀染顯色后掃描儀成像;引物Aja2-111的結果為111bp的一條帶;引物Aja13-144的結果為144bp的一條帶;引物Aja15-185的結果為185bp和384bp的2條帶;(4)結果判定:用引物擴增出如步驟(3)所述的條帶時,判定樣本是仿刺參。本發明方法設計合理,操作方便快捷,準確度高,有效地克服現有經驗性鑒定和利用刺參分類專家才可鑒定的缺陷。
【專利說明】一種仿刺參種質鑒定方法
【技術領域】
[0001] 本發明涉及種質鑒定方法,特別是一種仿刺參種質鑒定方法。
【背景技術】
[0002] 海參為海產棘皮動物門海參綱動物的總稱,全世界有900多種,可供食用的約40 多種,而我國有101種,可供食用的有21種。根據海參背面是否有圓錐肉刺狀的疣足分為 "有刺參"和"光皮參"兩大類。其中"有刺參"主要是"刺參科"的種類,"光皮參"主要是 "海參科""瓜參科"和"芋參科"的種類。通常見到的市售海參主要是海參科、刺參科、瓜參 科、和宇海參科的一些海參種類。
[0003] 在海參家族中,仿刺參(Apostichopus japonicus)是我國經濟價值最高的一種 海參。仿刺參隸屬于楣手目、刺參科、仿刺參屬。體呈圓筒狀,長度一般在20cm左右,直徑 在4cm左右。刺身的背部均勻分布著許多大小不等的肉刺,腹面平坦,受外界刺激后會蜷 縮身體并使身體變得僵硬。國內仿刺參一般在遼寧,河北,山東,江蘇等地的沿海地區很常 見。國外北太平洋區列如俄羅斯的薩哈林,海參崴;日本的北海道,橫濱,九州;朝鮮半島沿 岸等地區以及其他地區均有刺參的分布。仿刺參之所以是一種名貴的海產品,是在于它本 身具有很高的營養價值,而且還可以入藥,在醫學上也有很大的貢獻。隨著對仿刺參養殖的 深入研究以及技術的不斷改良,導致仿刺參養殖業開始迅速的發展,苗種的生產能力在不 斷地提高,養殖面積也在進一步的擴大,產量也在急速增長,養殖收益愈發可觀,成為我國 沿海漁業經濟中的重要支柱,是繼海帶、對蝦、扇貝、海水魚4次養殖浪潮后第5次海水養殖 浪潮的主體。
[0004] 由于仿刺參具有極高的營養價值,市場售價也較高,一些不法商販常用一些低價 的海參來充斥仿刺參市場,特別是經過加工后的海參制品更是難以鑒定其來源。因此,開發 一種仿刺參特有的鑒定方法,對于仿刺參種質鑒定、食源性檢測鑒定具有十分重要的作用。 當前,人們在鑒定仿刺參的方法上仍依賴傳統的經驗,以形態學鑒定生物種,但仿刺參經過 加工成半成品或食品原料時,或保健品時,其原有的形態則滅失,無法從外觀上加以鑒定。 而且,與仿刺參外觀相似的刺參種類也較多,需經非常專業的分類專家才可以鑒定,對生產 實際造成了很大的障礙。因此,開發一種相對簡單、一般檢測人員就可以鑒定的技術方案具 有很強的實用性和應用價值。
【發明內容】
[0005] 本發明所要解決的技術問題是針對現有技術的不足,提供一種新的、快捷方便的 仿刺參種質鑒定方法,該方法可以克服現有經驗性鑒定和利用刺參分類專家才可鑒定的缺 陷。
[0006] 本發明所要解決的技術問題是通過以下的技術方案來實現的。本發明是一種仿刺 參種質鑒定方法,其特點是,所述的鑒定方法步驟如下:
[0007] (1)樣本提取:將疑似仿刺參樣本,隨機取樣5g,加液氮在研砵中研成粉末,取 〇.〇5g分裝到2mL EP管中,取樣至少3支;在不能即時提取DNA時,則-20°C保存備用;按常 規的酚氯仿法提取DNA,或者用深加工食品DNA提取試劑盒按操作指南提取DNA ;
[0008] (2) PCR 鑒定:
[0009] 反應條件:
[0010]
【權利要求】
1. 一種仿刺參種質鑒定方法,其特征在于,所述的鑒定方法步驟如下: (1) 樣本提取:將疑似仿刺參樣本,隨機取樣5g,加液氮在研砵中研成粉末,取0.05g分 裝到2mLEP管中,取樣至少3支;在不能即時提取DNA時,則-20°C保存備用;按常規的酚 氯仿法提取DNA,或者用深加工食品DNA提取試劑盒按操作指南提取DNA; (2)PCR鑒定: 反應條件: 15u1體系: 模板 0. 2ii1 2XTaqPCRMasterMix7. 5u1 弓丨物 1. 1,上下游引物均為2. 5iimol/L ddH20 6. 1u1 PCR反應程序:
引物序列:
(3) 鑒定標準:產物8 %聚丙烯酰胺凝膠電泳2. 5h,銀染顯色后掃描儀成像;引物 Aja2-lll的結果為lllbp的一條帶;引物Ajal3-144的結果為144bp的一條帶;引物 Ajal5-185的結果為185bp和384bp的2條帶; (4) 結果判定:用步驟(2)所述的3對引物擴增出如步驟(3)所述的條帶時,判定樣本 是仿刺參。
2.根據權利要求1所述的仿刺參種質鑒定方法,其特征在于,步驟⑵中:所述引物的 設計合成方法如下: (1)將測序得到的引物序列用Seqman程序,進行對比拼接,去除冗余,再將得到的每一 個DNA序列輸入到SSR軟件中,找出每DNA序列的重復序列,以及其重復次數;運用Primer Premierf軟件對所有微衛星序列進行引物設計,設計出上游引物和下游引物共23對,將所 得到的引物序列進行合成;所設計的引物序列如下表:
(2)仿刺參合成引物的鑒定PCR擴增: 建立一個15ill的擴增體系:
上下游引物是根據引物合成單上的ODs值與nmoles per 0D中的n值向合成引物干粉 中添加TE buffer制成引物原液,再將引物原液與TE以1:39的比例稀釋40倍后用于擴增 體系,濃度為2.5 iimol/L,;而模板是4地理群體(采自遼寧大連,河北北戴河,山東東營, 江蘇連云港的天然水域)24個較好的仿刺參組DNA經過滅菌雙蒸水稀釋5倍后的稀釋液, 濃度約為l〇ng/yl ;將這它們用移液槍按要求量移入管中,用過離心將它們混合在一起然 后放入PCR擴增儀中進行擴增; PCR擴增程序 蓋頂溫度:99°C
PCR產物的檢測 擴增出來的PCR產物使用1.0%瓊脂糖凝膠電泳進行檢測:將混合液擴增產物進行檢 測,配制好的1. 0%的瓊脂糖膠液倒入插好梳子的電泳槽中凝固成型,然后拔掉梳子,加入 電泳液,沒過膠板0. 5-lcm,然后用移液槍將5ill的PCR產物和2ill的溴酚藍指示劑混合 均勻后點入瓊脂糖凝膠的點樣孔中;按下開關后,將電壓設置成120V,電流60m然后電泳約 30min;電泳結束后營造一個較暗的環境,用手提式紫外線照射儀查看條帶電泳情況,是否 跑出條帶,條帶亮度大小;觀察之后再將膠板拿到紫外線凝膠呈像系統觀察,并拍照記錄; 將電泳條帶較亮的引物篩選出來,作為下一步實驗用引物;23對引物中,12對引物的條帶 亮度較好,較為清晰;最終選定權利要求1所述的3對擴增穩定的引物。
3. 根據權利要求1所述的仿刺參種質鑒定方法,其特征在于,步驟⑶中:聚丙烯酰胺 凝膠電泳步驟如下: (1) 待聚丙烯酰胺凝膠凝固之后,將梳子輕輕拔出,夾子和膠條取下,將膠板耳板向里 固定在電泳槽中,兩邊各用兩個夾子夾緊; (2) 向電泳槽中加入1XTBE,下面加到槽壁的2/3處,上面加到沒過耳板lcm左右的地 方; ⑶接通電源,電泳槽上為負極,下為正極;以250V電壓,70mA電流,預電泳30min; (4) 預電泳結束后,關掉電源;用移液槍向第一個點樣孔中加入一個2ill的MarkerD 作為參照物,然后依次往后加入2yl的PCR產物;Mix沒有顏色的話PCR產物還要與溴酚 藍指示劑混合后再點入點樣孔; (5) 點好樣后,接通電源,250V,70mA正式電泳約2小時;意觀察條帶跑到距離底部約 lcm處停止電泳。
4. 根據權利要求1或2或3所述的仿刺參種質鑒定方法,其特征在于,步驟⑶中:聚 丙烯酰胺凝膠電泳后膠板的銀染顯色方法如下:電泳結束后,將膠板取下,用小刀沿膠板的 一角輕輕撬開,然后用去離子水輕輕的沖洗膠面,沖洗好后將膠板膠面朝上放入配好的銀 染液當中,避光染色;染色過程中每隔兩三分鐘要輕輕的晃動銀染液,使銀染液與膠體充分 接觸,染色均勻;染色10 - 15min后取出膠板;用去離子水再次將染色后的膠體沖洗干凈, 然后放入染色液中輕輕晃動進行染色;當出現清晰的條帶后立即取出膠板,用去離子水輕 輕沖洗一下膠板,再用衛生紙把膠板背面擦拭干凈,拿到掃描儀中掃描并拍照。
【文檔編號】C12Q1/68GK104404166SQ201410826860
【公開日】2015年3月11日 申請日期:2014年12月25日 優先權日:2014年12月25日
【發明者】陳百堯, 伏光輝, 薛學坤, 安健, 張慶起, 張立祥, 董志國, 孫苗苗 申請人:連云港市海洋與水產科學研究所, 連云港贛榆佳信水產開發有限公司, 連云港帥森海水養殖專業合作社, 淮海工學院